家兔POMC和UCP2基因對生長性狀、屠體性狀和部分肉質性狀的遺傳效應研究.pdf

1、家兔的體重和生長速度取決于采食和能量消耗之間的平衡，同時，出欄體重與生長速度對胴體質量和兔肉品質具有顯著影響，因此，涉及采食和能量消耗兩大生理生化過程的基因有可能與家兔生長性狀、屠體性狀和肉質性狀相關聯。減食欲神經肽阿黑皮素原基因(Pro-opiomelanocortin，POMC)和解偶聯蛋白2基因（uncoupling protein2，UCP2）分別涉及采食和能量消耗兩大過程。本試驗以伊拉兔、香檳兔、天府黑兔、新西蘭兔和歐洲大白兔

2、共計797個樣本為材料（其中，伊拉兔、香檳兔和天府黑兔測定生長性狀、屠體性狀和肉質性狀，新西蘭兔和歐洲大白兔只測定生長性狀），以POMC和UCP2為候選基因，采用直接測序法尋找兩個基因編碼區(qū)的遺傳變異，研究候選SNPs與家兔部分生產性狀的關聯性，并對UCP2基因mRNA相對表達量進行了分析，研究結果如下:
　　1.在POMC基因外顯子2上檢測到一個同義突變c.498 T＞G，在內含子1上檢測到一個突變位點c.112-12 G＞T。

3、多態(tài)性分析表明，c.498 T＞G在伊拉兔、香檳兔和天府黑兔三個品種中均只檢測到GT和GG兩種基因型，且表現為低度多態(tài)(PIC＜0.25); c.112-12 G＞T在伊拉兔、香檳兔和天府黑兔三個品種中檢測到GG、GT和TT三種基因型，且均表現為中度多態(tài)(0.25＜PIC＜0.50)。x2檢驗表明，兩個位點均處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)(P＞0.05)。
　　2.POMC基因c.112-12 G＞T位點對伊拉兔、香檳兔

4、和天府黑兔的84日齡體重、全凈膛重和半凈膛重的遺傳效應達到顯著水平(P＜0.05)，其中，TT基因型的84日齡體重、全凈膛重和半凈膛重均顯著高于GT基因型（P＜0.05）;雖然該位點對熟肉率的遺傳效應沒有達到顯著水平，但多重比較的結果表明，TT基因型的熟肉率顯著高于GG基因型(P＜0.05); c.498 T＞G位點對家兔生產性狀的遺傳效應均沒有達到顯著水平(P＞0.05)。
　　3.在UCP2基因中一共檢測到14個變異位點，其中

5、6個為位于編碼區(qū)的同義突變:c.72 G＞A（外顯子1，Ala，GCG＞GCA）;c.129 T＞C(外顯子2，Ile，ATT＞ATC); c.249 A＞G(外顯子2，Val，GTA＞GTG); c.252 T＞C(外顯子2，Ala，GCT＞GCC); c.300 T＞C（外顯子2，Tyr，TAT＞TAC）;c.546 C＞A(外顯子4，Pro，CCC＞CCA)。蛋白質結構域預測發(fā)現，6個SNPs均位于Solcar結構域，其中，c.7

6、2 G＞A與c.129 T＞C位于第一個跨膜螺旋結構域，c.249 A＞G; c.252 T＞C和c.300 T＞C位于第二個跨膜螺旋結構域中，c.546 C＞A位于第四個跨膜螺旋結構域。連鎖不平衡分析顯示，c.72 G＞A與其余5個SNPs位點連鎖程度非常強(r2≥0.55)，說明該位點與其余5個位點具有相近的遺傳效應，最終選擇c.72 G＞A位點進行后續(xù)研究。
　　4.UCP2基因c.72 G＞A位點在5個家兔品種中均表現為中

7、度多態(tài)(0.25＜PIC＜0.50);x2檢驗表明，c.72 G＞A位點在伊拉兔、香檳兔和天府黑兔中處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)(P＞0.05)，而在新西蘭兔和歐洲大白兔兩個品種中嚴重偏離Hardy-Weinberg平衡（P＜0.01）。
　　5.關聯分析表明，UCP2基因c.72 G＞A位點在伊拉兔、香檳兔和天府黑兔三個品種中對70日齡體重、84日齡體重、全凈膛重、半凈膛重和肌肉24小時pH的遺傳效應達到極顯著水平(

8、P＜0.01)，對平均日增重、半凈膛屠宰率的遺傳效應達到顯著水平(P＜0.05)。其中，AA和AG基因型的70日齡體重、84日齡體重、全凈膛重和半凈膛重極顯著高于GG基因型(P＜0.01)，AA和AG基因型的平均日增重和半凈膛屠宰率顯著高于GG基因型(P＜0.05)，GG基因型個體的背最長肌肌肉24小時pH極顯著高于AA和AG基因型(P＜0.01)，GG基因型個體的后腿肌肌肉24小時pH顯著高于AA和AG基因型(P＜0.05)。同時，c

9、.72 G＞A位點與新西蘭兔和歐洲大白兔的56日齡體重、70日齡體重以及35-70日齡的平均日增重顯著相關。其中，在新西蘭兔群體中，AA基因型的56日齡體重、70日齡體重和35-70日齡的平均日增重極顯著高于AG和GG基因型(P＜0.01);在歐洲大白兔中，AA基因型個體的56日齡體重顯著高于AG基因型(P＜0.05)，極顯著高于GG基因型(P＜0.01)，AA基因型個體的70日齡體重極顯著高于AG和GG基因型（P＜0.01），35-7

10、0日齡平均日增重AA基因型顯著高于GG基因型(P＜0.05)。
　　6.mRNA相對表達量分析表明，新西蘭兔UCP2基因在肝臟組織中的mRNA表達量隨著日齡的增加呈現逐漸下降的趨勢，其中，35日齡的表達量（2.2750±0.251）極顯著高于56日齡（1.3702±0.272，P=0.01）和70日齡的表達量（0.8109±0.266，P=0.001）;而56日齡的mRNA表達量顯著高于70日齡(P=0.029)。c.72 G＞A