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文檔簡(jiǎn)介
1、基因表達(dá)受各種綜合因素的調(diào)控,它是一個(gè)高度復(fù)雜的過(guò)程.在生物的發(fā)育和生長(zhǎng)過(guò)程中,基因在擁有相同DNA序列的狀態(tài)下,表達(dá)水平卻完全不同.生物的遺傳信息不是僅由DNA決定的,而是與同樣承載著遺傳物質(zhì)的表觀遺傳共同決定的.表觀遺傳是基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制中的重要內(nèi)容,針對(duì)組蛋白修飾這種主要的表觀遺傳調(diào)控方式已經(jīng)開(kāi)展了大量的研究工作.基于組蛋白修飾對(duì)基因表達(dá)的調(diào)控作用,本文研究了人類H1細(xì)胞系的基因表達(dá)水平與組蛋白修飾的關(guān)系.
首先,我們分
2、析了26種組蛋白修飾在人類全基因組中高表達(dá)基因和低表達(dá)基因的啟動(dòng)子,外顯子和內(nèi)含子區(qū)域的分布特性。結(jié)果發(fā)現(xiàn),在高表達(dá)和低表達(dá)基因的這三個(gè)功能區(qū)域,組蛋白修飾水平存在差異.H3K27me3在高表達(dá)基因的啟動(dòng)子,外顯子和內(nèi)含子三個(gè)功能區(qū)域的修飾豐度明顯都要比低表達(dá)基因豐度低,然而,H3k4me2和H3k4me3在高表達(dá)基因的各功能區(qū)域含量都明顯高于低表達(dá)基因.同時(shí),我們發(fā)現(xiàn)特定的組蛋白修飾在兩類基因的三個(gè)功能區(qū)域的含量分布不一致.所有的乙酰
3、化修飾在高表達(dá)基因的三個(gè)功能區(qū)域含量分布中,啟動(dòng)子含量最高,然而在低表達(dá)基因中卻表現(xiàn)為外顯子含量最高.
其次,我們分析了26種組蛋白修飾在人類第四條染色體的高表達(dá)和低表達(dá)基因的啟動(dòng)子,外顯子,和內(nèi)含子區(qū)域的分布特性。我們把基因啟動(dòng)子分為20個(gè)窗口,外顯子10個(gè)窗口,內(nèi)含子10個(gè)窗口.研究發(fā)現(xiàn),各組蛋白修飾在高表達(dá)基因的啟動(dòng)子,外顯子和內(nèi)含子三個(gè)功能區(qū)域的含量與低表達(dá)基因各功能區(qū)域的含量存在差異.同時(shí),我們也發(fā)現(xiàn)特定的組蛋白修飾
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