栓菌及其近緣屬的分子系統(tǒng)學(xué)研究.pdf

1、栓菌(Trametes)及其近緣屬菌物是多孔菌中的重要類群，廣泛分布于各種自然環(huán)境中。栓菌的一些種在制藥與環(huán)境治理等方面有重要應(yīng)用價值。目前對栓菌的分類主要建立在菌絲類型、孢子形態(tài)、腐朽類型等形態(tài)學(xué)基礎(chǔ)上，然而有些栓菌及其近緣種擁有較為相似的形態(tài)學(xué)及顯微學(xué)結(jié)構(gòu)，因此僅以形態(tài)特征作為分類依據(jù)有時并不可靠，容易造成分類上的混淆。隨著分子系統(tǒng)學(xué)的發(fā)展，核苷酸序列在系統(tǒng)演化和分類研究中提供了最直接的證據(jù)，已廣泛用于真菌分子系統(tǒng)學(xué)的研究。本研究通

2、過克隆、測序ITS序列和mt SSU rDNA基本全長序列，并結(jié)合GenBank數(shù)據(jù)庫中相關(guān)的基因序列對栓菌及其近緣屬菌物的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系進行了分析并且分別構(gòu)建了系統(tǒng)樹和生成了相關(guān)區(qū)域的二級結(jié)構(gòu)，主要結(jié)果如下：
　　(1)根據(jù)ITS序列和mt SSU rDNA序列所形成的系統(tǒng)樹具有良好的一致性，即絕大部分栓菌在系統(tǒng)樹上可以聚為一枝，紅孔菌屬與栓菌屬菌物擁有密切的親緣關(guān)系，在系統(tǒng)樹中不能與栓菌屬菌物完全分開，對兩個屬菌株二級結(jié)構(gòu)的預(yù)測

3、也表現(xiàn)出了高度的相似性。
　　(2)本研究證明雅致栓菌(Trametes elegans)是屬于栓菌屬的菌株，其與栓菌屬聚為一枝且與紅孔菌屬的關(guān)系較近。
　　(3)革孔菌屬菌物與栓菌屬菌物在以ITS序列和mt SSU rDNA序列所形成的系統(tǒng)樹上均能完全分開，其中在以前系統(tǒng)分類學(xué)中存在爭議的菌物硬毛栓菌(Coriolopsis trogii)可以與革孔菌屬菌物聚為一枝且其相關(guān)區(qū)域的二級結(jié)構(gòu)與革孔菌屬菌物相似而與栓菌屬菌物有較

4、大不同，因此本研究認為硬毛栓菌不屬于栓菌屬而屬于革孔菌屬。
　　(4)一色齒毛菌(Cerrena unicolor)與栓菌屬親緣關(guān)系較遠，其在系統(tǒng)樹中的位置能夠與栓菌屬菌物完全分開。相關(guān)區(qū)域二級結(jié)構(gòu)的預(yù)測也顯示其與栓菌屬相差甚遠，因此本研究認為Cerrena unicolor不適合作為栓菌群菌物的代表種。
　　(5)對ITS-1及ITS-2區(qū)二級結(jié)構(gòu)的預(yù)測展現(xiàn)出了與系統(tǒng)樹分析結(jié)果良好的一致性，ITS區(qū)序列堿基構(gòu)成的變化可能并

5、不對二級結(jié)構(gòu)的變化產(chǎn)生重大影響，利用這一特點可以將一些序列變化較快從而造成序列對位排列困難的菌株進行二級結(jié)構(gòu)預(yù)測來解決它們的系統(tǒng)發(fā)育問題，對能夠正確進行序列對位排列的菌株來說，ITS二級結(jié)構(gòu)的預(yù)測也對解決菌物的系統(tǒng)發(fā)育問題起到了良好的輔助作用。
　　(6)本研究證明mt SSU rDNA的基本全長序列可以很好的解決栓菌及其近緣屬菌物的系統(tǒng)發(fā)育問題，該序列較長且具有保守區(qū)與可變區(qū)，擁有豐富的生物信息學(xué)位點，可以很好的解決菌物屬間和屬