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文檔簡(jiǎn)介
1、本文主要敘述藥用植物天南星中有效成分的虛擬篩選和計(jì)算藥理學(xué)研究。本實(shí)驗(yàn)分為四個(gè)部分:第一部分是天南星中所含化合物分子與心血管疾病相關(guān)靶標(biāo)的對(duì)接和有效成分的篩選;第二部分是將篩選出的有效成分分子在AutoDock中進(jìn)行精細(xì)對(duì)接,獲得化合物分子與靶標(biāo)相互作用的詳細(xì)信息;第三部分是對(duì)篩選出的分子的母體結(jié)構(gòu)黃酮類化合物的抗氧化機(jī)理進(jìn)行研究;第四部分是對(duì)靶標(biāo)蛋白的進(jìn)化蹤跡分析。
通過查找文獻(xiàn)資料和相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù),收集到了天南星科植物中已
2、分離出的149種化合物。將這些化合物與24個(gè)心血管疾病相關(guān)靶標(biāo)在Cerius2軟件中進(jìn)行對(duì)接研究,通過對(duì)接得分和配體得分進(jìn)行具體評(píng)價(jià),篩選出6個(gè)得分較高的小分子,分別是夏佛托苷、異夏佛托苷、芹菜素-6-C-阿拉伯糖-8-C-半乳糖昔、芹菜素-6-C-半乳糖-8-C-阿拉伯糖苷、芹菜素-6,8-二-C-吡喃葡萄糖苷、芹菜素-6,8-二-C-半乳糖苷,這些分子的共同特征是具有黃酮類化合物母體結(jié)構(gòu),他們可能是天南星治療心血管疾病的有效成分。<
3、br> 接著在AutoDock軟件中以靶標(biāo)蛋白質(zhì)1HW8和異夏佛托苷分子、靶標(biāo)蛋白質(zhì)3CFW和夏佛托苷分子兩對(duì)受體和配體為研究對(duì)象,進(jìn)行精細(xì)對(duì)接。目的是要獲得更精確和詳細(xì)的對(duì)接信息,研究天南星中所含活性小分子與心血管疾病相關(guān)靶標(biāo)的相互作用,揭示藥用植物天南星的藥理作用機(jī)理。
之后在MS軟件的Dmol3模塊下以夏佛托苷分子為研究對(duì)象,對(duì)母體結(jié)構(gòu)黃酮類化合物的結(jié)構(gòu)參數(shù)和氫原子轉(zhuǎn)移機(jī)理的過渡態(tài)進(jìn)行計(jì)算,從能量、電荷分布、鍵
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