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1、運(yùn)用線粒體DNA中編碼rRNA蛋白質(zhì)的基因16S rRNA作為分子標(biāo)記,選取半翅目Hemiptera蝽科Pentatominae蝽亞科Pentatominae7族18屬22個代表種,共27個個體對其親緣關(guān)系進(jìn)行初步研究.通過特異引物擴(kuò)增和基因測序的研究方法獲得它們的線粒體DNA(mtDNA)的16S rRNA基因片段,并分析了其遺傳多態(tài)性.在擴(kuò)增的長為400bp的基因片段中,去掉兩端引物,通過排序,有350個堿基可用于這27個個體的比較
2、.通過測定分析該基因片段的序列發(fā)現(xiàn),27個個體具有27種基因型,不同種群存在豐富的DNA序列多態(tài)性,同一種的不同個體差異較小.DNA序列應(yīng)用ClustalX1.8、DnaSP、Bioedit5.09、MEGA軟件進(jìn)行排序、比較和分析,并計算核苷酸組成、多態(tài)性位點(diǎn)以及遺傳距離,用鄰位相連法構(gòu)建Neighbor-joining(NJ)系統(tǒng)進(jìn)化樹,從而確定各類群之間的系統(tǒng)關(guān)系.通過分析得出以下結(jié)論:1.在國內(nèi)首次使用特異引物擴(kuò)增蝽亞科昆蟲的m
3、tDNA-16S rRNA基因片段,通過測序獲得了蝽亞科7族18屬22種27個個體的基因序列片段.研究發(fā)現(xiàn)16S rRNA基因片段適合于族、屬之間親緣關(guān)系的研究.2.無水乙醇浸制標(biāo)本可應(yīng)用于總DNA的提取、16S rRNA基因片段的特異引物擴(kuò)增、提純和測序.3.該實(shí)驗中,標(biāo)本DNA的輕微降解不影響實(shí)驗結(jié)果.4.在擴(kuò)增的16S rRNA基因片段中,共檢測到核苷酸變異位點(diǎn)191個,占總序列的54.57%,除去具缺失或插入的位點(diǎn)后,序列變異為
4、42.57%.A、T、C、G的平均含量為33.84%、43.24%、6.78%、16.14%,A+T的含量為77.08%,G+C的含量為22.92%,這一結(jié)果與昆蟲中A+T的含量高于G+C的含量這一結(jié)論是一致的.5.以"Bootstrap Test of Phylogeny"1000次重復(fù)作出各個分枝的置信度.形成的Neighbor-Joining(NJ)、Minimum Evolution(ME)和Maximum Parsimony(
5、MP)分子系統(tǒng)樹表明,NJ樹的置信度最高.6.以蝽亞科昆蟲27個個體的16S rRNA基因序列構(gòu)建的分子系統(tǒng)樹顯示:麻皮蝽屬與菜蝽屬的遺傳關(guān)系較近,二者位于進(jìn)化樹的底部,說明這兩個種比其它類群起源較早;綠蝽屬和碧蝽屬的親緣關(guān)系比較近,二者又與玉蝽屬互為姐妹群;條蝽屬與斑須蝽屬互為姐妹群;二星蝽屬與輝蝽屬的親緣關(guān)系較近,之后二者又與卵圓蝽屬互為姐妹群;蝽族的真蝽屬與岱蝽屬的關(guān)系比全蝽屬的親緣關(guān)系近,全蝽屬與格蝽屬互為姐妹群.這與傳統(tǒng)分類中
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