浙江揚(yáng)子鱷遷地保護(hù)種群的譜系構(gòu)建和放歸野外奠基種群的篩選.pdf

1、揚(yáng)子鱷是23種鱷類最為瀕危和受到的生存威脅最大的物種。目前圈養(yǎng)種群發(fā)展很快，但揚(yáng)子鱷部分圈養(yǎng)種群質(zhì)量出現(xiàn)下降，主要原因是其遺傳多樣性的丟失所致，從而導(dǎo)致其對環(huán)境適應(yīng)能力的下降以及自身免疫能力的低下，進(jìn)而對種群后期管理和進(jìn)一步發(fā)展帶來隱患。如何對圈養(yǎng)種群進(jìn)行有效管理，避免其質(zhì)量進(jìn)一步下降進(jìn)而危險(xiǎn)揚(yáng)子鱷種群發(fā)展？這是本研究所關(guān)注的。
　　 30多年來，浙江長興揚(yáng)子鱷自然保護(hù)區(qū)的揚(yáng)子鱷種群，采用人工半放養(yǎng)進(jìn)行管理，才得以在保持野生繁殖

2、方式的條件下能夠穩(wěn)步的發(fā)展而未出現(xiàn)種群衰退這一災(zāi)難性問題。但由于浙江揚(yáng)子鱷保護(hù)種群僅具有年度的繁殖記錄而缺乏種群的管理譜系，挑選野外放歸的奠基種群，就必須要從“建立種群管理譜系”這一源頭工作開始。因此急需對浙江揚(yáng)子鱷遺傳管理譜系進(jìn)行構(gòu)建。由于浙江揚(yáng)子鱷保護(hù)種群是基于小群體建立起來的.除了進(jìn)行遠(yuǎn)親個(gè)體的引進(jìn)，亦要利用有效的分子標(biāo)記篩選遺傳多樣性高、抗病力和環(huán)境適應(yīng)能力強(qiáng)，且外觀形態(tài)發(fā)育正常的揚(yáng)子鱷個(gè)體。從而建立浙江揚(yáng)子鱷的野外放歸種群，并

3、實(shí)行科學(xué)的年度配對繁殖計(jì)劃。
　　 鑒于上述目的，本研究選擇了微衛(wèi)星標(biāo)記和MHC標(biāo)記對該種群進(jìn)行研究。
　　 主要結(jié)果如下：
　　 1)利用14個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)，首次建立了浙江長興揚(yáng)子鱷自然保護(hù)區(qū)揚(yáng)子鱷的遺傳管理譜系，并對其遺傳多樣性進(jìn)行了群體分析，發(fā)現(xiàn)種群遺傳多樣性水平較低。與此同時(shí)，通過家系分析，發(fā)現(xiàn)：
　　 1同一窩幼鱷只有1個(gè)父本所占的比率約為46.15％；
　　 2同一窩幼鱷具有2個(gè)父本所占

4、的比率約為23.08％；
　　 3同一窩幼鱷具有3個(gè)父本所占的比率約為30.77％。
　　 4在一窩多父本的案例中，每一父本所有的子代幼鱷的數(shù)量各不相同。少者，只有3條子代幼鱷；多者，擁有多達(dá)30條的子代幼鱷。
　　 5在只有單個(gè)父本的案例中，每窩所產(chǎn)的子代幼鱷的數(shù)量也不盡相同。多者，擁有多達(dá)33條的子代幼鱷；少者，只有6條子代幼鱷。
　　 6每窩具有多個(gè)父本的子代幼鱷數(shù)顯著的高于每窩僅有單個(gè)父本的子代幼

5、鱷數(shù)。前者平均為21.57條，后者平均為15.83條。
　　 2)14個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)的累計(jì)個(gè)體識別率達(dá)到100％，是開展揚(yáng)子鱷個(gè)體鑒別的有效分子標(biāo)記。
　　 3)利用實(shí)驗(yàn)室開發(fā)的MHC位點(diǎn)分離(HURRAH)方法，結(jié)合MHC BAC文庫及其測序結(jié)果，分離得到17個(gè)MHCⅠ類位點(diǎn)和13個(gè)MHCⅡ類位點(diǎn)。并最終篩選出2個(gè)MHCⅠ類和1個(gè)MHCⅡ類多態(tài)性位點(diǎn)進(jìn)行群體分析。
　　 4)3個(gè)多態(tài)性MHC位點(diǎn)對親本群體進(jìn)行檢測

6、獲得6個(gè)等位基因，平均每個(gè)位點(diǎn)為2個(gè)等位基因。每個(gè)位點(diǎn)實(shí)際檢測得到的等位基因均為2個(gè)，各位點(diǎn)等位基因豐度(AR)在1.055-1.713之間，平均等位基因豐度為1.457。等位基因豐度最高的位點(diǎn)是Ⅸ17E2，最低的位點(diǎn)是Beta16。各位點(diǎn)的觀察雜合度(Ho)界于0.037-0.504之間，其期望雜合度(He)界于0.036-0.475之間。三個(gè)位點(diǎn)觀察雜合度均高于其期望，Ⅸ17E2差值最大。3個(gè)位點(diǎn)多態(tài)信息含量界于0.036-0.36

7、1之間，平均多態(tài)信息含量(PIC)在0.239。各位點(diǎn)多態(tài)信息含量均低于0.5。MHC位點(diǎn)遺傳多樣性結(jié)果亦表明該種群遺傳多樣性水平不足。
　　 5)MHC位點(diǎn)和微衛(wèi)星DNA位點(diǎn)數(shù)據(jù)均表現(xiàn)為：子代種群基因型分布以及基因頻率相對親代種群更為平均和接近期望值。表明安徽宣城引入的種群已經(jīng)參與到長興種群的繁育之中，而且兩個(gè)群體間已經(jīng)有揚(yáng)子鱷互相選擇交配并產(chǎn)生后代。
　　 6)本研究首次建立了浙江揚(yáng)子鱷種群的遺傳管理譜系以及首次運(yùn)用