天然二倍體與四倍體泥鰍細胞色素b序列的比較和多樣性分析.pdf

1、本研究以泥鰍Misgurnus anguillicaudaats為研究對象，對天然二倍體泥鰍和四倍體泥鰍細胞色素b基因序列進行了比較，探討其進化關系。另外增加研究了泥鰍的分子地理學分布。主要內(nèi)容如下： 1.湖北省天然二倍體泥鰍與四倍體泥鰍的細胞色素b序列比較和進化分析。通過對天然二倍體泥鰍與四倍體泥鰍的細胞色素b序列進行擴增、測序，結果顯示所測泥鰍樣本細胞色素b基因大小均為1140bp，在1140個堿基位點中，45個變異位點，其

2、中二倍體之間有23個變異位點，四倍體之間有14個變異位點。由二倍體泥鰍和四倍體泥鰍Cyt b基因序列推導氨基酸序列，均獲得380個氨基酸。通過比對，樣本間有18個氨基酸發(fā)生替代，其中10個發(fā)生在二倍體之間，8個發(fā)生在四倍體之間。在所有泥鰍樣本中，核苷酸兩兩序列間的遺傳距離變化范圍為0.001-0.378(包括外群)，去除外群，二倍體與四倍體之間的遺傳距離變化范圍為0.001-0.025。經(jīng)AMOVA分析，二倍體之間(Fst=0.2529

3、，p>0.05)和四倍體之間均無明顯差異(Fst=0.0564，p>0.05)，但是二倍體與四倍體之間有明顯差異(Fst=0.7634，P<0.05)。 利用Cyt b基因構建二倍體泥鰍和四倍體泥鰍的NJ(鄰接法)分子系統(tǒng)發(fā)育樹和MP(最大簡約法)分子系統(tǒng)發(fā)育樹，兩個系統(tǒng)樹具有相似的拓撲結構和置信度。在系統(tǒng)樹中，二倍體泥鰍與四倍體泥鰍明顯處于兩個分枝，二倍體泥鰍(恩施、陽新、天門、十堰、秭歸)為一枝，四倍體泥鰍(武漢、孝感、赤壁

4、、沙市)為另一枝，二倍體泥鰍在進化樹的底端，而四倍體泥鰍在進化樹的頂端。這表明在自然界中，二倍體泥鰍的存在早于四倍體泥鰍，四倍體泥鰍可能是由二倍體泥鰍進化而來。這是第一次通過mtDNA Cyt b基因研究天然多倍體泥鰍的進化關系。 2.泥鰍的分子生物地理學分布。本實驗除以湖北省泥鰍為樣品外，還增加了湖南、山東、重慶等省的泥鰍為樣品。通過對泥鰍樣品Cyt b基因序列擴增、測序，結果顯示所測泥鰍樣本細胞色素b基因大小也為1140bp