蕪菁花葉病毒與煙草脈帶花葉病毒全基因組序列測定及分析.pdf

1、蕪菁花葉病毒(Turnip mosaic virus, TuMV)、煙草脈帶花葉病毒(Tobacco vein banding mosaic virus, TVBMV)和甜菜花葉病毒(Beet mosaic virus, BtMV)均為世界性分布的病毒,分別是危害十字花科蔬菜、茄科作物和藜科植物的主要病毒。本研究克隆了2個TuMV分離物和1個TVBMV分離物的全基因組序列,分析了這2種馬鈴薯Y病毒屬病毒的分子變異情況,并首次報道了BtM

2、V能自然侵染萵苣。 蕪菁花葉病毒(TuMV)： 從山東泰安和濰坊的蘿卜上分離得到2個TuMV分離物WFLB06和TANX2,測定了它們的全基因組序列。生物學實驗表明2個TuMV分離物均屬于BR致病型,能同時侵染蕓薹屬和蘿卜屬植物,系統(tǒng)進化樹分析表明它們均屬于basal-BR組,這是中國basal-BR組分離物全基因組序列的首次報道。 通過RDP重組軟件進行分析,發(fā)現(xiàn)這2個TuMV分離物均存在多次重組。其中WFLB

3、06分離物是發(fā)生在P1基因、NIb基因和CI基因上的basal-BR與Asian-BR譜系間的重組,TANX2分離物是發(fā)生在P1基因、6K2基因、VPg基因上的basal-BR譜系內(nèi)的重組。而且,這2種重組類型均是與先前報道的37種類型不同的新的重組類型。 核苷酸及氨基酸的一致率比較發(fā)現(xiàn),中國和日本分離物來源于相同的種群,中國的TuMV basal-BR組的分離物可能來源于日本。分析中國TuMV分離物的遺傳多樣性,發(fā)現(xiàn)中國TuM

4、V分離物的編碼區(qū)在進化過程中氨基酸非常保守,處于負向或純化選擇。 煙草脈帶花葉病毒(TVBMV)： 本研究獲得了我國煙草脈帶花葉病毒主流株系代表分離物HN39的全基因組序列,HN39的全基因組序列為9570個核苷酸,這是世界上獲得的TVBMV的第二個全基因組序列。 TVBMV-HN39全基因組序列與水茄花葉病毒(Wild tomato mosaicvirus,WTMV)一致率最高,基因組的不同區(qū)段與不同馬鈴薯Y病

5、毒屬病毒的相應(yīng)區(qū)段有最高的序列一致率,說明TVBMV-HN39的不同基因可能由不同的祖先進化而來。 甜菜花葉病毒(BtMV)： 從泰安郊區(qū)菜田中表現(xiàn)花葉、矮化的萵苣病株上得到病毒分離物SD,血清學檢測結(jié)果表明SD分離物是馬鈴薯Y病毒屬病毒。利用馬鈴薯Y病毒屬病毒的簡并引物,通過RT-PCR技術(shù)獲得了其3'-端約1.7 kb片段。Blast分析證明該分離物為BtMV。Western blotting結(jié)果進一步證實了這一結(jié)論