基于SVM的蛋白質(zhì)相互作用位點(diǎn)的預(yù)測(cè)研究.pdf

1、預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)相互作用的位點(diǎn)在理論和實(shí)踐上都具有重要的意義。蛋白質(zhì)間的相互作用在許多生物過程中扮演著重要的角色，例如，免疫反應(yīng)、酶的催化、信號(hào)傳導(dǎo)等。理解一個(gè)蛋白質(zhì)的生物功能的一個(gè)重要環(huán)節(jié)就是識(shí)別與其相互作用的蛋白質(zhì)或者配體。蛋白質(zhì)相互作用位點(diǎn)的預(yù)測(cè)對(duì)于突變?cè)O(shè)計(jì)和蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)的重構(gòu)都是至關(guān)重要的。蛋白質(zhì)科學(xué)的重要目標(biāo)之一是理解蛋白質(zhì)相互作用的機(jī)制和預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)表面的相互作用位點(diǎn)。 由于實(shí)驗(yàn)確定的蛋白質(zhì)化合物及蛋白質(zhì)配體化合物的結(jié)

2、構(gòu)依然相當(dāng)少，而且生物學(xué)實(shí)驗(yàn)的方法過于費(fèi)時(shí)費(fèi)力，所以預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)相互作用位點(diǎn)的計(jì)算方法就日益重要起來。特別是近年來，許多具有優(yōu)良性能的智能算法的提出，使得計(jì)算方法預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)相互作用位點(diǎn)的工作取得了很大的進(jìn)展。 在生物信息學(xué)中，支持向量機(jī)已經(jīng)成為解決模式識(shí)別問題的重要工具。在本文中，我們首先對(duì)蛋白質(zhì)相互作用位點(diǎn)預(yù)測(cè)的發(fā)展歷程進(jìn)行了回顧；并對(duì)支持向量機(jī)及其在生物信息中的應(yīng)用作了簡單的介紹；最后，針對(duì)現(xiàn)有的低效率預(yù)測(cè)問題，我們提出了一種