陸地棉資源群體抗逆性關(guān)聯(lián)分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、棉花是全世界主要的經(jīng)濟(jì)作物之一,是最主要的天然纖維來源。棉花具有一定的喜溫性和耐鹽性,隨著耕地減少和環(huán)境惡化,抗逆性也逐漸成為育種家所考慮的目標(biāo)性狀。本研究以自然群體為基礎(chǔ),采用關(guān)聯(lián)分析的方法來發(fā)掘與陸地棉抗逆性相關(guān)的分子標(biāo)記,為棉花的抗性育種提供依據(jù)。
  本研究采用包含503份來自全國各地的陸地棉種質(zhì)資源作為關(guān)聯(lián)分析的群體,采用四層濾紙發(fā)芽法對(duì)來自我國三大棉區(qū)的四個(gè)環(huán)境(黃岡、原陽、石河子、庫爾勒)兩年的種子進(jìn)行抗鹽、抗低溫的

2、發(fā)芽率與相對(duì)發(fā)芽率鑒定;調(diào)查了石河子地區(qū)2012年和2013年黃萎病的病情指數(shù)??鼓姹硇偷恼{(diào)查說明黃岡地區(qū)種植環(huán)境下材料的抗性最差,最好的是新疆的石河子地區(qū);并篩選出了如晉棉21、中棉所36、豫抗1號(hào)、朝陽棉1號(hào)等對(duì)多種逆境抗性較好的材料。
  群體基因型鑒定是通過本實(shí)驗(yàn)室構(gòu)建的一個(gè)高密度海陸種間圖譜上每10cM挑選出的494對(duì)引物,并用聚丙烯酰胺凝膠電泳的方法進(jìn)行分析;同時(shí)還利用lllumina公司開發(fā)的63K芯片做群體SNP位

3、點(diǎn)的基因分型。
  全基因組關(guān)聯(lián)分析使用TASSEL軟件在混合線性模型下進(jìn)行。基于SSR標(biāo)記數(shù)據(jù)的關(guān)聯(lián)分析結(jié)果在p<0.05的顯著條件下分別檢測到分布在14條染色體上的32個(gè)標(biāo)記與抗鹽性狀相關(guān),平均解釋率為2.48%,其中多環(huán)境的有12個(gè);分布在11條染色體上的17個(gè)標(biāo)記與抗低溫性狀相關(guān),平均解釋率為2.14%,其中多環(huán)境的有2個(gè)。而基于SNP標(biāo)記數(shù)據(jù)的關(guān)聯(lián)分析結(jié)果在p<10-4條件下檢測到11、3、10個(gè)標(biāo)記分別與抗鹽、抗冷、抗

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