多性狀聯(lián)合定位小鼠焦慮相關(guān)QTLs.pdf

1、發(fā)展用于定位復(fù)雜性狀基因有效的統(tǒng)計(jì)方法是一項(xiàng)很有挑戰(zhàn)性的工作。新的定位軟件OTLNetwork V2.2，是基于分子標(biāo)記多態(tài)性定位數(shù)量性狀基因座(QTLs)，基于單核苷酸多態(tài)性定位數(shù)量性狀核苷酸(QTSs)和基于連續(xù)變異表達(dá)值定位數(shù)量性狀表達(dá)譜(QTTS)的三種定位策略開(kāi)發(fā)的，用以檢測(cè)主效基因和上位性基因的位置，估計(jì)各種遺傳效應(yīng)以及預(yù)測(cè)它們與環(huán)境互作效應(yīng)。軟件還可研究多個(gè)數(shù)量性狀的基因定位問(wèn)題。本論文以一組由C57BL/6J和DBA/2

2、J組合衍生的重組自交系數(shù)據(jù)來(lái)驗(yàn)證以上新方法的可行性和有效性。本論文共分三章，主要內(nèi)容概括如下：
　　 第一章為數(shù)量遺傳學(xué)QTL定位的背景和文獻(xiàn)綜述。
　　 第二章進(jìn)行了BXD近交系小鼠的Marker、SNP和表達(dá)譜數(shù)據(jù)的定位分析。用506個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記，QTL方法定位探測(cè)到8個(gè)QTLs，包括3個(gè)主效QTLs(h2=0.27)和3對(duì)上位性QTLs(h2=0.23)。用2320個(gè)SNP標(biāo)記，QTS方法定位探測(cè)到17個(gè)QTSs，

3、包括7個(gè)主效QTSs(h2=0.25)和6對(duì)上位性QTSs(h2=0.22).表達(dá)譜數(shù)據(jù)采用小樣本群體(5種處理下的188個(gè)體)定位，只探測(cè)到1個(gè)主效QTT(h2=0.07)和2對(duì)效應(yīng)微小的上位性QTTs。比較第1條和第11條染色體上三種方法的探測(cè)結(jié)果，發(fā)現(xiàn)3個(gè)主效QTSs正好落在3個(gè)QTLs的區(qū)間內(nèi)，而QTTs的位置與第一條染色體上QTL位置相匹配。通過(guò)實(shí)例分析驗(yàn)證了方法的可行性和有效性。
　　 第三章是多性狀聯(lián)合定位小鼠焦慮

4、相關(guān)QTLs。利用GeneNetwork公共平臺(tái)的BXD近交系小鼠數(shù)據(jù)，對(duì)小鼠71個(gè)品系的528個(gè)體的焦慮相關(guān)性狀用QTLNetwork v2.2軟件進(jìn)行多性狀QTL定位分析。研究控制多性狀的數(shù)量性狀基因座(QTL)，分析主效和上位性QTL，以及主效和上位性與環(huán)境的互作。通過(guò)對(duì)小鼠數(shù)據(jù)的QTL定位分析和蒙特卡羅模擬，結(jié)果表明：如果性狀間存在較強(qiáng)的遺傳相關(guān)，多性狀聯(lián)合定位能提高統(tǒng)計(jì)功效和參數(shù)估計(jì)的精確性，也能有效鑒定基因的一因多效和基因的