抗原肽與TAP膜蛋白分子相互作用的分子動力學(xué)研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、人的抗原加工相關(guān)轉(zhuǎn)運(yùn)體（Transporter associated with antigen processing，TAP）是一種異源二聚的ABC轉(zhuǎn)運(yùn)復(fù)合體，負(fù)責(zé)篩選由蛋白酶體水解生成的內(nèi)源性抗原肽片段，并跨過內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜將其從胞漿中轉(zhuǎn)運(yùn)至內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔中，然后抗原肽得以同MHCI分子結(jié)合，繼而被呈遞至細(xì)胞表面，供免疫細(xì)胞識別，繼而引發(fā)免疫反應(yīng)。伴隨人們對于TAP基因的解碼以及對TAP分子在免疫應(yīng)答中所起作用的認(rèn)知，有關(guān)TAP分子同疾病關(guān)聯(lián)也得

2、到了進(jìn)一步的深入研究。近年來越來越多的研究證實TAP分子與多種慢性感染疾病、自身免疫疾病等密切相關(guān)。然而，在當(dāng)前缺乏高分辨率全長TAP的3D結(jié)構(gòu)解析，TAP分子的結(jié)構(gòu)和功能、抗原肽的轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制仍不清楚。
　　這里，我們基于同源建模方法，使用了Pgp-based-TAP-model2模型，然后利用拉伸分子動力學(xué)的方法來模擬抗原轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制，并獲得轉(zhuǎn)運(yùn)過程中膜蛋白TAP分子和抗原肽相互作用的各個結(jié)構(gòu)。通過分析轉(zhuǎn)運(yùn)過程體系的構(gòu)象變化，找出TA

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