細胞因子-受體相互作用的預測.pdf

1、細胞因子是由多種細胞所分泌的低分子量(15～30KD)的蛋白或糖蛋白，通過與相應受體的結合，調(diào)節(jié)細胞的生長和分化，參與免疫、炎癥反應和創(chuàng)傷愈合。因為細胞因子通過與受體的相互作用來行使以上功能，所以細胞因子-受體相互作用成為研究細胞因子功能的關鍵。然而，由于細胞因子以網(wǎng)絡形式行使生物功能，眾多細胞因子在機體內(nèi)相互促進或相互抑制。這一特性使我們對細胞因子的新功能和新細胞因子受體的存在所知甚少，又因為傳統(tǒng)實驗方法費用高，耗時長，所以應用計用算

2、方法系統(tǒng)研究細胞因子-受體相互作用，以揭示細胞因子的新功能、新受體十分必要。本課題首先建立基于支持向量機的分類模型，用來從人類蛋白組中預測新的細胞因子-受體相互作用，最終得到1609個新相互作用，由244個新受體和所有112個已知受體參與。通過改進訓練方法，該模型與常規(guī)支持向量機方法訓練的模型相比有較高的準確性(99.2％)。進一步分析顯示，各家族的細胞因子受體趨向于享有共同的序列模式(Domains/Motifs)，以便保證與細胞因子