三種跨膜蛋白預(yù)測(cè)算法的實(shí)現(xiàn)及比較.pdf

1、跨膜蛋白的預(yù)測(cè)算法是指一個(gè)專門用于預(yù)測(cè)一條蛋白質(zhì)序列中跨膜片段的數(shù)量的算法。根據(jù)對(duì)跨膜蛋白跨膜區(qū)的大量數(shù)據(jù)分析，特別是跨膜蛋白的拓?fù)鋵W(xué)結(jié)構(gòu)上的大量分析，找出了運(yùn)用生物信息學(xué)解決膜蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)問(wèn)題的關(guān)鍵所在，再運(yùn)用這些分析結(jié)果寫(xiě)出針對(duì)不同蛋白質(zhì)(疏水性，水容性等)的跨膜區(qū)的預(yù)測(cè)算法。并且把這些預(yù)測(cè)算法以軟件形式實(shí)現(xiàn)，方便查詢。如給出一個(gè)未知跨膜片段的蛋白質(zhì)序列，把這個(gè)蛋白質(zhì)序列輸入到用預(yù)測(cè)算法做出的軟件中，得到下面的這些結(jié)果：這條蛋白質(zhì)序

2、列有幾個(gè)跨膜片段，每個(gè)跨膜片段的起止位置和一些相關(guān)系數(shù)。 隨著社會(huì)的發(fā)展和科學(xué)的進(jìn)步，計(jì)算機(jī)在各個(gè)傳統(tǒng)學(xué)術(shù)領(lǐng)域得到了空前的運(yùn)用，各種相關(guān)軟件的開(kāi)發(fā)掀起了一股熱潮。而本片論文所討論的跨膜蛋白的預(yù)測(cè)算法正是用MATLAB語(yǔ)言來(lái)開(kāi)發(fā)編寫(xiě)的，旨在為廣大的科學(xué)工作者提供一個(gè)更便捷、規(guī)范、易于操作的蛋白質(zhì)領(lǐng)域跨膜區(qū)預(yù)測(cè)的查詢工具。因此無(wú)論科研還是應(yīng)用，都具有很重要的意義。 特別是在四川大學(xué)化學(xué)信息中心正在建立基于集群服務(wù)器和Web的

3、化學(xué)遠(yuǎn)程計(jì)算平臺(tái)的背景下，將跨膜蛋白的預(yù)測(cè)算法架構(gòu)于該平臺(tái)上，讓用戶通過(guò)遠(yuǎn)程訪問(wèn)的方式進(jìn)行對(duì)蛋白質(zhì)序列跨膜區(qū)數(shù)量的預(yù)測(cè)，由于平臺(tái)的共享和開(kāi)放的，用戶可以通過(guò)Web方便的訪問(wèn)。 綜上所述本文主要研究成果如下： 1.通過(guò)對(duì)相關(guān)知識(shí)的學(xué)習(xí)，分析了跨膜蛋白預(yù)測(cè)算法在現(xiàn)今的重要意義。 2.通過(guò)查閱預(yù)測(cè)算法的文獻(xiàn)，重新構(gòu)建了三種經(jīng)典的預(yù)測(cè)算法。并具體的分析了這三種預(yù)測(cè)算法的實(shí)現(xiàn)步驟和測(cè)試結(jié)果及其討論。 3.通過(guò)MAT