鮈亞科魚類的分子系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系研究.pdf

1、鮈亞科Gobioninae魚類隸屬于輻鰭魚綱Actinopterygii、真骨魚部Teleostei、骨鰾總目Ostariophysi、鯉形目Cypriniformes、鯉科Cyprinidae,包括30屬201種，主要分布在東亞。關(guān)于鮈亞科魚類的系統(tǒng)發(fā)育位置，形態(tài)與分子證據(jù)的研究間沒有取得一致的結(jié)論，但是分子證據(jù)的研究均強(qiáng)烈支持鮈亞科、鱊亞科Acheilognathinae、丁鱥亞科Tincinae、雅羅魚亞科Leuciscinae與

2、Oxygastrinae亞科魚類形成單系群，但是這些亞科間魚類的關(guān)系沒有解析清楚。關(guān)于鮈亞科魚類屬間系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系，基于形態(tài)學(xué)證據(jù)的研究主要是對(duì)鮈亞科魚類進(jìn)行了大類群的劃分，然而沒有取得一致的結(jié)論?；诜肿幼C據(jù)的研究強(qiáng)烈地支持‘(鯖)屬Hemibarbus+銀鮈屬Squalidus’譜系以及鮈族Gobionini是單源群，然而鳈族Sarcocheilichthyini魚類的單系性則缺乏統(tǒng)計(jì)支持度。
　　因此，本論文聚焦于解析鮈亞科魚

3、類的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系亟需解決的兩個(gè)問題:1)鮈亞科在鯉科魚類中的系統(tǒng)發(fā)育位置。2）鮈亞科魚類內(nèi)部各屬之間的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。本研究基于線粒體基因組全序列與核基因多位點(diǎn)的分子證據(jù)，重建了鮈亞科魚類的分子系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。
　　主要研究結(jié)果如下:
　　1、鮈亞科魚類的系統(tǒng)發(fā)育位置
　　基于12個(gè)核基因的多位點(diǎn)證據(jù)，重建了鮈亞科、鱊亞科、丁鱥亞科、雅羅魚亞科、Oxygastrinae亞科魚類之間的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。結(jié)果表明:基于核基因聯(lián)合數(shù)

4、據(jù)集的最大似然法分析和貝葉斯分析，得到了相同的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)（圖2-1）。結(jié)果表明:1）支持鮈亞科為單源群;2）鮈亞科與鱊亞科魚類形成姊妹群關(guān)系，它們一起是丁鱥亞科丁鱥屬Tinca魚類的姊妹群;3）雅羅魚亞科與丁鱥亞科唐魚屬Tanichthys魚類形成姊妹群關(guān)系，它們一起是鮈亞科+鱊亞科+丁鱥亞科丁鱥屬魚類的姊妹群;4）鮈亞科、鱊亞科、丁鱥亞科與雅羅魚亞科魚類一起是Oxygastrinae亞科魚類的姊妹群。
　　2.基于線粒體基因組全序

5、列的鮈亞科魚類屬間系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系基于線粒體基因組全序列證據(jù)，本研究重建了鮈亞科魚類屬間系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。結(jié)果表明:1）鮈亞科魚類可分成3個(gè)譜系:‘(鯖)屬+銀鮈屬’譜系位于基部，鳈族與鮈族魚類形成姊妹群關(guān)系;2）‘(鳙)屬+銀鮈屬譜系’包括(鳙)屬與銀鮈屬;3)在水族內(nèi)部，‘麥穗魚屬Pseudorasbora十扁吻鮈屬Pungtungia+擬扁吻鮈屬Pseudopungtungia’魚類一起形成單系群，它們一起與吻鮈屬Rhinogobio魚類

6、形成姊妹群關(guān)系;鳈屬Sarcocheilichthys與似刺鳊鮈屬Paracanthobrama魚類形成姊妹群關(guān)系，它們一起是‘頜須鮈屬Gnathopogon十鮈鯽屬Gobiocypris十高麗雅羅魚屬Coreoleuciscus’魚類的姊妹群;4）在鮈族內(nèi)部，銅魚屬Coreius魚類位于基部，平口鮈屬Ladislavia魚類位于次基部，鮈屬魚類與所有保留的鮈族魚類形成姊妹群關(guān)系;鰍鮀屬Gobiobotia與異鰾鰍鮀屬Xenophyso

7、gobio魚類形成姊妹群關(guān)系，它們一起是小鰾鮈屬M(fèi)icrophysogobio、琵琶鮈屬Biwia、突吻鮈屬Rostrogobio、胡鮈屬Huigobio、片唇鮈屬Platysmacheilus、似鮈屬Pseudogobio、棒花魚屬Abbottina與蛇鮈屬Saurogobio的姊妹群。
　　3.基于核基因多位點(diǎn)證據(jù)的鮈亞科魚類屬間系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系
　　基于15個(gè)核基因的多位點(diǎn)證據(jù)，本研究獲得了解析清楚的鮈亞科魚類屬間系統(tǒng)發(fā)育

8、關(guān)系。結(jié)果表明:1）鮈亞科魚類可分成4個(gè)譜系:‘(鯖)屬+銀鮈屬'譜系位于基部，鳈族與鮈族魚類形成姊妹群關(guān)系，它們一起是‘銅魚屬+吻鮈屬’譜系的姊妹群。2）(鯧)屬-銀鮈屬譜系內(nèi)部，似(鯖)屬嵌套在(鯧)屬內(nèi)部，它們一起是銀鮈屬魚類的姊妹群;3）‘銅魚屬+吻鮈屬’譜系包括銅魚屬和吻鮈屬;4）在鳈族魚類內(nèi)部，頜須鮈屬是鮈鯽屬魚類的姊妹群，它們一起位于基部，‘扁吻鮈屬+擬扁吻鮈屬+麥穗魚屬’以及‘鳈屬+高麗雅羅魚屬十似刺鳊鮈屬’魚類各自形成

9、單系群，它們相互之間形成姊妹群關(guān)系;5）在鮈族魚類內(nèi)部，平口鮈屬魚類位于基部;鮈屬與羅馬諾鮈屬魚類形成姊妹群關(guān)系，它們一起位于次基部;鰍鮀屬與異鰾鰍鮀屬魚類形成姊妹群關(guān)系，它們一起與所有保留的鮈族魚類形成姊妹群關(guān)系;‘小鰾鮈屬+突吻鮈屬+琵琶鮈屬+片唇鮈屬’魚類一起形成單系群，它們一起是胡鮈屬魚類的姊妹群;‘小鰾鮈屬+突吻鮈屬+琵琶鮈屬+片唇鮈屬+胡鮈屬’魚類一起是棒花魚屬魚類的姊妹群，它們一起與蛇鮈屬魚類形成姊妹群關(guān)系;小鰾鮈屬、突吻