水稻氮代謝基因的核苷酸多樣性及其與產(chǎn)量性狀的關(guān)聯(lián)分析.pdf

1、分類(lèi)號(hào)華中農(nóng)業(yè)大學(xué)博士學(xué)位論文水稻氮代謝基因的核昔酸多樣性及其與產(chǎn)量性狀的關(guān)聯(lián)分析Nucleotidediversityofnitrogenmetabolismgenesanditsassoeiationwithyield一relatedtraitsinriee博士研究生:丁澤紅指導(dǎo)教師:余四斌教授指導(dǎo)小組:余四斌教授牟同敏教授曾漢來(lái)教授何予卿教授崔克輝教授專(zhuān)業(yè):作物生物技術(shù)獲得學(xué)位名稱(chēng):農(nóng)學(xué)博士研究方向:水稻分子生物學(xué)獲得學(xué)位時(shí)間:2

2、011年6月華中農(nóng)業(yè)大學(xué)植物科學(xué)技術(shù)學(xué)院二O一一年六月華中農(nóng)業(yè)少、學(xué)2011屁博U十究生學(xué)位論文1.6.1核心種質(zhì)概念的提出........................................................................……221.6.2核心種質(zhì)的特點(diǎn)_.…，…、.，.…、..……，._……，............……，.……，、..…，.…，.，，.…，221.6.3水稻核心種質(zhì)研究進(jìn)

3、展.....……、.................................................……，.……231.7單核普酸多樣性與選擇、進(jìn)化....................................................……，........……241.7.1單核營(yíng)酸多樣性概述.........................................................

4、................……241.7.2DNA鋇l序技術(shù)的發(fā)展.........................................................................……251.72.1Sanger法測(cè)序..……，..…，甲................……，..............……，........……，.…251.7，2.2Roche公司454測(cè)序技術(shù)..........

5、...............................................……261.7.2.3llumina公司Solexa測(cè)序技術(shù)二，二，…，...……，…，，.......................……271.7.2.4ABI公司SOLID測(cè)序技術(shù).......................................................……281.7.2.5HehcoS公司單分子測(cè)序技

6、術(shù)....................................……，........……291.7.2.6PacificBiosciences公司單分子實(shí)時(shí)測(cè)序技術(shù)................……，.……30L7.2.7OxfdNanope公司納米孔單分子測(cè)序技術(shù).......................……301.7.3檢測(cè)選擇作用的一般方法.....................................

7、............................……311.7.3.1基于種內(nèi)多態(tài)性的中性檢測(cè)...................................................……311.7.3.1.1Tajima’sD檢驗(yàn)................................................................……311.7.3.12Fu和Li的D和F檢驗(yàn)......…

8、…甲...................................……321，7.3.1.3Fay和Wu的H檢驗(yàn).......................................................……321.7.3.2基于種間多態(tài)性的中性檢驗(yàn).......……，...................................……，.321.7.3.2.1McD0nald和Kreitman(MK)檢

9、驗(yàn)..............……，.........……321.7.3.2.2Hudson一Kreitman一Aquade(HKA)檢驗(yàn)..............……，..……331.7.3.2.3K留KS檢驗(yàn)......................................................................……331.7.3.3基于單倍型比較的檢驗(yàn)方法....................

10、...............................……331.7.3.3.1LongRangeHaplotypes(LRH)檢驗(yàn)...........................……341.7.3.3，2iHHSce(iHS)檢驗(yàn)...................................................……341.7.3.3.3LinkageDisequilibrinmDecay(LDD)檢驗(yàn)

11、.................……341.74一些受到選擇作用的基因......……，....................................................……341.8植物關(guān)聯(lián)分析研究進(jìn)展..........……，............................……，..........................……361.8.1連鎖不平衡(LD)的度量及其影響因素.........