基于支持向量機(jī)的含平面?zhèn)谓Y(jié)的RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè).pdf

1、隨著人類基因組計(jì)劃實(shí)施的不斷深入，生物學(xué)的數(shù)據(jù)信息飛速增長(zhǎng)，如何從這些海量數(shù)據(jù)中提取有用的知識(shí)，揭示這些數(shù)據(jù)所蘊(yùn)含的生物學(xué)意義，是對(duì)計(jì)算機(jī)科學(xué)的巨大挑戰(zhàn)。從結(jié)構(gòu)上來挖掘生物分子在生命過程中的作用，首先要解決的問題就是結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)。偽結(jié)是 RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)中最難預(yù)測(cè)的一種，目前的算法主要是對(duì)平面?zhèn)谓Y(jié)進(jìn)行預(yù)測(cè)。平面?zhèn)谓Y(jié)對(duì)RNA功能的實(shí)現(xiàn)起著關(guān)鍵的作用，對(duì)含平面?zhèn)谓Y(jié)的RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)的研究具有重要的現(xiàn)實(shí)意義。
　　首先，本文針對(duì)RNA堿基的

2、預(yù)測(cè)分類問題進(jìn)行研究，給出了基于FDAGSVM的對(duì)RNA堿基進(jìn)行預(yù)測(cè)分類的算法。RNA堿基的準(zhǔn)確分類是正確預(yù)測(cè)其二級(jí)結(jié)構(gòu)的前提，該算法對(duì)決策結(jié)果進(jìn)行了模糊化處理，以計(jì)算模糊隸屬度代替取符號(hào)運(yùn)算，并依據(jù)模糊隸屬度的值決定樣本在決策有向無(wú)環(huán)圖中的路徑。
　　其次，針對(duì)利用E-NSSEL標(biāo)識(shí)序列恢復(fù)RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)過程中堿基的編碼問題，本文提出了一種把 RNA序列中可能配對(duì)的兩個(gè)堿基看作為一個(gè)整體進(jìn)行編碼的方法。先將一個(gè)堿基的局部環(huán)境模式