生物安全導(dǎo)論 —— - 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)研究生院

1、,The Department of Ecology & Evolutionary Biology, Fudan University Bao-Rong Lu,Scientific Methodology and Scientific Paper Writing,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,盧寶榮生態(tài)與進(jìn)化生物學(xué)系主任生物多樣性與生態(tài)工程教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室學(xué)術(shù)委員會(huì)主任研究領(lǐng)域: 保護(hù)生物學(xué)，系統(tǒng)與進(jìn)化，分子生態(tài)，生物安全,主要社

2、會(huì)兼職:國(guó)際生物安全研究學(xué)會(huì)（ISBR）主席，中國(guó)國(guó)家生物安全委員會(huì)委員，中國(guó)植物學(xué)會(huì)理事，中國(guó)生物技術(shù)學(xué)會(huì)理事?lián)尉庉? Environmental Biosafety Research, Crop Research, Asian J of Plant Sciences, J Systematics & evolution,《中國(guó)科學(xué)》《生物多樣性》，《中國(guó)水稻科學(xué)》，《植物遺傳資源學(xué)報(bào)》，《復(fù)旦學(xué)報(bào)》，《云南農(nóng)業(yè)大學(xué)

3、學(xué)報(bào)》等,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,,Citation Distribution of Baorong Lu’s Publications Since 1991,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,Course designPart 1: Scientific Methodology Part 2: Scientific Paper Writing,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,Introduction: scientific research & articl

4、e writingScience & scientific methodologyGeneral procedure of scientific researchScientific question & hypothesis Design a research (project)Conduct a research (project),Part 1: Scientific Methodology,復(fù)旦大學(xué)

5、盧寶榮,Part 2: Scientific Paper Writing,Organization & format of a scientific paperTitles, authorships & AbstractsHow to write the IntroductionHow to write Materials & MethodsHow to write ResultsHow to wri

6、te DiscussionAcknowledgement & referencesHow to submit your paperThe reviewing & publishing process,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,What is the most difficult part in scientific research ?,,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,Part 1: Scientific Methodology,什

7、么是科學(xué)研究？What is scientific Research?,英文Research是什么意思？Re Search（不斷尋找）尋找什么？？,,,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,,科學(xué)假設(shè)的結(jié)果？,尋找答案（結(jié)果）？,科學(xué)問(wèn)題 → 假設(shè)的結(jié)果？,,,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,科學(xué)問(wèn)題!,A simple & effective way of scientific research,How ?Which way ? The hyp

8、othesis driven approach,,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,,Six steps: research process in fundamental sciences,3. Create hypotheses,4. Test hypotheses,6. Evaluate theories,5. Generate theories,2. Obtain facts,1. Select projects (questions),,,,,

9、,,,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,A hypothesis driven approach of scientific research:,-Conclusion-Finding -Theory,Scientific question,Hypothesis,Proof(design & conduct Experiment),,,,,Analysis,,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,Formulate a scientific ques

10、tion,(A) Types of scientific questions：What? – the nature of objectivesHow? – the state & movement of objectivesWhy? – the mechanisms of the state & movement of objectives,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,Considerations when propose

11、scientific questions:,Scientificity（科學(xué)性）Values（重要性）Feasibility （可驗(yàn)證性）Lead to new questions（豐富性）Innovativeness（創(chuàng)新性）Relevant to scientific &/or social values（理論價(jià)值）（經(jīng)濟(jì)價(jià)值）,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,Scientific questions should be:,Si

12、mpleClear (not equivocal)Possible to validate (or test),復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,A hypothesis driven approach of scientific research:,-Conclusion-Finding -Theory,Scientific question,Hypothesis,Proof(design & conduct Experim

13、ent),,,,,Analysis,,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,A statement of expected resultsA possible response (prediction) to the research question"hypothesis" & "theory" are often used as synonym in informal usageA hypothes

14、is is untested theory,Formulate a scientific hypothesis,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,Considerations when propose scientific hypotheses:,Testable (at your capacity)Powerful (explain more facts)Highly predictable (mature)Accurat

15、eLogically simpleNo pre-set conditions,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,,A hypothesis driven approach of scientific research:,-Conclusion-Finding -Theory,Scientific question,Hypothesis,Proof(design & conduct Experiment),,,,,Analysi

16、s,,,,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,A well-down research work-plan:,Title of the experimentRational & Objectives (references)Main research contents & activities (Core)Technical details (Core)Time frame (deadlines) Expected output

17、sBudget,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,問(wèn) 題？,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,Part 2: Scientific Paper Writing,The cripple but not lost can surpass the people who walk fast but in a wrong road— Francis Bacon,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,Four questions?,Do you want to publish a high

18、quality scientific paper ? Why do you want to publish a paper ?What should you need for publishing a good paper ?After publishing, what do you expect from your papers ?,,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,什么是科學(xué)論文 ？,科學(xué)論文是：記錄原始研究結(jié)果，或綜述科學(xué)發(fā)現(xiàn)及發(fā)展

19、將正式發(fā)表或出版的書(shū)寫(xiě)文件,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,科學(xué)論文的結(jié)構(gòu),結(jié)論 （D）（發(fā)現(xiàn)，理論）,背景和研究目的（I）,方法（M&M）,主要結(jié)果（R）,,,,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,科學(xué)研究與科學(xué)論文,科學(xué)研究：科學(xué)問(wèn)題 ? 科學(xué)假設(shè) ? 實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證 ? 結(jié)論（科學(xué)發(fā)現(xiàn)）科學(xué)論文：研究背景（目的）? 研究方法 ? 研究結(jié)果 ? 結(jié)論（科學(xué)發(fā)現(xiàn)的意義）科學(xué)研究與科學(xué)論文的形式相似而對(duì)應(yīng)有好的研究結(jié)果 ? 才能創(chuàng)

20、作出好的論文,,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,怎樣才是一篇優(yōu)秀的 （研究）論文？,包含有意義的科學(xué)問(wèn)題有明確、合理的科學(xué)假設(shè)有嚴(yán)密的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)有令人信服的實(shí)驗(yàn)結(jié)果（數(shù)據(jù)）有令人鼓舞的理論、實(shí)踐意義有動(dòng)人的故事情節(jié)（story）,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,每一個(gè)人都可能是“三者”,讀者作者編者,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,1) 科學(xué)論文的特點(diǎn),科學(xué)論文的關(guān)鍵特性：科學(xué)論文向讀者傳遞新知識(shí) 清楚 簡(jiǎn)單 易懂科學(xué)論文撰寫(xiě)須選擇特

21、定語(yǔ)言,?,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,,科學(xué)論文的格式 ?,AcknowledgementsReference / literature citedTablesFigure legendsFigures Appendices,TitleAuthorsAddressAbstract / summaryKey wordsIntroductionMaterial & methodsResultsDiscussion,

22、復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,2) 科學(xué)論文的一般格式,研究論文的“三部曲”,前奏： 標(biāo)題、作者、摘要、關(guān)鍵詞主旋律：“IMMRD”尾聲：致謝、參考文獻(xiàn)等,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,研究論文的“IMMRD”格式,I = IntroductionM&M = Material & methodR = ResultsD = Discussion,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,,科學(xué)（研究）論文的格式,題目 & 摘要,前言,材料和方法,結(jié)果,

23、討論,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,3) IMMRD 的功能,Introduction: What question was studied ? （研究的目的）Materials & methods: how & based on what the problem studied ? （如何實(shí)施的）,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,,IMMRD 的功能,Results: what are the findings ? （發(fā)現(xiàn)了什么）Discu

24、ssion: what do the findings mean ? （新發(fā)現(xiàn)的意義）,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,,其他格式,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,Title & Abstract,Introduction,M & M,Conclusion,,,,,其他格式,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,,4) 綜述論文的一般格式,什么是綜述論文 ？綜述某一學(xué)科領(lǐng)域或某一位（組）科學(xué)家的研究進(jìn)展和現(xiàn)狀格式：Summarize

25、（總結(jié)）information that has been publishedAnalyze （分析）…Evaluate （評(píng)價(jià)）…Synthesize （整合）information that has been published,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,5) 論文撰寫(xiě)的步驟：,前奏：標(biāo)題、作者、(摘要)、關(guān)鍵詞主旋律：組織論文的結(jié)果描述獲取結(jié)果的方法介紹論文的研究背景及目的討論研究結(jié)果的意

26、義尾聲：致謝、參考文獻(xiàn) …,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,,科學(xué)論文的格式,題目 & …,Introduction,Materials & methods,Results,Discussion,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,A. 如何撰寫(xiě)論文的題目,論文題目的重要性：論文的題目會(huì)被大量讀者閱讀（看到） 好題目的特點(diǎn)：以最少的文字，但最大限度地表述論文的內(nèi)容題目不適宜將導(dǎo)致論文被埋沒(méi)或無(wú)緣被需要的讀者閱讀,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,前奏,論文題目

27、要意思明確,科學(xué)論文的題目應(yīng)該使用意思明確語(yǔ)句使用太“泛”的語(yǔ)句將使題目顯得毫無(wú)意義例如：“A study of rice”是一個(gè)好的論文題目么？論文題目中的三要素：科學(xué)發(fā)現(xiàn)（結(jié)論）、研究材料、研究方法,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,,,,,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,,,,,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,,Running title/ 短題目： 用于“頁(yè)首”簡(jiǎn)短版本的題目,,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,,,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,,B. 論文摘要的撰寫(xiě),I have the

28、strong impression that scientific communication is being seriously hindered by poor quality abstract written in jargon-ridden & mumbo-jumbo -- Sheila M. Mcnab,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,摘要應(yīng)該包括哪些最基本的信息？Minimum

29、information elements,P = purpose of the study（目的）M = methodology（方法）R = results（結(jié)果）C = conclusion (& recommendations)（結(jié)論&建議）PMRC: 可以代表論文摘要的核心要點(diǎn),復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,C. 如何撰寫(xiě)前言,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,主旋律,,Title & …,前言,Mate

30、rials & methods,Results,Discussion,科學(xué)論文的格式,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,前言的作用？,Introduction: What question was studied ? （研究的目的）提供本研究足夠的相關(guān)背景信息和目的介紹本研究提出的科學(xué)問(wèn)題：為什么重要？目前知道多少？為什么必須研究？讓讀者（編輯/審稿人）能理解和評(píng)價(jià)研究結(jié)果的意義,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,前言Introduction 撰

31、寫(xiě)的“路線(xiàn)圖”,提出問(wèn)題,聚焦問(wèn)題提出假設(shè),綜述和回顧,解決問(wèn)的題方法,,,,,研究目的（結(jié)論）,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,D. 如何撰寫(xiě)材料和方法,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,Title & …,Introduction,材料 & 方法,Results,Discussion,科學(xué)論文的格式,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,撰寫(xiě)材料和方法的目的？,幫助讀者（編輯/審稿人）理解論文獲得的結(jié)果材料和方法的 2 點(diǎn)作用：為有經(jīng)驗(yàn)的讀者提供重復(fù)試驗(yàn)并驗(yàn)證結(jié)

32、果正確性的機(jī)會(huì)為審稿人/編輯提供判斷結(jié)果是否具有可靠性的基礎(chǔ),復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,材料和方法中的副標(biāo)題,II. DNA extraction DNA from……,III. PCR and electrophoresis The extracted DNA samples……,IV. Data analysis All the collected data were analyzed using…

33、…,I. Plant Materials Twenty-two accessions of……,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,E. 如何撰寫(xiě)結(jié)果,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,Title & …,Introduction,Materials & methods,結(jié)果,Discussion,科學(xué)論文的格式,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,結(jié)果的意義,“結(jié)果”決定了一篇論文的科學(xué)價(jià)值和重要程度 結(jié)果是論文的引擎或“駕駛”結(jié)果是實(shí)驗(yàn)研究所獲得的

34、“數(shù)據(jù)”,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,如何表現(xiàn)“數(shù)據(jù)”?,原則：簡(jiǎn)單從記錄本中將原始數(shù)據(jù) “轉(zhuǎn)移”到論文中的做法不可取要將數(shù)據(jù)變成有用的知識(shí)信息應(yīng)該在結(jié)果中包括：有意義的數(shù)據(jù)經(jīng)過(guò)消化（分析）的數(shù)據(jù)結(jié)果（數(shù)據(jù)）的呈現(xiàn)要有效和有趣,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,科學(xué)內(nèi)容（science）是論文的精髓,“As long as the science is good & can be clearly understood, I don’t wor

35、ry too much about the English – I have copy editors who can fix that.” （澳大利亞一科學(xué)雜志主編）一篇科學(xué)論文的關(guān)鍵在于：好的科學(xué)內(nèi)容清楚易懂的文體,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,結(jié)果中最忌諱的是重復(fù),結(jié)果表現(xiàn)中最易犯的錯(cuò)誤是重復(fù)正文的描述重復(fù)表和圖中的內(nèi)容表中重復(fù)圖中的內(nèi)容最糟糕的情況是正文中有表和圖的部分或所有內(nèi)容在圖和表的引用時(shí)應(yīng)避

36、免冗長(zhǎng)的描述，例如： “It was clearly shown in Table 1 that wild rice was of great diversity in China”“Wild rice in China had great diversity (Table 1)”,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,結(jié)果中的中的副標(biāo)題,II. PCR products and electrophoresis A great geneti

37、c variation of was detected by electrophoresis of … (Table 1) …,III. Variation patterns Statistic analysis show that ……,I. An effective DNA extraction method DNA samples are usually difficult to be collected

38、 from……,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,F. 如何撰寫(xiě)討論,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,Title & …,Introduction,Materials & methods,Results,討論,科學(xué)論文的格式,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,為什么要進(jìn)行討論（目的）,討論獲得結(jié)果的重要意義？通?！坝懻摗笔怯脕?lái):解釋 結(jié)果（的意義）指出 結(jié)果是否驗(yàn)證了研究的科學(xué)假設(shè)及意義比較 將研究結(jié)果與其他工作相比較,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,如何進(jìn)行討論？,特別

39、要重視重訪“前言”中提到的科學(xué)問(wèn)題和假設(shè)討論研究結(jié)果可能帶來(lái)的的理論意義和應(yīng)用價(jià)值盡量清楚闡述和給出論文的結(jié)論對(duì)每一條結(jié)論均提供充足的證據(jù),復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,英文論文的時(shí)態(tài),Introduction — 現(xiàn)在時(shí) & 過(guò)去時(shí)) M & M — 過(guò)去時(shí)Results — 過(guò)去時(shí)Discussion — 現(xiàn)在時(shí) & 過(guò)去時(shí),復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,8. 如何撰寫(xiě)致謝和引用參考文獻(xiàn),復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,尾聲,向誰(shuí)進(jìn)行

40、致謝 ?,支持該研究的基金（基金號(hào). xxx）對(duì)本研究的實(shí)驗(yàn)工作有重要幫助的同事對(duì)論文的撰寫(xiě)和修改提出建設(shè)性意見(jiàn)的專(zhuān)家,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,問(wèn) 題？,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮,74,祝大家事業(yè)成功！Good luck with your scientific career！,Thank you !,千里之行，始于足下A thousand miles’ journey starts from the first steps,復(fù)旦大學(xué) 盧寶榮