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文檔簡介
1、鏈霉菌是一種典型的革蘭氏陽性菌,它復雜的胞外生化過程涉及數(shù)量巨大的分泌蛋白和膜蛋白,這些數(shù)量巨大、種類繁多的蛋白必須以高效、精確的方式在合適的時間運送到合適的位置,因此鏈霉菌的蛋白轉運體系是高度進化的,對鏈霉菌蛋白轉運體系的深入了解具有重要的科學意義和應用價值。
目前鏈霉菌轉運體系的一些基礎特征仍不清晰,阻礙了對轉運效率及調控方式的深入研究。本論文圍繞信號識別顆粒(SRP)介導的蛋白轉運途徑,從進化和結構角度進行生物信息學
2、研究,揭示鏈霉菌高效轉運機制分子特征,并深入闡述了鏈霉菌SRP受體FtsY的膜定位機制。研究結果得出如下結論:1)通過分枝及位點特異的進化壓力分析觀察到鏈霉菌Ffh蛋白在進化歷程早期受到位點特異的正向選擇壓力,這些正向選擇的位點大多位于信號肽識別區(qū)域,F(xiàn)fh信號識別區(qū)的正選擇可能受信號肽階段性高速演化驅使,這一信號肽識別機制的高度進化是鏈霉菌SRP途徑高效精確轉運的可能原因。2)利用蛋白質對接技術,建立了核糖體、新生肽鏈、4.5S RN
3、A、Ffh、FtsY、SecYEG轉運孔道多方相互作用的理論三維結構模型,提出了大腸桿菌FtsY膜定位機制的假設.通過比較天藍色鏈霉菌FtsY和大腸桿菌FtsY在關鍵區(qū)域的差異,最終提出了鏈霉菌FtsY A結構域在膜定位中發(fā)揮不同功能的假說。3)利用膜蛋白分離和Mal-PEG標記技術,分析了鏈霉菌FtsY的A結構域膜定位功能,A結構域N端強疏水區(qū)對于FtsY的膜定位能力有顯著影響,這一區(qū)域可能以穿膜或半穿膜的形式穩(wěn)定與膜結合的FtsY。
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