牙鲆家系數(shù)量遺傳分析及變態(tài)期偏轉(zhuǎn)方向的QTL定位.pdf

1、牙鲆是我國(guó)重要的海水養(yǎng)殖魚(yú)類(lèi)，廣泛分布于我國(guó)沿海地區(qū)，為廣大養(yǎng)殖戶(hù)帶來(lái)了巨大的經(jīng)濟(jì)效益。對(duì)牙鲆進(jìn)行遺傳改良有助于實(shí)現(xiàn)牙鲆種質(zhì)資源的優(yōu)化和保護(hù)，推動(dòng)牙鲆養(yǎng)殖業(yè)的健康發(fā)展。本研究中，分析了幼魚(yú)期和成魚(yú)期牙鲆多形態(tài)性狀與體質(zhì)量的關(guān)系，對(duì)牙鲆不同發(fā)育時(shí)期的生長(zhǎng)性狀進(jìn)行數(shù)量遺傳分析，另外還對(duì)牙鲆變態(tài)時(shí)期的偏轉(zhuǎn)相關(guān)QTL進(jìn)行了初級(jí)定位和精細(xì)定位，取得了如下研究結(jié)果：
　　1.統(tǒng)計(jì)牙鲆在8月齡與14月齡的22個(gè)形態(tài)性狀和體質(zhì)量（Y），包括全長(zhǎng)（

2、X1）、體長(zhǎng)（X2）、尾鰭長(zhǎng)（X3）、體寬（X4）、體厚（X5）、頭長(zhǎng)（X6）、吻長(zhǎng)（X7）、口斜裂長(zhǎng)（X8）、尾柄長(zhǎng)（X9）、背鰭起點(diǎn)到胸鰭基部的直線(xiàn)距離（X10）、背鰭起點(diǎn)到臀鰭起點(diǎn)的直線(xiàn)距離（X11）、背鰭起點(diǎn)到背鰭終點(diǎn)的直線(xiàn)距離（X12）、背鰭起點(diǎn)到臀鰭終點(diǎn)的直線(xiàn)距離（X13）、背鰭終點(diǎn)到臀鰭終點(diǎn)的直線(xiàn)距離（X14）、胸鰭基部到背鰭終點(diǎn)的直線(xiàn)距離（X15）、臀鰭起點(diǎn)到臀鰭終點(diǎn)的直線(xiàn)距離（X16）、腹鰭基部到背鰭起點(diǎn)的直線(xiàn)距離（X

3、17）、腹鰭基部到背鰭終點(diǎn)的直線(xiàn)距離（X18）、腹鰭基部到臀鰭起點(diǎn)的直線(xiàn)距離（X19）、腹鰭基部到臀鰭終點(diǎn)的直線(xiàn)距離（X20）、眼間距（X21）以及眼徑（X22）。對(duì)各形態(tài)性狀與體質(zhì)量進(jìn)行相關(guān)分析，篩選出與體質(zhì)量高度相關(guān)的形態(tài)性狀，通過(guò)回歸分析研究形態(tài)性狀與體質(zhì)量的直接與間接通徑系數(shù)，建立不同生長(zhǎng)時(shí)期牙鲆主要形態(tài)性狀對(duì)體質(zhì)量的多元回歸方程，方程分別為：Y=-119.541+7.191 X18+10.135 X4+7.197 X11（8月

4、齡）；Y=-484.931+31.959 X18+81.928 X14-17.889 X9（14月齡）。結(jié)果表明，不同發(fā)育階段影響體質(zhì)量的主要形態(tài)性狀不同，篩選出X18在兩個(gè)發(fā)育階段中均進(jìn)入回歸方程。通過(guò)對(duì)兩個(gè)階段的主要形態(tài)性狀與體質(zhì)量進(jìn)行模型擬合，發(fā)現(xiàn)8月齡階段的最優(yōu)擬合模型均為線(xiàn)性模型，模型等式分別為：Y=-117.866+15.724 X18；Y=-94.579+24.763 X4；Y=-100.602+33.184 X11；而1

5、4月齡階段的最優(yōu)擬合模型均為冪函數(shù)模型，模型等式分別為：Y=0.036X183.063；Y=0.095X142.587；Y=62.249X91.584。本次研究表明，在牙鲆的不同生長(zhǎng)時(shí)期，影響體質(zhì)量的主要形態(tài)性狀存在一些差別，兩個(gè)生長(zhǎng)時(shí)期適用的最優(yōu)擬合模型也不同，這為牙鲆不同時(shí)期的選擇育種工作提供了理論指導(dǎo)。
　　2.通過(guò)對(duì)93日齡、141日齡和203日齡牙鲆的全長(zhǎng)、體寬和體質(zhì)量數(shù)據(jù)進(jìn)行非條件遺傳分析與條件遺傳分析，研究加性效應(yīng)、

6、顯性效應(yīng)、加性與環(huán)境互作效應(yīng)、顯性與環(huán)境互作效應(yīng)在不同發(fā)育階段的作用效果，以及相關(guān)基因的作用規(guī)律。結(jié)果表明：在早期發(fā)育階段和后期發(fā)育階段，環(huán)境效應(yīng)對(duì)牙鲆經(jīng)濟(jì)性狀的影響較大。條件加性方差在203日齡皆下降至0，說(shuō)明在該發(fā)育階段加性效應(yīng)相關(guān)基因關(guān)閉表達(dá)。三個(gè)性狀在三個(gè)監(jiān)測(cè)點(diǎn)均未表現(xiàn)出明顯的雜種優(yōu)勢(shì)。在牙鲆個(gè)體發(fā)育的后期，體長(zhǎng)的增長(zhǎng)與體寬、體質(zhì)量的增長(zhǎng)并不同步，這可能是由于發(fā)育后期體長(zhǎng)達(dá)到一定規(guī)格，生長(zhǎng)速度逐漸減慢，而此時(shí)體寬的增長(zhǎng)對(duì)體質(zhì)量的

7、影響較大，與上一部分中通徑分析結(jié)果相符合。研究結(jié)果表明，常規(guī)檢測(cè)的三個(gè)時(shí)段間隔過(guò)長(zhǎng)，因而不能確定檢測(cè)間隔期相關(guān)基因的作用方向是否發(fā)生變化，需要縮短檢測(cè)間隔進(jìn)行深入研究。
　　3.對(duì)牙鲆變態(tài)過(guò)程中，眼睛偏轉(zhuǎn)方向不同（左偏和右偏）的現(xiàn)象進(jìn)行初級(jí)和精細(xì)QTL定位。成功構(gòu)建24個(gè)連鎖群，與牙鲆的染色體數(shù)相符，標(biāo)記覆蓋率達(dá)到了64％。通過(guò)初級(jí)定位發(fā)現(xiàn)，1號(hào)連鎖群中的標(biāo)記與數(shù)量性狀基因座表現(xiàn)出極顯著相關(guān)，得到22cM的QTL區(qū)間。通過(guò)對(duì)1號(hào)連

8、鎖群中的標(biāo)記進(jìn)行加密，重新構(gòu)建1號(hào)連鎖群整合圖譜、雌性圖譜和雄性圖譜。整合圖譜共42個(gè)標(biāo)記連鎖，覆蓋率達(dá)到95.4%，總長(zhǎng)度為55.3cM；雌性圖譜共37個(gè)標(biāo)記連鎖，覆蓋率達(dá)到94.7%，總長(zhǎng)度為59.2cM；雄性圖譜共28個(gè)標(biāo)記連鎖，覆蓋率達(dá)到93.1%，總長(zhǎng)度為59.2cM。使用整合圖譜進(jìn)行精細(xì)定位后得到四個(gè)QTL區(qū)間，長(zhǎng)度依次為0.9cM、2.6cM、0.2cM、0.3cM；使用雌性圖譜得到兩個(gè)QTL區(qū)間，長(zhǎng)度均為1.8cM；使用