BAM8-22的NMR溶液結(jié)構(gòu)測(cè)定與BAM8-22及其片段肽的分子動(dòng)力學(xué)研究.pdf

1、目的:對(duì)牛腎上腺髓質(zhì)肽8-22(BAM8-22:Val-Gly-Arg-Pro-Glu-Trp-Trp-Met-Asp-Tyr-Gln-Lys-Arg-Tyr-Gly)進(jìn)行首次空間結(jié)構(gòu)的研究,并進(jìn)一步結(jié)合已有的生物活性數(shù)據(jù)從三維結(jié)構(gòu)水平上分析BAM8-22及其一系列片段肽的構(gòu)效關(guān)系。
　　 方法:首先通過(guò)二維核磁共振技術(shù)測(cè)定了BAM8-22在水溶液中的空間三維構(gòu)象,然后再通過(guò)20 ns的水中分子動(dòng)力學(xué)模擬補(bǔ)充觀察BAMS-22的

2、動(dòng)力學(xué)特征；接著,在BAM8-22核磁結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上,對(duì)其片段肽BAM13-22,BAM15-22,BAM8-18,BAM8-20分別進(jìn)行20 ns的水中分子動(dòng)力學(xué)模擬,分析觀察它們的結(jié)構(gòu)變化與穩(wěn)定性。結(jié)果:水溶液中的BAM8-22在肽段BAM12-20是一個(gè)相對(duì)穩(wěn)定的α-螺旋結(jié)構(gòu),兩端氨基酸殘基是一個(gè)比較柔性的構(gòu)象；而其片段肽BAM13-22的α-螺旋大約穩(wěn)定在BAM15-20；BAM15-22的α-螺旋完全消失；BAM8-18的α-螺

3、旋大約穩(wěn)定在BAM12-16；BAM8-20的α-螺旋大約穩(wěn)定在BAM12-18。結(jié)論:通過(guò)得到的BAM8-22的溶液三維結(jié)構(gòu)與動(dòng)力學(xué)特征及其片段肽的空間構(gòu)象的變化信息,再結(jié)合已有的功能活性數(shù)據(jù)進(jìn)行構(gòu)效關(guān)系分析發(fā)現(xiàn)BAM12-20位的α-螺旋對(duì)維持BAM8-22的生物活性是非常必需的。所有這些結(jié)構(gòu)研究,不僅能夠指導(dǎo)合理改造BAM8-22,進(jìn)而設(shè)計(jì)活性更好的類似物,同時(shí)也能給進(jìn)一步研究BAM8-22與Mrg受體的相互作用機(jī)制提供結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。