天然產(chǎn)物分離的分子動(dòng)力學(xué)模擬研究.pdf

1、本研究采用分子動(dòng)力學(xué)模擬，對(duì)大孔樹(shù)脂D101分離人參皂苷Rg1的機(jī)理，以及碳納米管的特性進(jìn)行了模擬研究。所使用的模擬軟件為GROMACS軟件包，除此之外，還使用了很多輔助的分析軟件，如Accelrys viewerpro，Tinker，Nanotube Modeler等。大孔樹(shù)脂D101常用于人參皂苷Rg1的分離以提高分離效果。為了更有效地研究人參皂苷Rg1的分離機(jī)理，我們對(duì)水體系中的D101，人參皂苷Rg1和蔗糖進(jìn)行了分子動(dòng)力學(xué)模擬。

2、首先我們研究了D101的四種同分異構(gòu)體并選出了最優(yōu)結(jié)構(gòu)。我們用結(jié)構(gòu)因子RDF來(lái)分析Rg1的吸附機(jī)理及整個(gè)體系的穩(wěn)定構(gòu)象。我們研究了不同的雜質(zhì)濃度，不同體系溫度（300，330和360K），不同壓力（1.0，2.0，3.0和4.0 bar）對(duì)體系的吸附的影響。我們發(fā)現(xiàn)低濃度雜質(zhì)有利于吸附，高濃度反而會(huì)破壞D101和人參皂苷Rg1之間的吸附平衡，這與實(shí)驗(yàn)的結(jié)果是一致的；低溫環(huán)境中，D101與Rg1間的結(jié)合能遠(yuǎn)遠(yuǎn)強(qiáng)于D101與蔗糖間的結(jié)合能，

3、并且能量很穩(wěn)定；在低壓環(huán)境中，體系在4ns左右就可以到達(dá)平衡，隨著壓力升高，能量差增大但是同時(shí)到達(dá)平時(shí)的時(shí)間也增長(zhǎng)，所以我們認(rèn)為：適當(dāng)?shù)母邏菏怯欣赗g1分離的。這些模擬數(shù)據(jù)與實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)有很好的一致性。 本文在對(duì)碳納米管特性的研究中，將碳納米管置于水中，發(fā)現(xiàn)水分子會(huì)進(jìn)入碳納米管的空腔內(nèi)，并且在碳納米管的空腔內(nèi)規(guī)則地排列成一行，在碳納米管的外壁則會(huì)形成了一個(gè)疏水的環(huán)境，環(huán)繞碳納米管外壁一圈；在正己烷體系中也有類似的性質(zhì)。在混合氣體的