云南、河南兩省日本三角渦蟲(chóng)基于mtDNA COI基因片段的分子系統(tǒng)學(xué)研究.pdf_第1頁(yè)
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文檔簡(jiǎn)介

1、本文利用PCR等技術(shù)對(duì)河南、云南兩省二十一產(chǎn)地淡水多目日本三角渦蟲(chóng)線(xiàn)粒體DNA細(xì)胞色素C氧化酶Ⅰ亞基(cytochrome C oxidase subunit I,COI)基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增、克隆和測(cè)序,通過(guò)生物信息學(xué)方法用Clustal X1.80和Mega4.0程序?qū)ζ溥M(jìn)行序列比對(duì)和系統(tǒng)樹(shù)構(gòu)建,利用UPGMA、ME、NJ、MP統(tǒng)計(jì)軟件構(gòu)建了支序圖,并對(duì)其系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系進(jìn)行了初步探討。
　　 結(jié)果：表明:UPGMA樹(shù)、ME樹(shù)、N

2、J樹(shù)、MP樹(shù)四種支序圖顯示的結(jié)果基本一致。其中,采自河南省大別山系商城縣的兩個(gè)種群XYshangcheng1和XYshangcheng2的COI片段序列同源性最高為一個(gè)聚類(lèi)枝(Ⅱ);采自云南省四個(gè)城市的LClancang1、DLnanjianw11、Yxchengjiang和DLnanjianw12為一個(gè)大的聚類(lèi)枝(Ⅰ);而采自河南省信陽(yáng)固始的Xygushi和新鄉(xiāng)衛(wèi)輝的Xxweihui卻與云南省保山的Bsbanqiao和麗江的Ljyul

3、ongxueshan為一個(gè)聚類(lèi)枝(Ⅲ);LClancang2、BSbanqiao2和Xyxinxian為一個(gè)聚類(lèi)枝(Ⅳ)。但聚枝的先后順序在使用不同構(gòu)樹(shù)方法時(shí)有差異,聚類(lèi)枝(Ⅰ)和(Ⅱ)都與地理分布相一致,而聚類(lèi)枝(Ⅲ)中的Xxweihui和聚類(lèi)枝(Ⅳ)中的Xyxinxian與云南省其他種群聚為一枝。
　　 結(jié)果：提示:二十一產(chǎn)地日本三角渦蟲(chóng)大部分在支序圖中的位置與其形態(tài)學(xué)資料反映出的系統(tǒng)演化關(guān)系一致,說(shuō)明用線(xiàn)粒體DNA細(xì)胞色素

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