IRF-5基因多態(tài)性與系統(tǒng)性紅斑狼瘡的相關(guān)性研究.pdf_第1頁(yè)
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1、目的:干擾素調(diào)節(jié)因子(interferon regulation factor,IRF)家族是與干擾素基因的順式元件及ISG序列中的干擾素刺激性反應(yīng)元件(IFN-stimulatedresponse element,ISRE)相互作用,可調(diào)節(jié)干擾素及干擾素相關(guān)誘導(dǎo)基因的表達(dá)的一類(lèi)轉(zhuǎn)錄因子,IRF家族和IFN是調(diào)控存在相互性,有研究證明IRF-5在系統(tǒng)性紅斑狼瘡發(fā)病中可能有重要作用,其多態(tài)性存在種族差異。本研究針對(duì)山東省漢族人群IRF-5

2、基因rs2004640、RF-5基因rs10954213等位點(diǎn)的單核苷酸多態(tài)性進(jìn)行分析,探究IRF5基因和誘發(fā)系統(tǒng)性紅斑狼瘡的相關(guān)性:(1)檢測(cè)山東漢族IRF-5基因rs2004640位點(diǎn)單核苷酸多態(tài)性的分布情況,并分析其與SLE易感性之間的關(guān)系。(2)檢測(cè)山東漢族IRF-5基因rs10954213位點(diǎn)單核苷酸多態(tài)性的分布情況,并分析其與SLE易感性之間的關(guān)系。
   方法:實(shí)驗(yàn)組:收集92例SLE患者來(lái)自2007年4月至200

3、8年11月月青島市市立醫(yī)院門(mén)診及住院病人,92例病例均為按1997年美國(guó)風(fēng)濕病學(xué)會(huì)指定的SLE診斷標(biāo)準(zhǔn)確診病例,正常對(duì)照組:88例,排除糖尿病、類(lèi)風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎、腎小球腎炎、系統(tǒng)性紅斑狼瘡等自身免疫病的青島市立醫(yī)院健康體檢者,對(duì)照組人員之間均無(wú)親緣關(guān)系,均為山東漢族。各組樣本分離外周血單個(gè)核細(xì)胞后,采用UltraPure基因組DNA快速提取試劑盒(Promega公司)提取基因組DNA;參照序列GenBank中IRF-5的DNA序列(編號(hào)為

4、NC000007.12)用primer5.0設(shè)計(jì)引物;PCR擴(kuò)增IRF-5基因rs2004640、rs10954213位點(diǎn)相關(guān)序列,產(chǎn)物純化后分別采用內(nèi)切酶TaiⅠ酶、FspBⅠ酶進(jìn)行酶切,然后進(jìn)行限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(RFLP)分析,并計(jì)算基因型和等位基因頻率。
   結(jié)果:(1)SLE患者IRF5基因rs200464位點(diǎn)基因型有GG、GT、TT三種類(lèi)型,其基因型頻率分別是0.198、0.521和0.281,等位基因G的頻率為

5、0.402,等位基因T的頻率為0.598;對(duì)照組三種基因型的頻率分別是0.214、0.487和0.299,等位基因G和T的頻率分別0.705和0.295。兩組基因型及等位基因構(gòu)成比差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(x2=8.73,P<0.05;x2=7.41,P<0.01);(2)IRF5基因rs109542位點(diǎn)基因型有GG、GA,AAZ種類(lèi)型,其基因型頻率分別是0.163、0.457和0.380,等位基因G的頻率為0.391,等位基因A的頻率為0.6

6、09;對(duì)照組三種基因型的頻率分別是0.318、0.409和0.273,等位基因G和A的頻率分別0.602和0.398。兩組基因型及等位基因構(gòu)成比差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(x2=6.36,P<0.05;x2=6.26,P<0.05);
   結(jié)論:IRF-5基因rs2004640在山東漢族人群存在單核苷酸多態(tài)性,可能為SLE的易感基因;IRF-5基因rs10954213在山東漢族人群存在單核苷酸多態(tài)性,可能為SLE的易感基因。
  

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