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文檔簡介
1、目的:定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)篩選胃粘膜非典型增生(GMAH)間質(zhì)蛋白質(zhì),了解微環(huán)境在胃癌早期發(fā)病過程中的作用機(jī)制。
方法:
1.采用激光捕獲顯微切割(LCM)技術(shù),分別純化正常胃粘膜組織(NGM)和GMAH組織間質(zhì),獲取高純度的NGM和GMAH間質(zhì),經(jīng)同位素標(biāo)記(iTRAQ),二維液相色譜聯(lián)用質(zhì)譜(2D LC-MS/MS)技術(shù)分析,鑒定NGM和GMAH組織間質(zhì)之間的差異表達(dá)蛋白質(zhì)。
2.利用生物信息學(xué)軟件分析N
2、GM和GMAH間質(zhì)之間蛋白質(zhì)的相互作用。
3.采用Western-blot與免疫組織化學(xué)染色分析差異表達(dá)蛋白質(zhì)在NGM與GMAH組織中的表達(dá)。
結(jié)果:
1.本研究采用定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)總共鑒定出GMAH間質(zhì)蛋白質(zhì)165個(gè),其中GMAH組織中表達(dá)上調(diào)者99個(gè),下調(diào)者66個(gè)。
2. GMAH間質(zhì)蛋白質(zhì)涉及一些與腫瘤相關(guān)的信號通路,如p53信號通路、MAPK信號通路、細(xì)胞周期與凋亡等;GMAH間質(zhì)蛋白質(zhì)
3、與細(xì)胞生長、增殖、代謝、凋亡、翻譯、代謝、運(yùn)輸、定位和體液免疫應(yīng)答等生物學(xué)過程有關(guān),它們在STRING網(wǎng)絡(luò)中呈現(xiàn)相互節(jié)點(diǎn),兩兩間相互聯(lián)系。
3.經(jīng)Western-blot與免疫組織化學(xué)染色證實(shí)S100A6和SOD3蛋白質(zhì)在GMAH組織中表達(dá)存在差異,其中SOD3蛋白在GMAH組織中低表達(dá),而S100A6蛋白高表達(dá)。
結(jié)論:采用激光捕獲顯微切割結(jié)合定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),篩選了165個(gè)GMAH間質(zhì)表達(dá)蛋白質(zhì),其中上調(diào)者99
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