動(dòng)靜態(tài)基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建方法研究與分析.pdf

1、挖掘基因之間的相互作用以及基因?qū)τ谕饨绛h(huán)境變化的響應(yīng)機(jī)制，可以幫助人們更好地認(rèn)識生命現(xiàn)象，揭示生命本質(zhì)。
　　本文主要針對動(dòng)靜態(tài)基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建方法進(jìn)行研究。動(dòng)態(tài)網(wǎng)絡(luò)的研究能夠幫助人們深入把握系統(tǒng)的動(dòng)態(tài)特征，了解基因之間的相互作用機(jī)制以及基因?qū)τ诩?xì)胞或組織功能進(jìn)行調(diào)控的機(jī)理。本文提出了一種基于多源信息融合的狀態(tài)空間模型(Multi-source Information Fusion State-Space Model，MIF-S

2、SM）。該模型采用變分貝葉斯(Variance Bayes)方法，有效地防止了對隱狀態(tài)維數(shù)的過高估計(jì)。在此基礎(chǔ)上，將轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點(diǎn)作為狀態(tài)空間模型參數(shù)的先驗(yàn)分布，融入到基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的推斷中。最后，采用T細(xì)胞活化實(shí)驗(yàn)的真實(shí)數(shù)據(jù)進(jìn)行實(shí)驗(yàn)，通過對比加入轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)信息和不加位點(diǎn)信息的構(gòu)建狀況，證明了基于多源信息融合的狀態(tài)空間模型可以大大提高基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建的準(zhǔn)確性。通過靜態(tài)基因網(wǎng)絡(luò)的分析，人們能夠了解到生物系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)。當(dāng)前應(yīng)用于基因表