CPA1、PRSS1基因突變檢測及其與慢性胰腺炎相關(guān)性研究.pdf

1、慢性胰腺炎（chronic pancreatitis，CP）是一種胰腺實(shí)質(zhì)性病變，最終可致胰腺內(nèi)外分泌功能不全。我國CP發(fā)病率較低，但近年來有明顯上升的趨勢，因此明確CP發(fā)病機(jī)制將有助于對其進(jìn)行早期診斷及治療。如今醫(yī)學(xué)、分子生物學(xué)和生物信息學(xué)等交叉學(xué)科不斷在發(fā)展，已有研究證實(shí)CP是由于環(huán)境因素和遺傳因素聯(lián)合作用所致。本研究包括兩部分內(nèi)容，分別探討了四川地區(qū)漢族人群慢性胰腺炎CPA1和PRSS1基因突變情況以及CPA1和PRSS1基因與慢

2、性胰腺炎的相關(guān)性。
　　本研究在中國四川地區(qū)漢族人群中篩查CPA1和PRSS1基因突變，并篩選CPA1和PRSS1基因上標(biāo)簽SNPs位點(diǎn)，以探索CPA1和PRSS1基因與中國四川地區(qū)漢族人群CP發(fā)病的相關(guān)性。
　　運(yùn)用Sanger直接測序法進(jìn)行CPA1和PRSS1基因全部外顯子區(qū)域目的片段的測序。將測序結(jié)果通過 UCSC數(shù)據(jù)庫進(jìn)行在線比對并核準(zhǔn)，同時將正常對照組的結(jié)果進(jìn)行同步比對以明確突變的性質(zhì)（SNP或新發(fā)現(xiàn)的突變），并通

3、過SIFT網(wǎng)站預(yù)測突變位點(diǎn)的性質(zhì)，通過千人基因組計劃數(shù)據(jù)庫查詢突變位點(diǎn)是否為新發(fā)現(xiàn)突變。同時通過Haploview軟件挑選CPA1和 PRSS1基因上連鎖不平衡區(qū)域的標(biāo)簽SNP，并用單堿基延伸法（SNaPshot）對上述位點(diǎn)基因型進(jìn)行檢測，再通過 SPSS軟件分析其與CP的相關(guān)性。
　　本研究在192例CP患者中，共發(fā)現(xiàn)CPA1和PRSS1基因突變7例，總突變率3.6％。其中發(fā)現(xiàn)3例CPA1基因突變（1.6%，3/192），突變分

4、別為c.281A>G、c.370A>G和c.1074C>T，4例PRSS1基因突變（2.1%，4/192），突變分別為c.44C>T、c.182C>T、c.365G>A和c.486T>C。有1例CP患者同時發(fā)生CPA1和PRSS1基因突變（0.5%，1/192），上述突變在正常對照組中均未發(fā)現(xiàn)。另外在CP組和對照組中均檢測到已報道的 SNPs位點(diǎn)，分別是位于 CPA1基因上的 rs537519042、rs1126899、rs559471

5、767、rs782588903和 rs34875501，位于 PRSS1基因上的 rs745538166和rs376671702。CPA1和PRSS1基因所選5處位點(diǎn)（rs7811409、rs7790688、rs11560388、rs741487和rs6667）基因分型結(jié)果均符合Hardy-Weinberg遺傳平衡檢驗(yàn)（P>0.05）；rs11560388位點(diǎn)AA基因型頻率在病例組和對照組中分別為8.9%、4.2%，風(fēng)險等位基因 A等位

6、基因頻率分別為25.3%、17.3%，病例組均高于對照組（P<0.05）；rs741487位點(diǎn)GG基因型頻率在病例組和對照組中分別為31.8%、24.6%，風(fēng)險等位基因 G等位基因頻率分別為55.5%、46.5%，病例組均高于對照組（P<0.05）；rs7811409、rs7790688和rs6667位點(diǎn)等位基因及基因型在兩組中比較差異均無統(tǒng)計學(xué)意義（P>0.05）；進(jìn)一步遺傳模型分析結(jié)果顯示，rs11560388位點(diǎn)在顯性模型[(AG

7、+AA) vs GG]和隱性模型[AA vs(AG+GG)]下病例組的患病風(fēng)險分別是對照組的1.63倍、2.23倍；rs741487位點(diǎn)在顯性模型[(CG+GG) vs CC]中病例組的患病風(fēng)險是對照組的1.76倍，在隱性模型中兩組分布差異無統(tǒng)計學(xué)意義。rs7811409、rs7790688及rs6667在兩組中遺傳模型分布差異均無統(tǒng)計學(xué)意義（P>0.05）。
　　首次在中國四川地區(qū)漢族人群中發(fā)現(xiàn) CPA1和 PRSS1基因突變，