黃顙魚性別差異基因的挖掘與驗證.pdf

1、魚類性別的決定和分化是由許多相關事件構成的復雜的生物過程，在共同的遺傳物質和生活環(huán)境下，魚類個體向相反的性別發(fā)育。黃顙魚是中國的小型經(jīng)濟魚類之一，其雄性比雌性生長快。在中國，黃顙魚是淡水經(jīng)濟魚類之一，具有較大的市場需求。
　　本研究中，每天采樣觀察了3-60日齡人工養(yǎng)殖的黃顙魚Pelteobagrus fulvidraco性腺分化和發(fā)育的組織學。結果表明，在水溫（20±4）℃下，黃顙魚卵巢的分化明顯早于精巢，性腺的分化型為雌性異體

2、型。孵出后14 d卵巢開始分化，原始性腺在橫切面出現(xiàn)組織突起，逐步形成卵巢腔；雄性分化始于孵出后54 d，主要標志是形成輸精管原基,進而形成輸精管。利用Illumina對黃顙魚進行轉錄組測序，選取性腺發(fā)育的關鍵時期，孵出后3d隨機取3條未知性別的黃顙魚幼魚混樣（記為B）作為對照，選取卵巢分化關鍵時期孵化后14d和精巢分化關鍵時期孵化后54d，孵化90d可辨別雌雄黃顙魚。實時定量PCR驗證挖掘出性別基因變化的情況。
　　將RNA-S

3、eq測序所得轉錄組數(shù)據(jù)與基因組進行比對，結果表明在雌雄性腺總共表達從9個轉錄組中共獲得203,660,437 Raw reads，得到過濾后的Clean reads為191,297,677。質量控制之后的reads進行FPKM計算，在得到所有基因的FPKM值中，尋找表達值具有較大差異的基因，結果顯示以B為分界點，在B之前的14、15、54、Y和55為雄性，其FPKM值相對雌性較低；在B以后為雌性，分別為13和53的。將未知性別的黃顙魚在