BioLab面向生物計算服務的網(wǎng)格系統(tǒng).pdf

1、生物信息學已成為能夠改變科學發(fā)展的決定性力量之一，網(wǎng)格計算為生物信息應用提供了強大的計算和存儲平臺。然而，網(wǎng)格應用首先需要解決服務集成、資源異構(gòu)、作業(yè)管理和調(diào)度等問題，同時向生物學家屏蔽上述復雜的底層實現(xiàn)。一個可行的方法是建立一個Web門戶作為中間媒介。
　　本文介紹了一個在網(wǎng)格環(huán)境下的生物門戶站點BioLab項目，系統(tǒng)定義了服務的提供者、部署者和使用者三種用戶角色；設計了網(wǎng)格環(huán)境下的服務和資源整合機制，實現(xiàn)了用戶管理以及作業(yè)調(diào)度

2、控制等功能；同時，系統(tǒng)提供了標準Web Service的接口，增加擴展性。
　　我們分析了啟發(fā)式調(diào)度算法，選擇在線調(diào)度而非批處理調(diào)度以提高系統(tǒng)響應速度。實驗表明，在較大的作業(yè)平均到達時間條件下，非阻塞的調(diào)度方式的作業(yè)總完成時間比阻塞的調(diào)度方式??；當作業(yè)平均到達時間增加時，作業(yè)總運行時間也會增加，但速度會變緩；在較小的作業(yè)平均到達時間條件下，各種在線調(diào)度啟發(fā)式算法差別不大，而在較大的作業(yè)平均到達時間條件下，隨機性好的隨機調(diào)度算法和最