中國水域江豚和中華白海豚的保護遺傳學研究.pdf

1、江豚(Neophocaena phocaenoides)和印度太平洋駝背豚又稱中華白海豚(Sousa chinensis)是廣泛分布在印度太平洋熱帶、亞熱帶及溫帶水域的兩種小型鯨類。中國水域的江豚分為3個種群(或生態(tài)/形態(tài)型)：黃海種群，南海種群和淡水長江種群(長江江豚被IUCN紅色名錄列為瀕危級)，但是這一劃分受到近年來的研究的質(zhì)疑。中華白海豚分布在印度洋及西太平洋的熱帶、亞熱帶的沿岸海域，其中東臺灣海峽亞種群被IUCN紅色名錄列為極

2、度瀕危級，其它種群被IUCN紅色名錄列為易受威脅級，同時該物種也被瀕危野生動物國際貿(mào)易公約列為保護對象。1988年，我國頒布《國家重點保護野生動物名錄》把中華白海豚列為國家一級保護動物。
　　 小種群比大種群更易受到遺傳漂變導致的遺傳多樣性的丟失，也更可能表現(xiàn)出相對較低的適合度而面臨瀕臨滅絕的危險。因此，急需對上述兩種鯨類開展更全面、系統(tǒng)的種群遺傳分析，評估現(xiàn)有種群的遺傳多樣性水平，評估遺傳多樣性受到自然選擇、遺傳漂變、基因流及

3、它們相互作用的影響程度。這將有助于制定避免這兩種鯨類種群繼續(xù)下降的保護管理措施，對物種的長期保護很關鍵。
　　 本文第2章介紹了從江豚中分離出的8個二堿基重復類型和9個四堿基重復類型的多態(tài)的微衛(wèi)星座位。二堿基重復微衛(wèi)星座位在30個江豚個體中檢測到的等位基因數(shù)在4～21之間，觀察雜合度在0.300～0.833之間，期望雜合度在0.437～0.932之間。四堿基重復微衛(wèi)星座位的多態(tài)性在中國黃海和南海種群共39個江豚個體進行了檢驗。每

4、個座位的等位基因數(shù)在2～11之間。觀察雜合度和期望雜合度范圍分別為0.154～0.795和0.146～0.839。這些微衛(wèi)星座位在其它鯨類中進行了跨種擴增檢驗。這些座位適合于江豚及其它鯨類的種群遺傳學研究。
　　 第3章通過利用10個微衛(wèi)星座位分析125個江豚個體探討了中國水域江豚的種群遺傳結構。與早期研究較低的mtDNA控制區(qū)遺傳多樣性分析結果相反，同其它鯨類相比，中國水域江豚具有相對較高的微衛(wèi)星遺傳變異水平(HE=0.732

5、～0.795)。貝葉斯聚類分析表明中國水域江豚分為3個明顯的遺傳簇，與早期基于形態(tài)變異和分布類型定義的3個種群或亞種是一致的。種群間遺傳分化顯著，F(xiàn)ST值在0.07～0.137之間。貝葉斯方法計算的遷移率和種群祖先分析結果表明3個種群之間甚至在種群分布重疊區(qū)沒有或僅有非常有限的基因流。這些結果強烈支持將這3個種群作為3個獨立的進化顯著單元或亞種，因此在制定保護措施時應將它們作為不同的管理單元。
　　 第4章通過114個擴增片段長

6、度多態(tài)(AFLP)標記分析棲息在完全不同的自然環(huán)境中的3個江豚種群，尋找與選擇作用相關的遺傳特征。通過3個種群間的比較，結果顯示，有4個AFLP位點其FST值大于0.975的范圍，表明它們可能受到分化選擇作用的影響；有2個AFLP位點其FST值小于0.025的范圍，有可能受到平衡選擇作用的影響。這一結果提示通過基因組掃描將有助于識別與江豚淡水適應機制相關的特異基因組區(qū)域或基因。
　　 第5章介紹了從中華白海豚中分離出的11個二堿

7、基重復類型和5個四堿基重復類型的多態(tài)的微衛(wèi)星座位。篩選到的這些微衛(wèi)星座位能夠用于種群遺傳學研究，如評估種群結構及遺傳多樣性等，這些對物種的保護是很重要的。檢測到的等位基因數(shù)在2～9之間，觀察雜合度在0.167～0.917之間，期望雜合度在0.159～0.913之間。對5個其它鯨類物種進行了跨種擴增檢驗，結果表明10～13個座位能有效擴增。
　　 第6章探討了白海豚屬的系統(tǒng)發(fā)生關系和種群遺傳學特征。分析了印度洋、太平洋和大西洋的1

8、24個白海豚個體的286bp的線粒體控制區(qū)序列。所有中國水域的白海豚個體聚為單獨的一支，并獲得較高的支持率，表明中國水域的白海豚均應屬于同一個物種。中國的白海豚并沒有和澳大利亞的白海豚聚為一支，而是和來自南非，印度的白海豚，以及S.teuszii聚為一支。這一結果表明將中國的白海豚和澳大利亞白海豚劃為一個種的提法需要修正。通過分析中國水域廈門種群和珠江口種群的65個個體的334bp的線粒體控制區(qū)序列，發(fā)現(xiàn)了6個單元型。種群內(nèi)極低的遺傳多