20863.甜瓜屬ty1copia類逆轉(zhuǎn)座子分析及其對異源四倍體遺傳變異的影響研究

1、南京農(nóng)業(yè)大學(xué)博士學(xué)位論文甜瓜屬Ty1copia類逆轉(zhuǎn)座子分析及其對異源四倍休遺傳變異的影響研究姓名：江彪申請學(xué)位級別：博士專業(yè)：蔬菜學(xué)指導(dǎo)教師：陳勁楓201106甜瓜屬Tyl吒印婦類逆轉(zhuǎn)座子分析及其對異源四倍體遺傳變異的影響研究所有染色體，并在末端異染色質(zhì)區(qū)成簇狀分布2甜瓜屬異源多倍化對兩1唧缸類逆轉(zhuǎn)座子轉(zhuǎn)錄活性的影響為了研究甜瓜屬異源多倍化對新合成異源四倍體中Tylc印蛔類逆轉(zhuǎn)座子轉(zhuǎn)錄活性的影響，利用RTPCR從異源四倍體C細咖淞及其

2、二倍體親本(C枷施和Cs口咖淞)中擴增逆轉(zhuǎn)錄酶基因結(jié)果僅在異源四倍體中獲得了目的片段，回收測序后共獲得18個高度異質(zhì)的序列有義突變和無義突變分析暗示這些逆轉(zhuǎn)座子序列主要受凈化選擇影響。RTPCR和gPCR分析驗證了逆轉(zhuǎn)錄酶基因在甜瓜屬異源四倍體早期四個世代中的表達，證實這些逆轉(zhuǎn)座子的活性是由異源多倍化造成的3逆轉(zhuǎn)座子對甜瓜屬異源四倍體早期世代基因組變異的影響為了檢測逆轉(zhuǎn)座子對甜瓜屬異源四倍體基因組變異的影響，本文以野生酸黃瓜C伽晰髓與栽

3、培黃瓜C刪柵的正反交種問雜種Fl、異源四倍體C砂咖凇早期世代(C^聲護打作母本)及其二倍體親本為材料進行SSAP分析結(jié)果發(fā)現(xiàn)正反交Fl及異源四倍體均發(fā)生廣泛的序列變異，包括親本條帶的丟失和新增條帶的出現(xiàn)，正反交條帶丟失數(shù)和新增條帶數(shù)基本沒有差異無論是條帶丟失還是增加，均主要發(fā)生在Fl、Sl和S2代，因此推測異源四倍體早期基因組變異是一個快速的過程同時利用基于逆轉(zhuǎn)座子的分子標(biāo)記腳和l也MAP以及微衛(wèi)星標(biāo)記ISSR等，研究甜瓜屬新合成異源四

4、倍體早期世代的基因組變異結(jié)果共檢測出28個變異條帶，包括24個親本丟失條帶和4個新增條帶，表明基因組變異主要表現(xiàn)為親本序列丟失在這24個丟失序列中，18個是酸黃瓜特異序列，4個是栽培黃瓜特異序列，另2個是雙親共有序列，暗示序列丟失可能與親本基因組的組成相關(guān)而且大部分變異出現(xiàn)在Sl代，并能在隨后三個世代(S2S4)中穩(wěn)定遺傳，表明基因組變異是一個快速的過程，促進異源四倍體穩(wěn)定形成進一步對發(fā)生變異的序列進行回收測序，共獲得11個序列比對分析