個(gè)人基因組數(shù)據(jù)可視化研究與實(shí)現(xiàn).pdf

1、隨著測(cè)序成本的下降,測(cè)序數(shù)據(jù)越來(lái)越多,以后每個(gè)人都會(huì)有自己的基因組數(shù)據(jù),個(gè)人基因組時(shí)代即將到來(lái)。而這個(gè)時(shí)候限制基因組研究不在是數(shù)據(jù)的產(chǎn)生,而是數(shù)據(jù)的分析,基因組數(shù)據(jù)可視化工具有利于研究人員理解基因組數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)之間的關(guān)系。特別是對(duì)個(gè)人基因組數(shù)據(jù)的分析,可以為每一個(gè)人提供一些關(guān)于個(gè)人的信息。
　　現(xiàn)有的可視化系統(tǒng)分為web-based和local兩種形式,由于基因組數(shù)據(jù)量特別大,存儲(chǔ)在個(gè)人PC機(jī)上非常占用空間,這些數(shù)據(jù)一般都存在服

2、務(wù)器端,而且網(wǎng)絡(luò)帶寬不斷增大,所以本系統(tǒng)采用web-based結(jié)構(gòu),這也符合當(dāng)前的“云時(shí)代”。
　　可視化工作是在前端完成的,把大量的計(jì)算分配給用戶的電腦,減輕服務(wù)器端的負(fù)載,用canvas技術(shù)實(shí)現(xiàn)。本系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)了人類(lèi)基因組數(shù)據(jù)、序列比對(duì)結(jié)果數(shù)據(jù)、基因注釋數(shù)據(jù)、變異數(shù)據(jù)和數(shù)值類(lèi)型的數(shù)據(jù)在不同模式的可視化。并且這些模式可以根據(jù)查看的范圍的自動(dòng)進(jìn)行轉(zhuǎn)換,具有語(yǔ)義化的特點(diǎn)。
　　本系統(tǒng)對(duì)于個(gè)人基因組數(shù)據(jù)的可視化是以個(gè)人的變異數(shù)據(jù)為中