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文檔簡介
1、目的:
1.以省級行政區(qū)域?yàn)檠芯繉ο?,建?004-2012年全國31個?。ㄗ灾螀^(qū)、直轄市)肺結(jié)核地理信息數(shù)據(jù)庫,制作肺結(jié)核發(fā)病的專題地圖,并描述我國肺結(jié)核發(fā)病在時間、地點(diǎn)、人群的“三間分布”特征,確定2004-2012年我國肺結(jié)核高發(fā)區(qū)、高發(fā)期和高危人群,為部隊(duì)肺結(jié)核防控關(guān)鍵技術(shù)研發(fā)提供依據(jù)。
2.篩選結(jié)核分枝桿菌特異性的基因作為LAMP檢測的靶基因序列,設(shè)計(jì)并篩選特異性的引物,用檢測濁度法和鈣黃綠素染色法對該引物
2、的特異性與靈敏性測試,為部隊(duì)結(jié)核病現(xiàn)場快速檢測提供一種新的檢測與判斷方法。
方法:
1.近10年肺結(jié)核發(fā)病率分析
1.1.數(shù)據(jù)收集和處理的方法
利用中國疾病監(jiān)測信息報(bào)告管理系統(tǒng),收集研究區(qū)域內(nèi)肺結(jié)核網(wǎng)絡(luò)報(bào)告數(shù)據(jù)和人口信息,利用Excel2010軟件,對數(shù)據(jù)進(jìn)行比對篩選和排序整理。
1.2利用ArcGIS9.0軟件,建立我國各省結(jié)核地理信息數(shù)據(jù)庫,從時間、空間、人群三方面,對我國結(jié)核發(fā)病分
3、布特征進(jìn)行描述性分析。
2.結(jié)核分枝桿菌快速檢測方法研究
2.1引物篩選
通過NCBI在線數(shù)據(jù)庫的檢索,選擇結(jié)核分枝桿菌的特異性保守序列IS6110為靶序列,并針對這一序列用軟件(PrimerExplorer4)設(shè)計(jì)特異性的LAMP引物,并篩選最佳引物。
2.2特異性評價
用篩選的最佳引物分別檢測結(jié)核分枝桿菌和非結(jié)核分枝桿菌,評價該引物檢測結(jié)核分枝桿菌的特異性。
2.3靈敏性評
4、價
將提取的結(jié)核分枝桿菌DNA進(jìn)行10倍梯度稀釋,用該引物進(jìn)行檢測,評價其靈敏性與傳統(tǒng)PCR方法的差異。
結(jié)果:
1.近10年肺結(jié)核發(fā)病率分析
1.1全國肺結(jié)核發(fā)病概況
2004-2012年我國31個省、直轄市和自治區(qū),共報(bào)告肺結(jié)核發(fā)病病例9663,728例,死亡26,932例,十年來我國肺結(jié)核病例報(bào)告總體呈下降趨勢。
1.2全國肺結(jié)核空間分布情況
新疆肺結(jié)核年均發(fā)病
5、率為181.42/10萬居全國首位,貴州、海南、廣西、重慶、西藏、黑龍江六?。ㄖ陛犑小⒆灾螀^(qū))年均發(fā)病率次之,北京、山東、上海和天津四?。ㄖ陛犑校┠昃l(fā)病率低于50/10萬。
1.3全國肺結(jié)核時間分布情況
從2004-2012年我國肺結(jié)核月均發(fā)病率來看,一、二季度肺結(jié)核發(fā)病率較高,三、四季度肺結(jié)核發(fā)病率較低,其中,1月和3月發(fā)病率較高且相近,自3月份起發(fā)病率逐月下降,12月發(fā)病率為一年中最低。
1.4全國肺
6、結(jié)核人間分布情況
肺結(jié)核患者中男性高于女性;從年齡分布上看,14歲以下人群年均發(fā)病率較低,老年人(60歲以后)年均發(fā)病率最高。從職業(yè)分布上看,我國肺結(jié)核發(fā)病主要以農(nóng)民為主。
2.結(jié)核分枝桿菌快速檢測方法研究
2.1最佳引物篩選
以結(jié)核分支桿菌IS6110基因序列為靶序列,設(shè)計(jì)5套LAMP引物為反應(yīng)引物,以結(jié)核分枝桿菌為模板在濁度儀中進(jìn)行LAMP反應(yīng),結(jié)果顯示引物JH164組為最佳擴(kuò)增引物。
7、 2.2JH164引物檢測結(jié)核分枝桿菌的特異性檢測實(shí)驗(yàn)
用JH164引物對14種細(xì)菌DNA進(jìn)行檢測,結(jié)果顯示,JH164引物具有良好的特異性。
2.3JH164引物檢測結(jié)核分枝桿菌靈敏性實(shí)驗(yàn)
用JH164引物分別用濁度法和鈣黃綠素染色法進(jìn)行檢測,檢測10倍梯度稀釋的結(jié)核分枝桿菌DNA,結(jié)果顯示,用JH164引物進(jìn)行LAMP結(jié)核分枝桿菌檢測的靈敏性是傳統(tǒng)PCR方法的10倍,最低檢測值為:101pg/μl。<
8、br> 結(jié)論:
1.在過去的10年,我國肺結(jié)核發(fā)病率呈總體下降趨勢,但防控形勢依然嚴(yán)峻。我國肺結(jié)核病在新疆發(fā)病率最高,提示該地區(qū)結(jié)核病防控應(yīng)作為重點(diǎn)。從發(fā)病時間來看,我國肺結(jié)核發(fā)病多集中在一、二季度,提示此時為結(jié)核病多發(fā)季節(jié),應(yīng)做好結(jié)核病防控措施。從人群角度來看,肺結(jié)核患者多為務(wù)農(nóng)者,以男性為主,老年人發(fā)病率較高。
2.用LAMP方法檢測結(jié)核分枝桿菌具有簡單、快速、特異性高、靈敏性好的特點(diǎn),而且反應(yīng)在恒溫狀態(tài)下即可
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