水稻產(chǎn)量相關(guān)性狀的QTL分析和籽粒酚反應(yīng)基因qPH4-3的精細(xì)定位.pdf

1、該實驗利用巴利拉/南京11構(gòu)建的秈粳交加倍單倍體(DH,double haploid)群體,運用作圖軟件Joinmap 3.0構(gòu)建了一張含有137個分子標(biāo)記的水稻連鎖圖.其中含有10個STS標(biāo)記,23個CAPS標(biāo)記和104個SSR標(biāo)記,覆蓋的遺傳距離為1429.2cM,標(biāo)記間的平均距離為10.43cM.同時,利用基因定位軟件QTLmapper1.0對控制水稻產(chǎn)量相關(guān)的9個性狀的QTL進(jìn)行了定位和分析,并估算了每個QTL在染色體上的位置其

2、遺傳效應(yīng)等. 該研究的主要結(jié)果如下:1. 該實驗考察了9個產(chǎn)量相關(guān)性狀,分別為每穗實粒數(shù),每穗穎花數(shù),結(jié)實率,穗長,穗密度,千粒重,有效穗數(shù),花粉育性和苯酚反應(yīng).在9個性狀中,除千粒重和穗密度在雙親間無顯著差異外,其它各性狀在雙親中差異明顯.DH群體中除籽粒苯酚反應(yīng)外,其余各性狀均表現(xiàn)為連續(xù)變異,并表現(xiàn)出超親優(yōu)勢,呈現(xiàn)數(shù)量性狀的特點.2. 該實驗以混合線性模型為基礎(chǔ),運用QTLmapper 1.0在DH群體中進(jìn)行了QTL定位和分析.分析

3、結(jié)果表明:(1)在加性效應(yīng)和上位性效應(yīng)中,不同QTL的貢獻(xiàn)率、效應(yīng)值和作用方式存在多種變異.不同QTL的貢獻(xiàn)率差異較大,變幅在3.19％~47.48％之間.(2)在所定位的QTL中,既有僅表現(xiàn)為加性效應(yīng)或上位性效應(yīng)的,也有同時表現(xiàn)這兩種效應(yīng)的QTL.(3)有些QTL只與另一個QTL發(fā)生上位性效應(yīng),而有些QTL可能與其它兩個QTL之間發(fā)生一對二的互作效應(yīng),即形成兩個上位性效應(yīng).反映了控制產(chǎn)量性狀基因的復(fù)雜性.3.從該研究的定位結(jié)果來看,在

4、父母本中都發(fā)現(xiàn)了控制同一性狀的增效QTL,在DH群體中也找到了比親本更具優(yōu)勢的株系.4.研究結(jié)果表明,控制同一性狀的多個QTL,有些被定位到同一條染色體上的相鄰區(qū)間內(nèi);另外,有些性狀相關(guān)的QTL的位置往往集中在染色體上相同或相近的區(qū)域,呈現(xiàn)出成簇分布.5.在初步定位的基礎(chǔ)上對控制籽粒酚反應(yīng)的基因qPH4-3進(jìn)行精細(xì)定位.根據(jù)qPH4-3所在區(qū)域的基因組序列設(shè)計引物,利用BC1大分離群體,最后將qPH4-3定位在水稻第4號染色體長臂分子標(biāo)