一步一步教你使用ncbi數(shù)據(jù)庫(kù)資源

1、一步一步教你使用NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)資源隨著ncbi數(shù)據(jù)庫(kù)各種資源的涌現(xiàn)，NCBI已經(jīng)成為科研工作者必不可少的資料查找，數(shù)據(jù)分析的工具。那么NCBI數(shù)據(jù)如何使用，新手入門(mén)一步一步教你認(rèn)識(shí)和使用NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)。一綜合數(shù)據(jù)庫(kù)NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)集美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)信息中心(NationalCenterfBiotechnologyInfmation)，即我們所熟知的NCBI是由美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院(NIH)于1988年創(chuàng)辦。創(chuàng)辦NCBI的初衷是為了給分子生物

2、學(xué)家提供一個(gè)信息儲(chǔ)存和處理的系統(tǒng)。除了建有GenBank核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)(該數(shù)據(jù)庫(kù)的數(shù)據(jù)資源來(lái)自全球幾大DNA數(shù)據(jù)庫(kù)，其中包括日本DNA數(shù)據(jù)庫(kù)DDBJ、歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室數(shù)據(jù)庫(kù)EMBL以及其它幾個(gè)知名科研機(jī)構(gòu))之外，NCBI還可以提供眾多功能強(qiáng)大的數(shù)據(jù)檢索與分析工具。目前，NCBI提供的資源有Entrez、EntrezProgrammingUtilities、MyNCBI、PubMed、PubMedCentral、EntrezGene、

3、NCBITaxonomyBrowser、BLAST、BLASTLink(BLink)、ElectronicPCR等共計(jì)36種功能，而且都可以在NCBI的主1.2新增primerBLAST分析工具2008年，NCBI新增了設(shè)計(jì)、分析PCR引物的工具——PrimerBLAST。PrimerBLAST的引物設(shè)計(jì)功能是基于NCBI現(xiàn)有的Primer3程序發(fā)展而來(lái)的，Primer3程序可以為一段DNA模板序列設(shè)計(jì)PCR引物。PrimerBLAST

4、在設(shè)計(jì)出引物之后還在某些相應(yīng)數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行BLAST搜索，因此可以得到特異性引物，擴(kuò)增出目的片段。用戶在給出DNA模板的同時(shí)還可以限定正向引物或反向引物，這樣，NCBI就只會(huì)給出另一條引物。如果用戶給出了模板DNA和兩條引物序列，PrimerBLAST就只會(huì)運(yùn)行BLAST程序，幫助用戶對(duì)引物進(jìn)行分析。用戶也可以只給出兩條引物而不給出模板序列，這時(shí)PrimerBLAST會(huì)通過(guò)BLAST程序分析出與這對(duì)引物最匹配的模板序列。PrimerBLA