毛蚶群體遺傳學(xué)研究.pdf

1、毛蚶（Scapharca kagoshimensis）是廣泛分布在西北太平洋近海的埋棲型貝類，具有較高的經(jīng)濟(jì)價(jià)值，一直是我國傳統(tǒng)的漁業(yè)捕撈對象。由于在很長一段時(shí)間內(nèi)，我國毛蚶的資源量相對比較豐富，對于毛蚶群體遺傳學(xué)方面的研究遲遲沒有得到關(guān)注。但隨著中國近年來經(jīng)濟(jì)的發(fā)展以及城市現(xiàn)代化的推進(jìn)，沿岸生態(tài)系統(tǒng)以及淺海貝類的棲息環(huán)境均受到了較大的挑戰(zhàn)，保護(hù)漁業(yè)對象的自然資源，已經(jīng)成為了一個(gè)較為緊迫的議題。毛蚶的人工育苗和養(yǎng)殖生產(chǎn)在我國已經(jīng)開展了一

2、段時(shí)間，人工繁育群體的遺傳多樣性是否降低也逐漸成為一個(gè)備受關(guān)注的問題。此外，為了更好的在育苗生成過程中做到有的放矢，借助分子生物學(xué)的技術(shù)手段，研究苗種繁育過程中有效繁殖群體的大小，親代和子代之間遺傳多樣性的變化以及近交系數(shù)，對于今后健康苗種培育，推動毛蚶養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)具有重要的指導(dǎo)意義。為此，本研究開展了如下幾方面的工作:
　　1.毛蚶微衛(wèi)星標(biāo)記開發(fā)及其在家系分析中的應(yīng)用
　　首先，利用磁珠富集法，構(gòu)建微衛(wèi)星富集文庫，從中挑選了1

3、96個(gè)克隆用于測序，得到41個(gè)具備多態(tài)性的微衛(wèi)星位點(diǎn)。根據(jù)位點(diǎn)等位基因的范圍，引物的退火溫度以及反應(yīng)條件等要素，從41個(gè)位點(diǎn)中篩選出20個(gè)，成功開發(fā)出7組微衛(wèi)星多元PCR體系。利用TP-M13-SSR技術(shù)，對這些標(biāo)記進(jìn)行群體分析，結(jié)果顯示位點(diǎn)的等位基因范圍為5-26，位點(diǎn)的平均等位基因數(shù)為15.2。期望雜合度和觀測雜合度的范圍分別為0.733-0.960和0.563-0.886。經(jīng)過序列化的Bonferroni校正后，共有兩個(gè)位點(diǎn)偏離哈

4、迪-溫伯格平衡，所有位點(diǎn)中均未檢測出連鎖不平衡。
　　2.毛蚶地理群體遺傳學(xué)研究
　　使用線粒體COI序列標(biāo)記，檢測了我國近海海域12個(gè)毛蚶地理群體的群體遺傳結(jié)構(gòu)。研究結(jié)果發(fā)現(xiàn)以長江口為界毛蚶地理群體存在兩個(gè)進(jìn)化顯著單元(ESU)，這兩個(gè)ESU之間具有顯著的遺傳差異，每一個(gè)ESU又可被進(jìn)一步分為兩個(gè)次單倍型群。兩兩配對ΦST及IBDW分析結(jié)果顯示，毛蚶地理群體呈現(xiàn)大而顯著的群體遺傳結(jié)構(gòu)模式，并存在顯著的距離遺傳模式。這些證據(jù)

5、表明，目前我國沿海毛蚶自然種群的遺傳格局，主要是歷史因素造成的，各個(gè)譜系之間已經(jīng)形成了較為深刻的遺傳分化。長江河口的淡水流入，可能是阻斷毛蚶自然種群之間的基因流并長久維持這種歷史格局的的主要因素。
　　3.毛蚶養(yǎng)殖和野生群體遺傳多樣性比較研究
　　使用10個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記，選擇毛蚶的5個(gè)養(yǎng)殖群體以及2個(gè)野生群體的開展了相關(guān)的研究。研究結(jié)果表明，同野生群體相比，養(yǎng)殖群體并沒有出現(xiàn)顯著的遺傳多樣性水平的下降。FsT檢驗(yàn)結(jié)果以及遺傳距

6、離(DC)計(jì)算結(jié)果，均顯示養(yǎng)殖群體和野生群體之間存在較為顯著的遺傳分化，在養(yǎng)殖群體內(nèi)部不同地域的群體，在遺傳結(jié)構(gòu)上也出現(xiàn)了顯著的分化。這些研究結(jié)果表明，采用大數(shù)目的親本繁殖規(guī)?？赡苁鞘沟妹鲤B(yǎng)殖群體遺傳多樣性得以維系的主要原因之一。
　　4.毛蚶養(yǎng)殖群體有效繁殖群體的研究
　　使用8個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記對一個(gè)8雄7雌的毛蚶混交家系進(jìn)行分析，比較了親本和子代的遺傳多樣性變化，以此來推斷毛蚶的有效繁殖群體大小。研究結(jié)果顯示，親本和子代的