番茄抗灰霉病相關基因SNP標記的開發(fā)與應用.pdf

1、番茄作為重要的蔬菜栽培作物之一，被世界各地廣泛種植，其獨特的風味和豐富的營養(yǎng)為廣大消費者所喜愛。隨著栽培面積的擴大，灰霉病作為主要病害之一，嚴重危害了番茄的正常生長，培育優(yōu)良的具有穩(wěn)定的抗灰霉病病遺傳特性的番茄品種已經(jīng)成為亟需解決的問題。常規(guī)田間抗病番茄育種耗時長，性狀難以穩(wěn)定遺傳，而分子標記輔助選擇育種周期短，效率高，為育種工作者加速了育種進程，成為培育新品種的首選手段。
　　本研究旨在通過利用生物信息學方法，對重測序的300多

2、份番茄材料篩選出灰霉病相關抗病基因的核苷酸差異位點，開發(fā)出具有多重抗病基因的SNP分子標記運用于基因標記輔助選擇育種，為番茄抗灰霉病的品種選育提供新的材料，加快抗病番茄的育種進程。本研究所獲成果如下：
　　1.根據(jù)300多份番茄材料重測序獲得10個位點，每個位點選取1個最相關的SNP，從Heinz上找到番茄基因組中此SNP位點前后1000bp的序列信息，在此段序列上設計引物，其中一條前引物或后引物的3’端與模板互補或錯配，并通過修

3、改設計人為的在3’端的第二位或第三位引入錯配堿基以提高此引物的特異性。據(jù)此一共設計了分布在三條不同染色體上的多個抗灰霉病相關SNP標記，保證10個位點中每個SNP位點有一對以上的單組可用引物。
　　2.由于10個SNP位點分布于三條不同的染色體上，據(jù)此設計三組多重SNP標記混合引物：第1、2、3、4個SNP位點位于1號染色體上，第5、6、7、8個SNP位點位于3號染色體上，第9、10個SNP位點位于6號染色體上，達到一次PCR反應