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文檔簡介
1、本研究以分離自上海周邊地區(qū)12種植物根際的104株熒光假單胞菌為研究對象,進行了表型分類,并采用16SrDNA-RFLP和REP-PCR技術(shù),系統(tǒng)地研究了熒光假單胞菌的遺傳多樣性。 16SrDNAPCR-RFLP和REP-PCR分析揭示了熒光假單胞菌存在高度的遺傳多樣性。16SrDNAPCR-RFLP分析表明熒光假單胞菌存在17種遺傳型,50﹪為遺傳型1,在所用的5種限制性內(nèi)切酶中,HaeⅢ和HinfⅠ切割的帶譜最豐富,是反映熒
2、光假單胞菌16SrDNA序列差異性最有效的限制性內(nèi)切酶。聚類分析樹狀圖揭示了菌株之間更大的遺傳差異及菌株的特異性。16SrDNAPCR-RFLP酶切圖譜聚類分析在85﹪相似性水平上,可將供試菌株劃分為9群;REP-PCR指紋圖譜聚類分析在76﹪相似性水平上,可將供試菌株劃分為26群。REP-PCR指紋分析的分群結(jié)果更分散,16SrDNAPCR-RFLP聚在同一群內(nèi)的菌株大多分布于幾個不同的REP-PCR群內(nèi),揭示了供試菌株具有極大的遺傳
3、多樣性,同時也說明,REP-PCR指紋圖譜分析適合于熒光假單胞菌種內(nèi)遺傳多樣性研究。根據(jù)16SrDNAPCR-RFLP酶切圖譜和REP-PCR指紋圖譜的相似性進行的聚類分析結(jié)果與菌株的分離地和寄主相關(guān),即分離自同一地點或同一種寄主的菌株聚為一群,表明了環(huán)境條件對熒光假單胞菌的發(fā)育和遺傳分化有影響。此外,同一種寄主植物甚至相同地域來源的一些熒光假單胞菌具有較大的遺傳型多樣性,證明了上海周邊地區(qū)的熒光假單胞菌具有極大的遺傳及系統(tǒng)發(fā)育多樣性。
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