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文檔簡介
1、對影響RAPD擴增圖譜的5個因子:Primer濃度、模板濃度、dNTPs濃度、Taq酶用量和Mg<'2+>濃度設(shè)計了5個水平,再通過正交分析表組建了25個反應(yīng)體系,然后根據(jù)可辨識的電泳條帶進行正交實驗表中各組結(jié)果的統(tǒng)計,建立起小麥白粉病菌的RAPD分析優(yōu)化體系.結(jié)果表明:在試驗范圍內(nèi),5個因子中對擴增結(jié)果的影響由大到小依次為Primer濃度、模板濃度、dNTPs濃度、Taq酶用量和Mg<'2+>濃度.在反應(yīng)體系中,各項因子最適濃度為:引
2、物濃度2.0μmol/L,模板濃度5ng,dNTPs濃度0.1 mmol/L、Taq酶用量1.5U,Mg<'2+>濃度2.0mmol/L.在所得的RAPD優(yōu)化體系的基礎(chǔ)上,采用集群分析法(BSA),分別對小麥白粉菌交配型和白化性狀進行了多態(tài)性分析.結(jié)果表明,在520條隨機引物中有478條單引物能擴增出條帶,占擴增引物總數(shù)的92﹪,擴增片段在300-2000bp之間.對交配型性狀,有24個引物或引物組合在DNA池中擴出多態(tài)性條帶;對白化性
3、狀,有15個引物擴出多態(tài)性條帶,但只有兩個RAPD標記,OPQ03<,775>和OPQ09<,685>可能分別與交配型和白化性狀相關(guān).將這兩個RAPD標記片段克隆,序列分析顯示:這兩段序列與目前已知的任何序列都沒有同源性,且只有OPQ03<,775>有較長的開放式閱讀框架.根據(jù)克隆片段末端序列設(shè)計引物,成功的將RAPD標記轉(zhuǎn)化為更為穩(wěn)定的SCAR標記.標記OPQ03<,775>能在7個已知交配型菌株中擴增出特異性條帶,在由34個野生菌組
4、成的菌群中的出現(xiàn)與否符合1:1的比例,跟交配型分布的理論值一致;標記OPQ09<,685>在白化和正常菌株的43個雜交后代中與白化性狀的交換率是25.6﹪,經(jīng)軟件MAP AKER3.0計算,遺傳距離為15.2cM,表明該標記與白化性狀有一定的連鎖性.從大麥白粉菌已克隆的174個基因中調(diào)出20個與大麥互作的基因,并從中選取了4個基因:BIG2,大麥誘導表達基因,在侵染初期起調(diào)控作用;Cat1,過氧化氫酶基因;CLg,與大麥白粉菌的毒力,侵
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