熒光假單胞菌的分離、鑒定及遺傳多樣性研究.pdf_第1頁(yè)
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1、本研究以分離自上海周邊地區(qū)12種植物根際的104株熒光假單胞菌為研究對(duì)象,進(jìn)行了表型分類(lèi),并采用16SrDNA-RFLP和REP-PCR技術(shù),系統(tǒng)地研究了熒光假單胞菌的遺傳多樣性。 16SrDNAPCR-RFLP和REP-PCR分析揭示了熒光假單胞菌存在高度的遺傳多樣性。16SrDNAPCR-RFLP分析表明熒光假單胞菌存在17種遺傳型,50﹪為遺傳型1,在所用的5種限制性?xún)?nèi)切酶中,HaeⅢ和HinfⅠ切割的帶譜最豐富,是反映熒

2、光假單胞菌16SrDNA序列差異性最有效的限制性?xún)?nèi)切酶。聚類(lèi)分析樹(shù)狀圖揭示了菌株之間更大的遺傳差異及菌株的特異性。16SrDNAPCR-RFLP酶切圖譜聚類(lèi)分析在85﹪相似性水平上,可將供試菌株劃分為9群;REP-PCR指紋圖譜聚類(lèi)分析在76﹪相似性水平上,可將供試菌株劃分為26群。REP-PCR指紋分析的分群結(jié)果更分散,16SrDNAPCR-RFLP聚在同一群內(nèi)的菌株大多分布于幾個(gè)不同的REP-PCR群內(nèi),揭示了供試菌株具有極大的遺傳

3、多樣性,同時(shí)也說(shuō)明,REP-PCR指紋圖譜分析適合于熒光假單胞菌種內(nèi)遺傳多樣性研究。根據(jù)16SrDNAPCR-RFLP酶切圖譜和REP-PCR指紋圖譜的相似性進(jìn)行的聚類(lèi)分析結(jié)果與菌株的分離地和寄主相關(guān),即分離自同一地點(diǎn)或同一種寄主的菌株聚為一群,表明了環(huán)境條件對(duì)熒光假單胞菌的發(fā)育和遺傳分化有影響。此外,同一種寄主植物甚至相同地域來(lái)源的一些熒光假單胞菌具有較大的遺傳型多樣性,證明了上海周邊地區(qū)的熒光假單胞菌具有極大的遺傳及系統(tǒng)發(fā)育多樣性。

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