對不同的G四聯(lián)體的可折疊原理的理論研究.pdf

1、DNA的G四聯(lián)體結(jié)構(gòu)是一種核酸的非經(jīng)典二級結(jié)構(gòu)，它被發(fā)現(xiàn)與上世紀(jì)六十年代，但是有關(guān)G四聯(lián)體的研究興起于上世紀(jì)九十年代后。很多研究證明發(fā)現(xiàn)，G四聯(lián)體存在于生物體內(nèi)的DNA和RNA中，具有很大的重要生物學(xué)的意義。由于科學(xué)技術(shù)的不斷提高，許多生物大分子模擬的方法被大量研發(fā)了出來，其中利用最為廣泛的模擬方法是分子動力學(xué)模擬。但是在本文中為了計(jì)算的便捷，本文采用了全原子Go模型進(jìn)行分子動力學(xué)的模擬實(shí)驗(yàn)。
　　DNA的G四聯(lián)體折疊的研究在最近

2、幾年中有了很大的發(fā)展，研究折疊原理的主要問題是研究G四聯(lián)體的折疊機(jī)制。文章介紹的全原子Go模型是一個先進(jìn)的粒子模型研究體系，因?yàn)楸疚难芯康氖遣煌腄NA的G四聯(lián)體的折疊，在人體的端粒序列中，通過鳥嘌呤堆積起來的G四聯(lián)體是一個很有希望的抗癌的目標(biāo)。在本文的研究中，使用的是以能量為背景的折疊原理來說明凝血酶適體和兩種人工的DNA的G四聯(lián)體的折疊過程的原理。本文通過三種DNA的折疊過程的圖像研究，在恒定的溫度狀態(tài)下，通過不同時間段的折疊過程，

3、在折疊態(tài)、變性態(tài)和過渡態(tài)產(chǎn)生不同的能量圖像，然后進(jìn)行分析研究。本文運(yùn)用全原子Go模型對三種不同的G四聯(lián)體進(jìn)行理論分析計(jì)算，產(chǎn)生自由能圖像后，對均方根偏差、徑向分布函數(shù)、距離以及相對接觸距離和兩個G三聯(lián)體自然接觸函數(shù)圖進(jìn)行了分析與比較。得到的圖像與實(shí)驗(yàn)的研究相差不是很大，比較符合實(shí)際。
　　雖然本文運(yùn)用的全原子Go模型進(jìn)行研究后得到的成果比較符合實(shí)際，但是通過和實(shí)驗(yàn)所產(chǎn)生的數(shù)據(jù)相比還是有一定的差距，全原子Go模型的運(yùn)用和研究與其他的