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文檔簡介
1、螺旋藻、節(jié)旋藻系藍(lán)藻門(Cyanophyta),段殖藻目(Hormogonales),顫藻科(Oscilatoraceae),是光合自養(yǎng)型原核微生物。人們借助于16S rRNA、16S-23S rRNA(ITS區(qū))、cpcB、cpcA、hoxY、psbA、cpcE-F等基因序列分析,發(fā)現(xiàn)螺旋藻、節(jié)旋藻在屬水平上具有明顯差別,認(rèn)為螺旋藻、節(jié)旋藻應(yīng)為獨立的兩個屬。但關(guān)于種定義的問題仍在爭論。本實驗室在獲得大量新藻株的基礎(chǔ)上,欲采用多相分類方
2、法,構(gòu)建相對完善的螺旋藻、節(jié)旋藻種屬分類系統(tǒng)。課題組成員首先基于16S rRNA基因、ITS區(qū)、rpoC1基因、cpcB基因、psbA基因、hoxY基因序列分別構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,均支持螺旋藻、節(jié)旋藻獨立為兩個不同屬的觀點。但是,個別藻株的歸屬不穩(wěn)定,且屬內(nèi)藻株的基因序列相似性較高,無法確定不同種。因此為了驗證基于基因序列分類的準(zhǔn)確性,進(jìn)一步尋找種水平分類的靶標(biāo)分子,本課題以渤海海濱濕的螺旋藻、節(jié)旋藻藻株為研究對象,檢測其脂肪酸組成及含量,
3、通過聚類分析尋找特征脂肪酸,并以脂肪酸為標(biāo)記進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析,豐富螺旋藻、節(jié)旋藻的分類依據(jù)和方法,以期獲得更能反映藻株親緣關(guān)系的分類結(jié)果。
本研究主要內(nèi)容包括:⑴藻株的分離純化:從在渤海海濱濕地及其周邊水域采集的水樣中,分離純化獲得34株單藻絲純種,擴(kuò)大了本研究的樣本量,并對其進(jìn)行形態(tài)特征進(jìn)行了研究;⑵脂肪酸檢測方法的建立:首先對比了VF-23MS與HP-88兩種色譜柱對37種脂肪酸甲酯的分離效果,選取了能將37種脂肪酸甲酯有
4、效分離的HP-88色譜柱,并確立了最優(yōu)色譜條件,即進(jìn)樣口:加熱器250℃,分流比8:1;控制模式為流速控制,流速為0.5mL/min,柱前壓19.783psi;升溫程序:初始溫度100℃,保持4min,以8℃/min上升至175℃,保持7min,然后以1℃/min上升至186℃,保持3min,最后以5℃/min升至230℃,保持30min;檢測器溫度(FID)260℃。其次,在脂質(zhì)萃取過程中,考察了不同溶劑的萃取效果,依據(jù)脂質(zhì)提取率和色
5、譜圖質(zhì)量,最終確定正己烷為提取藻株脂肪酸的萃取溶劑。再次,Central Composite響應(yīng)面優(yōu)化螺旋藻脂肪酸提取條件,建立回歸模型,獲得優(yōu)化方案,即超聲時間21min,水浴時間93min,催化劑濃度1.8%,甲酯化溫度70℃,在此優(yōu)化條件下進(jìn)行6次平行試驗,得到平均峰面積為31008.1667,與理論值相比,其平均偏差為5.59%。最后,對整個實驗方法進(jìn)行加標(biāo)回收率實驗,在最優(yōu)實驗條件下回收率為94.56%~103.23%,表明該
6、方法回收率比較穩(wěn)定,為后續(xù)的脂肪酸檢測提供了依據(jù);⑶螺旋藻、節(jié)旋藻藻株分類:應(yīng)用本研究建立的檢測方法對84株供試藻株進(jìn)行脂肪酸提取、氣相色譜分析,最后通過聚類分析,尋找可用于螺旋藻(節(jié)旋藻)屬種類的脂肪酸生物標(biāo)記。研究表明:F-351、F-1070兩藻株不含C18:3n6,結(jié)合基于16S rRNA基因、ITS區(qū)等分子方法的聚類結(jié)果,進(jìn)一步支持節(jié)旋藻、螺旋藻兩屬之間的差異性脂肪酸成分為γ-亞麻酸的觀點;節(jié)旋藻屬脂肪酸組分除含有γ-亞麻酸(
7、C18:3n6)這一特征組分外,均有高含量的C16:0;另外,大部分藻株也含有C16:1、C18:0、C18:1n9c、C18:2n6c;以10個脂肪酸統(tǒng)計參數(shù)為指標(biāo)對節(jié)旋藻屬藻株進(jìn)行聚類分析,將81個供試藻株劃分為5個脂肪群;并通過聚類分群分析發(fā)現(xiàn),以脂肪酸為標(biāo)記的分類結(jié)果與基于 psbA基因序列的聚類結(jié)果存在一定的一致性;依據(jù)脂肪酸分析,修正藻株TJBC3的分類地位,該藻株應(yīng)歸為螺旋藻屬;針對基于psbA基因序列及聯(lián)合基因分析提出的
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