三種藥用紅樹植物rDNA ITS序列的初步研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、遵義醫(yī)學(xué)院碩士學(xué)位論文三種藥用紅樹植物rDNAITS序列的初步研究姓名:吳群申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別:碩士專業(yè):生物化學(xué)與分子生物學(xué)指導(dǎo)教師:姬可平20090501遵豎匡堂院亟堂位!僉塞三社葒廈紅撾植物£Q盥△墮S莊到的勿壟班究ThepreliminarystudyonrDNAITSsequencesofthreekindsofmedicinalmangroveplantsAbstract:Objective:Tostudythegeneticch

2、aracterofITSsequencesofmedicinalmangroveplantsfromdifferentsourcesandtosetupspecificationsoftheidentificationofgermplasmresourcesofmedicinalmangroveplantsonthemolecularlevel,throughsequencingandcontrastingtherDNAITSofthr

3、eekindsofmedicinalmangroveplantsfromZhuhaiandHainancalledKandeliacandel,AcanthusilicifolicusandAegicerascorniculatumMethods:(1)ThegenomicDNAofKandeliacandel,AcanthusilicifolicusandAegicerascorniculatumfromZhuhaiandHainan

4、WaSextractedbymodifiedCTABmethod(2)TherDNAITSwasamplifiedbynPCRwitheukaryoticconsensusprimers(3)PCRproductswerepuriedwithaPCRpurificationkit,andthensendthepurifiedproductstothesequencingcompany(4)Thesequencingresultswere

5、analyzedbythesoftwarecalledClustralXinordertofoundoutthedifferencesofITSsequencesofthethreekindsofmangroveplantsfromdifferentsources(5)TherDNAITSsequencesofKandeliacandel,AcanthusilicifolicusandAegicerascorniculatumweres

6、ubmittedtoGenBankResults:(1)UsingthemodifiedCTABmethod,thefragmentsofKandeliacandel,AcanthusilicifolicusandAegicerascOrniculatumDNAwereabout23kb,theeletrophresisbandswereintegrityandtheirOD260/2aowerebetween162and185,whi

7、chmeettherequestofPCRmodel(2)TheelectrophoresisbandpicturesofITSlandITS2sequenceswereclearandthelengthwerebetween200bpand400bp(3)TheelectrophoresisbandpicturesofthepuriedPCRproductswereclear(4)ThelengthoftherDNAITSsequen

8、cesofKandeliacandelAcanthusilicifolicusandAegicerascorniculatumwere598bp,647bpand653bpfromZhuhaiandwere600bp,636bpand653bpfromHainan,respectively(5)TherDNAITSsequencesofKandeliacandel,AcanthusilicifolicusandAegicerascorn

9、iculatumfromZhuhaiandHainanhave32,51and13variablesites,20,15and6insertion(ordeletion)sites,respectively(6)TheGenBanksubmissionnumbersofrDNAITSsequencesofKandeliacandelareFJ976670(zhuhai)andGQl41551(Hainan);Acanthusilicif

10、olicusareFJ976671(Zhuhai)andGQl41552(Hainan);AegicerascorniculatumareFJ976668(Zhuhai)andFJ976669(Hainan)Conclusion:TherDNAITSsequencesofKandeliacandeLAcanthusilicifolicusandAegicerascorniculatumwereobtainedforthefirsttim

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