撰寫國家自然科學基金申請書的幾點體會

1、李 奎 中國農業(yè)科學院北京畜牧獸醫(yī)研究所,撰寫國家自然科學基金申請書的幾點體會-兼論課題組長在基金申報中的作用 (個人觀點、個人理解，不能作為依據(jù)，僅供參考）,第一部分 撰寫申請書的體會,國家自然科學基金申報評審程序（申報人角度）,,形式審查,專家函評 （ 海外專家）,基金委根據(jù)專家點評結果確定會評項目,會議評審（答辯）,基金委確定資助項目,一、國家自然科學基金申報評審程序,二、仔細研究基金委當年指南確定

2、申請類型,面上項目 青年基金 地區(qū)基金 重點項目 重大研究計劃 地區(qū)聯(lián)合基金 優(yōu)青 杰青 創(chuàng)新 海外及港澳青年合作基金 國際合作,,國家自然科學基金項目分類,【注】：（1）不同項目有不同的寫法，種類很多機會也很多，認真研究指南確定 重要申報類型。 （2）重

3、點項目、重大研究計劃、地區(qū)聯(lián)合基金、重大國際合作，按 指南申報，首先是爭取立項，寫入指南。,三、選擇申報學科（不同學科，不同寫作思路）,選擇自己人脈廣的學科；選擇專業(yè)對口的學科；選擇自己有優(yōu)勢的學科；慎重選擇兩個學科（主、輔學科）；同一課題組相近項目最好選擇不同學科；根據(jù)學科調整寫作思路。,四、全面了解基金項目評審要點,2012年度指南中指出： 生命科學部一直堅持積極鼓勵開展具有創(chuàng)新性

4、學術思想和新技術、新方法的研究，尤其是對原創(chuàng)性的，對學科發(fā)展有重要推動作用的項目申請，或是在長期研究基礎上提出的新理論、新假說和學科交叉的申請項目給予特別的重視。今后生命科學部將繼續(xù)關注生命科學研究中的重要前沿和新興領域，注重學科均衡、協(xié)調發(fā)展； 生命科學部鼓勵科學家長期圍繞關鍵科學問題開展系統(tǒng)性、原創(chuàng)性的研究工作。,根據(jù)自己的研究基礎，認真思考，確定擬申報選題 （具體明確的科學問題）；全面廣泛閱讀國內外相關文獻；全面了解基

5、金委前期資助項目；確定擬申報研究科學問題；創(chuàng)新（學術思想、方法），標新立異，與眾不同，不跟風趕時髦，避免爭議，避免與國家重大計劃重復。,五、量身定做, 慎重選題,,六、國家自然科學基金項目申請書存在的問題技術轉移類申報項目;缺乏實質性的源頭創(chuàng)新或創(chuàng)新思想，立意偏于保守；大、空，深度不夠；立項依據(jù)不充分，無近三年文獻；寫作格式問題、錯別字等——申請書粗糙、不嚴謹。,（一）題目： 1. 反映主要研究內容和創(chuàng)新之處

6、； 2. 起點高、面要窄、吸引人、有新意、具體明 確； 3. 根據(jù)題目確定關鍵詞，從而確定立論依據(jù)的 寫法。,七、撰寫申請書時的注意事項,【舉例】：1）2003年重點項目： 豬脂肪和肌細胞發(fā)育或分化階段比較轉錄譜和差異表達 基因的結構與功能2） 2008年重點項目： 中外豬種胎兒骨骼肌表型差異分子基礎及其影響產肉性

7、 狀形成的比較發(fā)育遺傳學研究3）2004年青年基金題目（主持人朱正茂博士）： 人鼠中未檢測到同源序列的一個豬中新基因的結構與功能4）2006年青年基金題目（主持人唐中林博士）： 細胞外基質通路對豬骨骼肌的細胞社會學行為及產肉性 狀形成的分子調控,（二）400字摘要（十分關鍵） 層次分明，全面準確反映項目來龍去脈、研究內容與創(chuàng)新之處, 語句講究、凝煉、通順、重要性、研

8、究方法、研究？內容 ？達到？目標、 學術思想，科學意義： 1）…在…方面非常重要 2）將用…研究方法 3）研究…內容 4）實現(xiàn)…目標 5）會有…科學意義【舉例】：,豬矮小性狀相關

9、miR-200s基因簇功能及表觀遺傳調控研究（2011年青年基金，任紅艷博士）,我國小型豬具有體型小、遺傳穩(wěn)定等特點，已作為理想的實驗動物模型和生物醫(yī)學材料應用于多個領域，但其矮小性狀的調控機制仍然是一個謎。果蠅的microRNA-8基因是調控果蠅體型大小的重要因子，能夠與胰島素信號通路上關鍵因子互作影響細胞增殖和個體生長。但關于該基因在哺乳動物體型大小調控中的研究迄今國內外尚無報道。本課題組首次發(fā)現(xiàn)該基因在豬中存在同源類似物（micr

10、oRNA-200基因簇），而且證實其序列、結構和表達特征與果蠅miR-8極為相似。據(jù)此我們提出假設：豬miR-200s具有同果蠅miR-8類似的功能，在豬矮小性狀調控中起作用。為證實這一假說，本研究擬在已建立的五指山小型豬資源群體基礎上，從分子、細胞、個體和群體四個層面對miR-200s基因簇分子特征、結構、功能和表達調控機制進行深入研究，明確miR-200s在豬矮小性狀調控中的作用機理，提出豬矮小性狀調控的新機制。,豬泛素-蛋白酶體途

11、徑關鍵酶E3的基因間相關、蛋白質互作及與經(jīng)濟性狀的關聯(lián),泛素-蛋白酶體途徑與抗原提呈、轉錄調控等許多重要生命活動密切相關，且仍有許多未知因素有待研究和發(fā)現(xiàn)。本申請項目在申請人主持的前二項國家自然科學基金項目有關豬蛋白酶體相關基因研究工作基礎上，采用基因芯片、RNAi和SNP聯(lián)合模型，從幾個層次研究豬泛素-蛋白酶體途徑連接酶E3的基因間相關，篩選獲得一些E3的重要基因。并利用申請人已擁有的通城豬試驗群體、英國PIC公司資源群體和荷蘭資源群

12、體共1286個樣本，研究重要基因與經(jīng)濟性狀的關聯(lián)，確定一些與經(jīng)濟性狀相關的基因標記。 此外，還將采用酵母雙雜交技術，初步研究E3相關蛋白質的互作。本項目從一個途徑著手，從基因網(wǎng)絡和蛋白質互作的角度出發(fā)，有助于更準確地揭示豬重要經(jīng)濟性狀（數(shù)量性狀）的分子基礎。同時也將加深對泛素-蛋白酶體途徑的認識和對豬基因組的了解。,人鼠中未檢測到同源序列的一個豬中新基因的結構與功能,在驗證了豬新基因m218在杜洛克和通城豬胚胎不同發(fā)育階段骨骼肌組織中表

13、達的顯著差異，完成了該基因的物理定位，得到了該基因大部分的cDNA序列和部分SNP多態(tài)信息并初步對SNP位點進行了性狀關聯(lián)分析的基礎上，獲得m218基因的全長cDNA及啟動子序列，剪切點信息，推導蛋白質序列。轉染入C2C12細胞系，研究其蛋白質亞細胞定位，合成特異性抗體，研究蛋白質表達模式和活性蛋白形式，在本室豬實驗群體和PIC（國際豬改良公司）公司家系中深入研究其對產肉性狀的影響。 率先研究人鼠中未檢測到同源

14、序列的豬中新基因m218的結構，功能和表達，獲得具有我國知識產權的豬功能基因。研究結果為揭示豬肌肉生長和肌肉品質等產肉性狀的分子機理提供新知識，為標記輔助選擇提供新的基因資源。,七、撰寫申請書時的注意事項,（三）立項依據(jù)： 1. 引出科學問題（研究領域的重要性）； 2. 研究進展，著重指出研究瓶頸及問題，最后落 腳到你要解決該問題的創(chuàng)新思路； 3. 研究成功實現(xiàn)目標的科學意義

15、（科學價值\理 論意義和潛在的實踐意義/應用前景）。,4.每一段開頭都有一個總結性的小標題： （1）胎盤生長發(fā)育差異的分子機制研究是解析中外豬種繁殖性狀差異的重要方面； （2）豬胎盤印記基因功能的研究可深入了解胎盤和胎兒的生長發(fā)育分子機理；,七、撰寫申請書時的注意事項,（3） 申請人前一國家基金研究結果表明二花臉和大白豬胎盤發(fā)育后期一批基因表達差異顯著，且其中部分基因為印記基因，NNAT可能是其

16、中一個與胎盤功能相關的重要印記基因；（4） NNAT基因及其相關通路在豬胎盤及胎兒生長方面及作為影響初生重的基因和標記的發(fā)掘方面極具研究價值。,（四）研究目標：要集中，不宜寫得過大，集中解 決一個問題（五）研究內容： 1. 正確定位：基礎或應用基礎； 2. 假說驅動； 3. 確定研究的問題，查文獻+預實驗； 4. 提出假設，實驗設計，驗證及分析；

17、 5. 提出解決問題的新思路、新理論、新方法； 6. 避免過多過大、層次分明、圍繞目標。,七、撰寫申請書時的注意事項,（六）參考文獻： 參考文獻要新（近3年，一直到今年 年初的）標注參考文獻時一定不要遺漏重要參考文獻）。（七）研究方案： 文字描述，技術路線（圖）清晰，方法得當。（八）可行性分析： 針對關鍵難點技術。前期研究已進行、立論理論和實驗依據(jù)充分；已掌握關鍵技術；好的研究經(jīng)驗及研究基礎；硬

18、件條件具備。,七、撰寫申請書時的注意事項,七、撰寫申請書時的注意事項,（九）創(chuàng)新性： 1. 題目有新意，內容新（目前熱點等）； 2. 研究思路與理論上創(chuàng)新； 3. 研究視角獨特、解決問題方式新穎； 4. “目前研究很少”，“無人問津”等問題出現(xiàn)是 因為：研究意義不大？問題已經(jīng)解決？或根本行不通？ 5. 提出了新假說？對某未知領域的新探索？為解決某重要科學問題提供新思路和途徑？學術思想的創(chuàng)新性?,下丘腦弓狀核中雌

19、激素受體a(Era)表達量在灘羊季節(jié)性繁殖調控中的作用 (2011年青年基金，狄冉博士)本項目的特色與創(chuàng)新之處：（1）學術思想創(chuàng)新：從ERα表達量的角度探索乏情期下丘腦對雌激素負反饋作用敏感性增強的原因，并對乏情期和發(fā)情期下丘腦“促進中樞”和“抑制中樞”ERα數(shù)量影響綿羊發(fā)情狀態(tài)的調節(jié)機制提出了假設。另外，通過本研究可推測綿羊下丘腦“促進中樞”和“抑制中樞”所在的位置，目前國內外學術界對它們的位置還無定論。（2）研究方法特色：本

20、項目將最新的RNA原位雜交技術（Quanti- Gene ViewRNA）應用到季節(jié)性繁殖調控機制研究中，以期得到最準確的實驗結果。,細胞外基質通路對豬骨骼肌細胞社會學行為及產肉性狀形成的分析調控,,本項目的特色與創(chuàng)新之處：（1）率先將細胞社會學引入動物遺傳育種研究領域，具有學科交叉性，在研究思路上具有創(chuàng)新。 針對細胞外基質通路相關基因，申請者從基因社會學、細胞社會學角度，研究基因互作遺傳網(wǎng)絡和細胞外環(huán)境與

21、細胞的互作。并借用“還原論”的思想，從分子水平還原到細胞和組織水平，研究細胞外基質生化通路相關基因對豬骨骼肌細胞社會性的調控。,通過表達網(wǎng)絡模型構建，對通路中關鍵基因的表達調控機制進行探討。而傳統(tǒng)的思路是從單基因著手，并片面重視骨骼肌細胞結構基因及肌生成因子，而忽視細胞外環(huán)境的作用，或只在單一的分子水平對基因進行研究。本研究提出了從細胞社會學角度探索細胞外環(huán)境和細胞互作對家畜動物復雜性狀形成的分子機制進行研究的新思路。這是該課題的一個重

22、要特色與創(chuàng)新之處。,（2）申請項目起點較高，此研究是前期國家自然科學基金重點項目研究成果的深入。 申請者博士論文研究的內容是受國家自然科學基因重點項目“豬脂肪和肌細胞發(fā)育或分化階段比較轉錄譜和差異表達基因的結構與功能”（項目編號：30330440，李奎主持）資助。研究發(fā)現(xiàn)，在胚胎骨骼肌發(fā)育過程中，細胞外基質通路相關基因是通城豬和長白豬兩品種差異最大的一類基因。因此，本課題立項起點高，是前期國家自然科學基金重點項目資助所取得成果

23、的深入，具有很好的延續(xù)性。,（3）科學問題的提出是基于申請者博士論文的新發(fā)現(xiàn)，課題立項具有原始創(chuàng)新性 申請者在對自己研究新發(fā)現(xiàn)的基礎上，通過文獻論證，確證細胞外基質在骨骼肌生長發(fā)育中具有重要作用，大膽提出假設：細胞外基質通路相關基因可能是中外豬產肉性狀遺傳差異產生的重要分子機制，而通過進一步的大量文獻檢索，細胞外基質對骨骼肌的生長發(fā)育具有重要作用。,（十）研究基礎： 項目前期進展可用圖表等表述 （直接與間接）不

24、 是只寫申報者一個人的工作基礎，而是指整個團 隊和這個學校（設備）基礎。（十一）個人簡介： 學歷、簡歷、研究工作（方向與成果）簡介、人 才培養(yǎng)與學術兼職、重要學術論文與成果。,七、撰寫申請書時的注意事項,（十二）特別是青年基金，主要看申請人的科研潛力 與項目的創(chuàng)新思路，而科研潛力則主要通過簡歷與 工作基礎來體現(xiàn)。（十三）如果主持人成果較弱，只有很少文章

25、時，不 妨寫寫這些文章的意義及別人給出的評價。,七、撰寫申請書時的注意事項,（十四）文字上： 科學術語規(guī)范、文筆流暢、簡潔概括、邏輯清晰、 無錯別字，體現(xiàn)認真、嚴謹，讓評委從申請書看出 申請人是一個能勝任科學研究的人。（十五）工作條件和研究隊伍： 根據(jù)目標和研究內容、方法、寫出工作條件和研 究隊伍，每一部分工作有相應的條件和人員擔任。（十六）經(jīng)費寫上限。,七、撰寫申請書時的注

26、意事項,（十七）基金委鼓勵圍繞某一科學問題開展連續(xù)系 統(tǒng)深入的研究：,七、撰寫申請書時的注意事項,豬生長激素基因的定位與多態(tài)性及其與生產性狀的關系1991年國家基金，彭中鎮(zhèn)教授豬GH基因及其連鎖群的PCR-RFLP和PCR-SSCP研究1993 年國家基金 ，彭中鎮(zhèn)教授用PRINS技術構建豬12號二價染色體高精度框架圖的研究1995 年國家基金，李奎豬12號染色體上新基因的CATS法分離及其定位和效應研究

27、1998 年國家基金，李奎豬PA28相關基因的結構、表達、功能及與免疫性狀的關聯(lián)2002 年國家基金，李奎豬泛素-蛋白酶體途徑關鍵酶E-3的基因間相關、蛋白質互作及與經(jīng)濟性狀的關聯(lián)2005 年國家基金，李奎,豬脂肪和肌細胞發(fā)育或分化階段比較轉錄譜和差 異表達基因的結構與功能,申請單位：華中農業(yè)大學動物科學技術學院,申 請 人： 李 奎,八、關于重點項目,（一） 學術思想,1. 綜合運用分子生物學、生物信息學和

28、數(shù)量遺傳學方法，揭示豬瘦肉生長和脂肪沉積的分子基礎。2. 既研究脂肪和肌細胞系分化前后差異表達基因，又研究我國優(yōu)良地方豬不同生長階段差異表達基因，以及中外豬品種間差異表達基因，構建豬瘦肉生長和脂肪沉積基因差異轉錄譜。3. 克隆、鑒定豬瘦肉生長和脂肪沉積相關的基因。4. 將肌肉生長和脂肪沉積調控作為一個整體，同時研究基因生物學功能及基因間互作。,,（二）方法及技術路線,SAGE文庫的構建 ：選擇錨定酶和標簽酶，完成序列的拼接，

29、形成多連體序列標簽,,（二）方法及技術路線,研究豬脂肪和肌細胞分化發(fā)育基因互作機制技術路線,（三） 特色與創(chuàng)新之處,1.將脂肪和肌細胞生長發(fā)育調控作為一個有機整體，系統(tǒng)研究脂肪和肌細胞發(fā)育過程中基因表達調控關系，以闡明基因的互作機制。2.用細胞系研究豬脂肪和肌肉細胞轉錄譜及豬基因生物學功能。3.SAGE技術高通量分析豬基因表達，能較大規(guī)模篩選和發(fā)現(xiàn)新的重要功能基因。4.拓展比較轉錄譜內涵、實驗流程和相關統(tǒng)計方法。,中外豬種胎兒骨骼

30、肌表型差異分子基礎及其影響產肉性狀形成的比較發(fā)育遺傳學研究,申請人：李 奎,申請單位：中國農業(yè)科學院北京畜牧獸醫(yī)研究所,符合重點項目“農業(yè)動物（畜禽及水生經(jīng)濟動物）和牧草種質資源的遺傳基礎研究”方向,（一）關鍵科學問題,確定中外豬種妊娠中后期胎兒骨骼肌發(fā)育最大差異時間點,妊娠中后期（第60~80天 ）是不同豬種間骨骼肌生長發(fā)育差異的關鍵時期,胚胎時期對生后生長性能起決定作用,最大差異點的確定,？,,,（一）關鍵科學問題,

31、中外豬種胎兒骨骼肌發(fā)育相關調控通路差異分析,骨骼肌發(fā)育相關調控通路的差異分析,骨骼肌組織的基因表達表型在中外豬種之間差異極為顯著,下一步,中外豬骨骼肌比較轉錄組,,引起這種基因表達差異的原因,（一）關鍵科學問題,表觀遺傳及非編碼RNA對肌肉發(fā)育差異的調控,已有基礎,已有基礎,已有基礎,肌肉發(fā)育的調控機制,表觀遺傳調控,非編碼RNA調控,遺傳調控,（一）關鍵科學問題,中外豬種骨骼肌發(fā)育在多層次調控網(wǎng)絡水平差異的綜合分析,地

32、方豬骨骼肌發(fā)育的多層次調控網(wǎng)絡,國外豬骨骼肌發(fā)育的多層次調控網(wǎng)絡,,,,,,,,,,,,比較中外品種骨骼肌發(fā)育在多層次調控網(wǎng)絡水平的差異,ＲＮＡ調控,表觀遺傳修飾,蛋白互作,蛋白互作,ＲＮＡ調控,表觀遺傳修飾,信息整合分析,信息整合分析,（一）關鍵科學問題,深入認識產肉性狀形成的遺傳學基礎,節(jié)點基因的篩選,性狀關聯(lián)分析,育種中的驗證與應用,群體SNP分型,,,,（二） 方法與技術路線,總體技術路線,,通城豬、長白豬妊娠55、60

33、、63、65、67、70、75、80天胎兒骨骼肌,,骨骼肌發(fā)育相關調控通路的差異分析,根據(jù)轉錄譜和組織學特征確定最大差異時間點,表觀遺傳及非編碼RNA調控差異分析,. 解析通城、長白豬妊娠中后期骨骼肌發(fā)育差異的分子遺傳學機理；. 獲取胎兒骨骼肌發(fā)育的多層次調控網(wǎng)絡，解析產肉性狀形成的遺傳學基礎；. 新信號通路、關鍵基因的鑒定以及功能分析，確定其在豬育種工作中的意義,,,,,關鍵基因和通路確定,,,(二) 方法與技術路線,差異時間點分

34、析，關鍵的調控信號以及因子分析,,兩品種豬胎兒骨骼肌組織學、組織化學差異研究,通城豬與長白豬妊娠第55、60、63、65、67、70、75、80天胎兒骨骼肌樣品,確定妊娠中后期骨骼肌發(fā)育最大差異點,基因表達的時序分析,基因表達的原位分析,,,,,,,新基因和通路的確定以及表達調控模式研究,,,(二) 方法與技術路線,骨骼肌發(fā)育相關調控通路的差異分析技術路線,,通城和長白胎兒成肌細胞,增殖、分化時期的比較轉錄譜,重要基因互作網(wǎng)絡構建及比較

35、,骨骼肌發(fā)育相關調控通路以及品種間差異分析,,,,,轉錄譜芯片分析,酵母雙雜交分析,,,(二) 方法與技術路線,表觀遺傳及非編碼RNA調控差異分析技術路線,(二)方法與技術路線,差異表達基因的關聯(lián)分析,(三) 特色與創(chuàng)新之處,在前期研究成果的基礎上，進一步以妊娠中后期的胎兒骨骼肌為重點，精細確定中外豬種產肉性狀顯著差異的關鍵時間點。可彌補當前產肉性狀研究的不足。從遺傳調控與表觀遺傳調控互作的角度，以更高的視角探討中外豬品種產肉性狀的

36、顯著差異及其互補性的調控機制。,(三) 特色與創(chuàng)新之處,鑒定關鍵的節(jié)點基因，結合這些基因與經(jīng)濟性狀關聯(lián)以及相應的生物學功能研究，確定具有重要貢獻的基因和分子標記。綜合利用多學科相關技術精細描述中外豬品種出生前骨骼肌發(fā)育的差異；差異表達新基因鑒定方法有改進。,(三) 特色與創(chuàng)新之處,把比較發(fā)育遺傳學思路引入到中外豬骨骼肌的表型差異分子機制研究中，將一定程度上有利于我國動物遺傳育種學科和畜禽發(fā)育遺傳學科的發(fā)展；研究結果將為我國豬產肉性狀

37、的改良提供一定的理論基礎。,九、關于重大研究計劃“微進化過程的多基因作用機制”重大研究計劃 2012年度項目指南（三）人工選擇下的基因組變異與適應人工環(huán)境的分子機制。 家養(yǎng)動植物是在短短的一萬多年內，通過人工選擇的作用，從野生祖先馴化而來的。人工選擇的特點是強度高、方向明確。本研究方向要求通過比較家養(yǎng)動植物與其野生近緣物種群體的全基因組水平上的差異，探討人工選擇下基因組變異的規(guī)律，鑒別出重要的適應性基因，揭示人

38、工選擇下家養(yǎng)動植物適應人工環(huán)境的遺傳機制。本方向優(yōu)先支持馴化歷程相對清晰、有望對進化理論做出嶄新貢獻的研究系統(tǒng)。研究內容應著眼于了解選擇壓推動微進化的分子機制，而不是農業(yè)經(jīng)濟性狀的改良。,立項很重要七人專家組重點項目（強度與重點項目相似）和培育項目函評5-7人，2名海外評委重點項目需答辯農科院專家需圍繞微進化調整寫作思路,,第二部分 課題組長的作用,課題組長在基金申報中的作用,一、使團隊成員認識到基金的重要性，激發(fā)興趣。

39、 二、把握研究方向：基礎/應用基礎研究，結合國家需求與自己積累，符合指南，避免重復研究。 三、組織好申請（一個團隊內研究方向較近，如何處理？）把握投送方向： （一）學科分開：申報不同學科（畜牧、遺傳、發(fā)育等）。 （二）方向分開：同一物種可以側重不同性狀或問題進行申請。 實力強的投送其他學科 是否限制申請？,四、充分利用團隊內前期研究基礎 揚長避短，團隊成員基本

40、不申請團隊沒有任何基礎 的項目 五、申請書質量把關 （一）不要盲目寫，寫之前要團隊內開會先討論思 路、拿提綱； （二） 確定思路后要盡早拿出初稿； （三） 找申請成功的人提意見； （四）平時注意對科技寫作方面的鍛煉。,課題組長在基金申報中的作用,六、人員匹配：人員隊伍合理安排。 七、關注團隊中多次申請失敗的成員：　　　分析原因、 找突破口。 八、注意在同行中對團隊成員的宣傳：

41、 　　小同行、初審評議人，初審最關鍵！ 九、適當注意讓基金委管理人員了解團隊研究水平： 　　實力最重要，領導了解會有所幫助。 十、關注并督促青年基金研究進展，維持團隊聲譽，在申請基金方面形成良性循環(huán)。,課題組長在基金申報中的作用,唐代詩人賈島行走坐臥吟詠不輟，是一位苦吟詩人。一日騎驢行于長安道上，偶得一詩句：“鳥宿池邊樹，僧推月下門”。其中“推”字又想用“敲”字，沉吟未決之際，沖撞京兆尹韓愈的行駕。開道侍從將賈島