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1、目的:勘探海南東寨港真紅樹植物內(nèi)生放線菌多樣性,為發(fā)現(xiàn)放線菌新物種和新抗生素奠定基礎(chǔ)。
方法:樣品經(jīng)表面消毒后粉碎,用10種不同培養(yǎng)基分離放線菌;通過PCR擴增、測定并比對16S rRNA基因序列,開展放線菌多樣性分析;通過發(fā)酵、萃取等處理方法得到四類樣品,包括發(fā)酵原液、乙酸乙酯提取液及水層和菌體的丙酮浸泡提取液;采用紙片擴散法對樣品進行抗菌活性篩選;基于PCR的基因篩選技術(shù)探測活性菌株可能存在的NRPS、PKSⅠ、PKSⅡ抗
2、生素生物合成基因。
結(jié)果:經(jīng)形態(tài)特征排重,從14種真紅樹植物樣品中共得到放線菌146株,16S rRNA基因序列比對表明它們分布于13個科18個屬,其中鏈霉菌屬為優(yōu)勢菌屬,菌株S3Cf-2和S3Af-1的16S rRNA基因序列分別與有效發(fā)表菌株CouchioplanescaeruleusDSM44103T(X93202)和Microlunatus terrae BS6T(JF806519)的相似率最高,分別為97.45%和9
3、7.43%。菌株S3Af-1已由本課題組庹利博士完成多相分類工作,證實菌株為丙酸桿菌科小月菌屬的新種,命名為Microlunatus endophyticus,并撰文發(fā)表在IJSEM(International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology)。菌株S3Cf-2相關(guān)多相分類學(xué)研究工作已由本實驗室劉少偉博士完成,文章正在撰寫中。對其中46株放線菌發(fā)酵樣品的抗菌活性檢測
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