原核生物基因及基因組結(jié)構(gòu)分析.pdf

1、隨著大規(guī)模基因組測序計(jì)劃的實(shí)施，大量原核和真核生物的基因組已被測定。在基因和基因組水平上分析這些序列的結(jié)構(gòu)特征是亟待解決的問題。原核生物基因組較小，結(jié)構(gòu)簡單，是研究生物大分子遺傳特征的首選對象。本論文主要用非線性映射算法討論原核生物基因和基因組的結(jié)構(gòu)特征，并簡單介紹古細(xì)菌復(fù)制起始點(diǎn)的識別問題。 論文第一章主要闡述生物信息學(xué)的含義，并簡單介紹與所研究內(nèi)容相關(guān)的最新進(jìn)展。 論文第二章重點(diǎn)介紹論文中涉及的生物學(xué)背景知識，闡明了

2、生物信息傳遞的中心法則，DNA分子的半保留復(fù)制以及半不連續(xù)復(fù)制，密碼子的基本特征等。 論文第三章主要介紹多元統(tǒng)計(jì)的有關(guān)知識。多元統(tǒng)計(jì)方法是解決復(fù)雜高維問題的十分有效的工具。論文中重點(diǎn)介紹了該種方法的降維思想，以及用主成分分析方法、對應(yīng)分析方法和非線性映射方法解決問題的步驟。 論文第四章重點(diǎn)介紹用非線性映射方法分析原核生物基因密碼子使用情況并得到的相關(guān)結(jié)論。結(jié)果顯示，高表達(dá)基因的密碼子使用在分布上和其它基因有明顯的差異，這