分子對接研究神經(jīng)氨酸酶與3-(3-戊氧基)安息香酸作用機制.pdf

1、流行性感冒是由流感病毒引起的上呼吸道疾病,每年有數(shù)百萬人受到流感病毒感染。近來,全球范圍內(nèi)爆發(fā)的H1N1流感即屬于其中的一個亞型,由于人類對流感病毒普遍缺乏免疫力以及H1N1亞型流感對人類的高致病率,世界衛(wèi)生組織(World Health Organization,WHO)認為這是對人類存在的潛在威脅之一。截至目前為止,人類對流感病毒一直缺乏安全有效的防控手段,使得抗流感病毒藥物研究成為當前藥學研究的一個熱點。
　　 分子對接是

2、計算機輔助藥物設(shè)計方法之一,是目前國內(nèi)外前沿課題,具有多學科綜合交叉的特點。利用計算機模式識別和優(yōu)化技術(shù),在現(xiàn)有結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫中搜索能與特定藥物作用靶點在幾何和化學上相匹配的分子,實現(xiàn)計算機輔助藥物篩選,節(jié)省了大部分化合物合成試驗時間和購買以及實際生物測試的花費,很大程度上加快了新藥研發(fā)的過程并降低了研發(fā)成本。
　　 本文運用分子對接和分子動力學方法,深入研究了4-(氮-乙酰氨基)-5-胍基-3-(3-戊氧基)安息香酸(BA)與各類

3、型神經(jīng)氨酸酶(N1、N2、N9亞型和B型)間的作用機制。并得出相關(guān)結(jié)論,4-(氮-乙酰氨基)-5-胍基-3-(3-戊氧基)安息香酸(BA)與各類型神經(jīng)氨酸酶結(jié)合模式存在差異,但作用機制比較相似,與它們的活性腔均匹配良好,并可以形成穩(wěn)定的復(fù)合體系,最大結(jié)合能分別為-295.12、-331.51、-158.64、-253.33 kcal·mol-1。這表明BA對各類型神經(jīng)氨酸酶均有良好的抑制效果。經(jīng)進一步研究分析發(fā)現(xiàn),4-(氮-乙酰氨基)-

4、5-胍基-3-(3-戊氧基)安息香酸(BA)與各類型神經(jīng)氨酸酶活性腔內(nèi)保守關(guān)鍵氨基酸殘基發(fā)生較強的靜電和氫鍵作用,而與易突變氨基酸殘基作用較弱,表明了活性腔內(nèi)易突變氨基酸殘基發(fā)生突變也不會對抑制效果造成明顯影響。因此,4-(氮-乙酰氨基)-5-胍基-3-(3-戊氧基)安息香酸(BA)是一種極具應(yīng)用前景的新型抗流感病毒藥物。結(jié)合以前的研究結(jié)果,我們提出了以4-(氮-乙酰氨基)-5-胍基-3-(3-戊氧基)安息香酸(BA)為底物的抗流感病毒