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文檔簡介
1、目的:
研究脊髓小腦性共濟(jì)失調(diào)3型/馬查多-約瑟夫病(spinocerebellarataxia type3/Machado-Joseph disease,SCA3/MJD)患者外周血單個(gè)核細(xì)胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMCs)中ATXN基因啟動(dòng)子區(qū)DNA甲基化水平,研究ATXN3基因啟動(dòng)子區(qū)DNA甲基化水平與CAG重復(fù)序列拷貝數(shù)、SCA3/MJD發(fā)病年齡及ATXN3基因mRN
2、A表達(dá)水平之間的相關(guān)性。
方法:
共收集71個(gè)SCA3/MJD家系的141例患者作為本研究的病例組和112例健康個(gè)體作為對(duì)照組。采用密度梯度離心分離SCA3/MJD患者和正常人的PBMCs;采用重亞硫酸鹽測(cè)序法(bisulfite genomicsequencing PCR,BSP)檢測(cè)ATXN3基因啟動(dòng)子區(qū)2個(gè)CpG島的DNA甲基化水平;采用T載體克隆測(cè)序檢測(cè)SCA3/MJD患者ATXN3基因的CAG重復(fù)序列拷貝數(shù)
3、;采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR(real-timequantitative PCR,qRT-PCR)方法檢測(cè)ATXN3 mRNA的表達(dá)水平。
結(jié)果:
1.通過BSP技術(shù)驗(yàn)證了ATXN3基因啟動(dòng)子區(qū)2個(gè)CpG島的甲基化水平,CpG島1(距離轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)較遠(yuǎn))呈高甲基化水平,CpG島2(距離轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)較近)呈低甲基化水平。
2.SCA3/MJD病例組ATXN3基因啟動(dòng)子區(qū)CpG島1的甲基化水平較對(duì)照組明顯(82.6
4、1±3.97 vs78.97±2.22,p=0.00);所收集的71個(gè)SCA3/MJD家系中,有7個(gè)家系的同一親代有多個(gè)子代,且子代的CAG重復(fù)序列拷貝數(shù)相同,其中6個(gè)家系中發(fā)病年齡早的患者較發(fā)病年齡晚的甲基化水平偏高。
3.SCA3/MJD病例組中,有CAG重復(fù)序列動(dòng)態(tài)突變家系中的親代較未出現(xiàn)動(dòng)態(tài)突變家系親代,ATXN3基因啟動(dòng)子區(qū)DNA甲基化水平偏高(86.04±2.68 vs80.04±2.8, p=0.00)。
5、 4.SCA3/MJD病例組與對(duì)照組的ATXN3基因mRNA水平無明顯差異(0.51±0.25 vs0.46±0.19,p=0.27),mRNA水平與ATXN3基因啟動(dòng)子區(qū)DNA甲基化水平無相關(guān)性。
結(jié)論:
1.首次利用BSP技術(shù)驗(yàn)證了ATXN3基因啟動(dòng)子區(qū)2個(gè)CpG島的甲基化水平,島1呈高甲基化水平,島2呈低甲基化水平。
2.ATXN3基因啟動(dòng)子區(qū)DNA甲基化水平與SCA3/MJD患者的遺傳早現(xiàn)有關(guān)。<
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