利用微衛(wèi)星DNA標(biāo)記分析貴州三種地方豬的遺傳多樣性.pdf

1、根據(jù)聯(lián)合國(guó)糧農(nóng)組織(FAO)和國(guó)際動(dòng)物遺傳學(xué)會(huì)(ISAG)聯(lián)合推薦的27對(duì)豬微衛(wèi)星引物，通過(guò)查閱有關(guān)資料從中篩選出能用于貴州地方豬研究的6對(duì)引物(S0155，SW240，IGF1，SW951，SW857，SW24)，用以對(duì)糯谷豬等3個(gè)貴州地方豬群體進(jìn)行了微衛(wèi)星DNA檢測(cè)，進(jìn)而對(duì)糯谷豬等三個(gè)地方豬種資源進(jìn)行遺傳多樣性研究分析，從而為糯谷豬的品種鑒定，保護(hù)，開(kāi)發(fā)利用提供依據(jù)。得到主要結(jié)果如下： 1、從3個(gè)貴州地方豬群體的6個(gè)微衛(wèi)星座

2、位上共檢測(cè)到43個(gè)等位基因，其中共享等位基因16個(gè)，非共享等位基因27。各等位基因頻率介于0.0089-0.5241。 2、3個(gè)群體在6個(gè)微衛(wèi)星座位上的多態(tài)座位百分比均達(dá)100％，其觀察雜合度、期望雜合度、NEI氏期望雜合度分別為0.9278±0.2109、0.7987±0.0294、0.7975±0.0287，平均雜合度0.7605±O.0318。 3、本研究得到的糯谷豬的平均基因多樣性(GD=0.707)和Shann

3、on指數(shù)(SI=1.431)在三種豬中是最高的，三品種(類(lèi)型)豬GD在0.611-0.689之間，SI在1.112-1.342之間；平均有效等位基因5.3±0.9513個(gè)，平均多態(tài)信息含量(PIC)0.7196±0.0417，三品種(類(lèi)型)豬呈高度多態(tài)(PIC>0.5)，說(shuō)明貴州地方豬遺傳多樣性十分豐富。 4、本研究得到的NEI氏標(biāo)準(zhǔn)遺傳距離介于0.2063-0.4815，群體間遺傳距離最遠(yuǎn)的是關(guān)嶺豬與糯谷豬，最近的是柯樂(lè)豬與糯

4、谷豬。遺傳相似系數(shù)則介于0.7346-0.9050 5、綜合群體遺傳多樣性的五個(gè)指標(biāo)：平均等位基因數(shù)，有效等位基因數(shù)，基因多樣性，多態(tài)信息含量和Shannon指數(shù)可知，群體遺傳變異與大到小排列順序?yàn)椋宏P(guān)嶺豬，柯樂(lè)豬，糯谷豬。根據(jù)奈氏遺傳距離及奈氏標(biāo)準(zhǔn)距離，繪制三種(類(lèi)型)豬的NJ及UPGMA聚類(lèi)圖，結(jié)果顯示：糯谷豬與柯樂(lè)豬聚為一類(lèi)，關(guān)嶺豬屬于另一類(lèi)。 6、根據(jù)貴州地方豬遺傳多樣性豐富，遺傳雜合度較高的結(jié)果，以及我省豬種資