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文檔簡介
1、第一部分RMP在肝臟惡性腫瘤中對自噬的調(diào)節(jié)依賴于p53的狀態(tài)
研究背景和目的:肝臟惡性腫瘤(Hepatic malignancy)嚴(yán)重威脅著人類的健康。其中,肝癌(Livercancer)是成人常見的肝臟惡性腫瘤,其發(fā)病率和死亡率均位于惡性腫瘤前十位。原發(fā)性肝癌(PLC)最重要的病理類型是肝細胞癌(HCC),約70-85%為此類型。已經(jīng)發(fā)現(xiàn)肝細胞癌與病毒感染、環(huán)境污染、遺傳易感等多種因素相關(guān),然而其發(fā)生發(fā)展的具體分子機制仍不清
2、楚。目前對于肝癌的基礎(chǔ)研究越來越深入,針對肝癌的治療策略也越來越多樣,其中手術(shù)切除是肝癌治療最重要的方式。盡管臨床對于肝癌的分類、分型和分期日趨完善,但肝癌的整體治療效果難以令人滿意,究其原因,肝癌異質(zhì)性是導(dǎo)致治療效果差強人意的主要原因。因此,研究肝癌發(fā)生發(fā)展的分子機制能夠為更加細致的肝癌分類、分型提供分子基礎(chǔ)。肝母細胞瘤(HB)是嬰幼兒最常見的肝臟惡性腫瘤,約15%的肝母細胞瘤合并有遺傳綜合征,同時,多項研究發(fā)現(xiàn)肝母細胞瘤的發(fā)生發(fā)展與
3、Wnt信號通路、Hedgehog信號通路等相關(guān)。因此,對肝母細胞瘤發(fā)生發(fā)展機制的研究有利于我們對于肝臟惡性腫瘤更加立體、更加細致的認識。
自噬是細胞內(nèi)保守的生物進程,其通過溶酶體途徑降解細胞內(nèi)的錯誤折疊蛋白,損傷的細胞器等,成為細胞內(nèi)物質(zhì)分解再利用的重要方式。然而,過度的自噬同樣可以引起細胞死亡。自噬在腫瘤發(fā)生發(fā)展中的作用也呈雙向性,不同腫瘤、不同背景中的研究結(jié)果截然不同。自噬既能抑制腫瘤發(fā)生,又能通過抑制p53的激活促進腫瘤
4、發(fā)生;自噬既能通過對抗慢性炎癥、組織損傷和基因組不穩(wěn)定發(fā)揮抑制腫瘤發(fā)展的作用,又能為應(yīng)激情況下腫瘤的生存發(fā)展提供必需的物質(zhì)。在同一腫瘤、不同分子背景的腫瘤中,自噬也發(fā)揮著雙向調(diào)節(jié)的作用。小鼠胰腺導(dǎo)管腺癌中的一項研究發(fā)現(xiàn),在p53正常存在的情況下,自噬發(fā)揮促進腫瘤的作用,當(dāng)敲除p53后,自噬發(fā)揮抑制腫瘤的作用。那么,在肝臟惡性腫瘤中,自噬究竟發(fā)揮怎樣的調(diào)節(jié)作用呢?
RMP(RNA polymerase subunit5-medi
5、ating protein)是RNA聚合酶第5亞基的調(diào)節(jié)蛋白。已經(jīng)發(fā)現(xiàn),RMP在多種腫瘤組織中高表達,并通過誘導(dǎo)DNA損傷、抑制凋亡、促進轉(zhuǎn)移等機制發(fā)揮促進腫瘤發(fā)生發(fā)展的作用。然而,RMP對腫瘤自噬的調(diào)節(jié)作用尚無相關(guān)研究。因此,以肝臟惡性腫瘤為研究對象,通過干擾RMP慢病毒建立穩(wěn)轉(zhuǎn)細胞系,在細胞水平檢測了干擾RMP對腫瘤細胞自噬的影響。發(fā)現(xiàn)了RMP在不同背景肝臟惡性腫瘤細胞中對自噬的分化調(diào)節(jié),并研究了這種分化調(diào)節(jié)可能額分子機制。
6、 研究方法:
1.收集肝母細胞瘤組織樣品,分別使用Western blot和RT-PCR檢測冰凍組織樣品中RMP的蛋白水平和mRNA水平;使用免疫組織化學(xué)方法檢測蠟塊組織切片中RMP的表達。
2.選擇肝母細胞瘤細胞系HepG2細胞和Huh6細胞,肝細胞癌細胞系SMMC7721細胞和Huh7細胞,分別用干擾RMP慢病毒構(gòu)建穩(wěn)轉(zhuǎn)細胞系。CCK-8和EdU實驗檢測干擾RMP對肝母細胞瘤細胞增殖的影響。
3.平板
7、克隆實驗檢測干擾RMP對肝母細胞瘤細胞克隆形成的影響。
4.使用SA-β-gal染色實驗以及細胞免疫免疫熒光檢測γ-H2AX的表達,檢測干擾RMP對肝母細胞瘤細胞衰老的影響。
5.檢測自噬溶酶體途徑直接底物p62的蛋白水平,反映干擾RMP對肝臟腫瘤細胞自噬的影響。
6.檢測對照組細胞和干擾RMP細胞中衰老相關(guān)分子的表達。因為p53對細胞增殖、衰老等呈單向調(diào)節(jié),而對自噬調(diào)節(jié)呈雙向調(diào)節(jié),選擇p53作為此項研究的
8、興趣分子。
7.使用CHX抑制翻譯檢測p53半衰期,使用DNA損傷性藥物Dox檢測p53的活性,研究肝臟惡性腫瘤細胞中p53的狀態(tài)。
8.使用過表達RMP質(zhì)粒瞬時轉(zhuǎn)染肝臟惡性腫瘤細胞,Western blot檢測p53蛋白。進一步驗證RMP對p53蛋白的調(diào)節(jié)作用。
9.使用免疫共沉淀檢測MDM2與p53結(jié)合的能力。
10.使用免疫共沉淀檢測p53與泛素分子UB的結(jié)合能力,反映p53的泛素化及總蛋白
9、泛素化。
11.使用RT-PCR檢測p53下游靶基因的表達,使用胞漿胞核分離技術(shù)檢測干擾RMP后,細胞各組分中p53蛋白的變化。
研究結(jié)果:
1.RMP在肝母細胞瘤組織中的表達:肝母細胞瘤冰凍組織和石蠟包塊組織中,RMP均高表達。
2.RMP對肝母細胞瘤細胞增殖的影響:干擾RMP能明顯抑制肝母細胞瘤細胞HepG2和Huh6的增殖能力。
3.RMP對肝母細胞瘤細胞克隆形成的影響:干擾RMP
10、能明顯抑制肝母細胞瘤細胞HepG2和Huh6的克隆形成能力。
4.RMP對肝母細胞瘤細胞衰老的影響:干擾RMP能促進肝母細胞瘤細胞HepG2和Huh6發(fā)生衰老。
5.RMP對肝臟惡性腫瘤細胞自噬的影響:在HepG2細胞和SMMC7721細胞中,干擾RMP抑制自噬;在Huh6細胞和Huh7細胞中,干擾RMP促進自噬。
6.RMP對衰老相關(guān)分子的調(diào)節(jié):干擾RMP明顯上調(diào)衰老相關(guān)分子p16、p53、p21的表達。
11、
7.不同肝臟惡性腫瘤細胞中p53的狀態(tài):HepG2細胞和SMMC7721細胞中的野生型p53半衰期約20-30分鐘,能夠被Dox激活;Huh6細胞和Huh7細胞中突變型p53半衰期約6-8小時,Dox刺激下蛋白不上調(diào)。
8.RMP對p53蛋白的調(diào)節(jié):過表達RMP能夠明顯下調(diào)p53蛋白。
9.RMP對MDM2與p53結(jié)合能力的影響:干擾RMP,MDM2與p53的結(jié)合明顯減少。
10.RMP對p53
12、蛋白泛素化和總蛋白泛素化的影響:干擾RMP,明顯減少p53蛋白泛素化和總蛋白泛素化。因此,RMP通過影響p53泛素化,調(diào)節(jié)p53的蛋白穩(wěn)定性。
11.RMP通過對p53蛋白的調(diào)節(jié)影響自噬:干擾RMP所誘導(dǎo)的p53蛋白并不影響下游靶基因的表達。干擾RMP主要引起胞漿中野生型p53蛋白升高,進而發(fā)揮抑制自噬的作用。
結(jié)論:本研究發(fā)現(xiàn)RMP在肝母細胞瘤組織中高表達。細胞實驗發(fā)現(xiàn)RMP促進了肝母細胞瘤細胞的增殖、克隆形成,并
13、抑制細胞衰老,然而RMP對細胞自噬的調(diào)節(jié)呈現(xiàn)雙向性。進一步研究發(fā)現(xiàn),RMP能明顯抑制p53蛋白表達。機制研究發(fā)現(xiàn),RMP通過促進MDM2與p53的結(jié)合從而促進了p53蛋白泛素蛋白酶體途徑的降解。同時發(fā)現(xiàn)RMP對p53蛋白的調(diào)節(jié)并不影響其下游靶基因的表達,胞漿胞核分離實驗發(fā)現(xiàn)RMP主要減少了胞漿中基礎(chǔ)p53,進而促進細胞自噬。
第二部分p53的狀態(tài)決定了自噬對蛋白酶體抑制劑所誘導(dǎo)的凋亡的調(diào)節(jié)作用
研究背景和目的:自噬是
14、依賴于溶酶體的細胞內(nèi)物質(zhì)的降解通路。一方面,它能將細胞內(nèi)不需要的組分降解生成細胞必須的營養(yǎng)成分,從而實現(xiàn)了細胞內(nèi)物質(zhì)的再利用;另一方面,當(dāng)自噬過度激活時,細胞也能被這種“自我消化”式的降解途徑所損傷,引起細胞死亡。與此同時,自噬與其他引起細胞死亡的方式之間也存在非常重要的聯(lián)系。
自噬對于凋亡的調(diào)節(jié)因研究的背景不同呈現(xiàn)明顯的分化。一部分研究發(fā)現(xiàn),自噬能夠通過特異性地降解促凋亡分子如Caspase8等發(fā)揮抑制凋亡的作用;而自噬的特
15、殊類型線粒體自噬還可以通過清除受損的線粒體,減少內(nèi)源性促凋亡因子的釋放,抑制內(nèi)源性凋亡通路。然而,另一部分研究發(fā)現(xiàn),自噬相關(guān)基因能夠與Caspase8結(jié)合,促進Caspase8的活化;同時,自噬也能特異性降解內(nèi)源性自噬抑制分子,這些機制均表明自噬能夠促進凋亡。因此,自噬對凋亡的調(diào)節(jié)作用完全取決于上下文關(guān)系。不同研究中細胞的分子背景不同,可能是引起這種“相互矛盾”結(jié)果的原因之一。
p53是重要的抑癌基因,它在細胞凋亡和自噬的調(diào)節(jié)
16、中均發(fā)揮重要作用?;罨膒53在胞核中作為轉(zhuǎn)錄因子,能轉(zhuǎn)錄激活多種促凋亡靶基因;而胞漿中活化的p53能夠在線粒體與多種促凋亡分子、抑制凋亡分子相互作用,最終促進細胞凋亡。p53對自噬調(diào)節(jié)也因研究背景的不同而呈現(xiàn)雙向性,之前的研究認為,活化的p53在胞核中能夠激活促自噬相關(guān)分子的轉(zhuǎn)錄,然而最近的研究發(fā)現(xiàn),持續(xù)的DNA損傷能夠誘導(dǎo)p53轉(zhuǎn)錄激活自噬抑制分子FBXL20;胞漿中非活化的p53通過抑制自噬小體的形成發(fā)揮抑制自噬的作用。因此,我們
17、猜想p53在自噬對凋亡的雙重調(diào)節(jié)中可能發(fā)揮重要的作用。
泛素蛋白酶體途徑是細胞內(nèi)另一個重要的細胞內(nèi)物質(zhì)降解通路,而蛋白酶體抑制劑能在多種腫瘤細胞中引起自噬和凋亡。因此,我們使用蛋白酶體抑制劑處理肝臟惡性腫瘤細胞。發(fā)現(xiàn),其同樣能引起自噬和凋亡。然而,我們預(yù)先激活自噬后,再使用蛋白酶抑制劑處理,細胞的凋亡程度出現(xiàn)明顯分化。隨后我們發(fā)現(xiàn)p53的狀態(tài)可能是引起這種分化的原因之一。
研究方法:
1.蛋白酶體抑制劑MG
18、132處理肝臟腫瘤細胞,Western blot檢測p62的表達,LC3-Ⅰ向LC3-Ⅱ的轉(zhuǎn)化以及熒光顯微鏡觀察GFP-LC3顆粒的形成,反應(yīng)MG132對肝臟腫瘤細胞自噬的調(diào)節(jié)。
2.MG132處理細胞后,Western blot檢測PARR以及PARP cleavage的表達,反應(yīng)MG132對肝臟腫瘤細胞凋亡的調(diào)節(jié)。
3.EBSS處理細胞預(yù)激活自噬,再使用MG132刺激細胞,檢測PARP、PARPcleavage的
19、表達以及熒光顯微鏡觀察PI染色情況,判斷預(yù)激活自噬對MG132所誘導(dǎo)凋亡的影響。
4.Western blot檢測MG132作用下細胞內(nèi)與自噬、凋亡相關(guān)分子的變化情況。
5.對預(yù)激活自噬反應(yīng)差異的細胞中p53的鑒定,CHX抑制翻譯檢測p53半衰期,直接測序法鑒定p53是否突變,使用DNA損傷性藥物Dox檢測不同狀態(tài)p53的反應(yīng),使用DNA結(jié)合區(qū)外位點的磷酸化p53抗體檢測突變對于突變區(qū)外磷酸化位點的影響。
20、6.Western blot檢測預(yù)激活自噬對于突變型p53蛋白的影響。
7.MG132所引起突變型p53降解的原因,Western blot檢測自噬抑制劑對于突變型p53蛋白的影響,溶酶體探針檢測MG132對溶酶體的調(diào)節(jié),RT-PCR檢測MG132作用下p53的轉(zhuǎn)錄是否受到影響。
研究結(jié)果:
1.MG132作用下,肝母細胞瘤細胞HepG2、Huh6以及肝細胞癌細胞SMMC7721、Huh7的自噬均被激活。<
21、br> 2.MG132促進了肝臟腫瘤細胞發(fā)生凋亡。
3.EBSS處理預(yù)激活自噬,再使用MG132刺激,HepG2細胞和SMMC7721細胞的凋亡增多,而Huh6細胞和Huh7細胞的凋亡減少。
4.檢測相關(guān)分子變化后我們發(fā)現(xiàn)在上述兩組細胞中,MG132作用下p53蛋白變化情況正好相反。
5.HepG2細胞和SMMC7721細胞中為野生型p53,而Huh6細胞和Huh7細胞中的p53在DNA結(jié)合區(qū)發(fā)生了點突變
22、(Huh6-A159D,Huh7-Y220C)。
6.預(yù)激活自噬明顯逆轉(zhuǎn)了MG132所誘導(dǎo)的突變型p53的降解。
7.MG132作用下突變型p53蛋白降解可能依賴于溶酶體功能的超激活,以及MG132對于p53的轉(zhuǎn)錄抑制。
結(jié)論:本研究使用蛋白酶體抑制劑MG132處理肝臟腫瘤細胞,發(fā)現(xiàn)其能激活自噬并誘導(dǎo)細胞凋亡。預(yù)激活自噬后,再使用MG132刺激細胞,細胞的凋亡出現(xiàn)明顯分化,其中HepG2細胞和SMMC772
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