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簡(jiǎn)介:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)博士學(xué)位論文貂、狐、貉源犬瘟熱病毒分離鑒定與分子生物學(xué)特性研究姓名王君瑋申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別博士專業(yè)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)指導(dǎo)教師姜平20080601貂、狐、貉源犬瘟熱病毒分離鑒定與分子生物學(xué)特性研究CDV/SD/M06用D貂源、CDV/SD/M06/L,N貂源和CDV/SD/F06/HB狐源3。貂、狐、貉源犬瘟熱病毒不同分離株H扣N基因序列分析用RTPCR方法對(duì)分離的5個(gè)CDV分離株的H基因和N基因進(jìn)行了擴(kuò)增,并分別將其克隆到PGEMTVEXTOR進(jìn)行序列測(cè)定然后與OENBARD中己報(bào)道的CDV毒槲目比較結(jié)果為1H基因5個(gè)分離株H基因N協(xié)列同源性均達(dá)到975%以上,與國(guó)內(nèi)疫苗株CHNE源性為905~918%5個(gè)CDV分離株H基因推導(dǎo)的艙序列同源性比較表明HTP與THDL的AA同源性為100%,二者與其他分離毒株間AA序列同源性差別大,分別為879%一99I%;與ELM同源性普遍較低,為897%一918%而CLAN與ONDCRSTEPOORT,CONVAC洧著很高的同源性關(guān)系NT同源性分別為968%和972%;TIFF同源性分別為97?!浚ズ?56%2N基因54“分離株N基因L腑列同源性均達(dá)到945%以上,HTP與THDL的同源性最高998%國(guó)內(nèi)疫苗株CLAN與分離株的M序列同源性普遍較低909935%,而與疫苗株OILDERST印OORT的NT同源性高,達(dá)到971%從N蛋白齟序列看,分離株之間除HTP、THDL與HDA折列同源性較高99O%以上外,其他分離株之間AA同源性低而CLUL與ONDERSTEPOORT確“著很高的同源性關(guān)系,同源性比例達(dá)973%本研究結(jié)果提示,HD和刪C病區(qū)域相量巨較遠(yuǎn),但具有較高的同源性,而與FIB具有相對(duì)較低的NT同源性,提示野毒株在易感動(dòng)物上可能存在種屬差異此外,分離毒株壬和N蛋白免疫原性可能與疫苗株有較大差別,可能與CD免疫失敗有關(guān)4犬瘟熱病毒實(shí)時(shí)熒光定量RTIPCR檢測(cè)方法的研究按熙CDVN基因序列,設(shè)計(jì)合成了特異性引物和探針,經(jīng)各反應(yīng)條件的優(yōu)化,建立了CDV的REALTIME熒光定量RT,PCR4僉測(cè)技術(shù)用20PMOLJML的引物濃度各1UL和20PMOL/ML的探針濃度03UL、獲得的熒光信號(hào)最強(qiáng),曲線平滑敏感度為124X10刁NG/ML的病毒RNA;與NDV、AIV、NIPV等RNA病毒不發(fā)生交又反應(yīng)試驗(yàn)重復(fù)性的變異系數(shù)CN分別為23%、25%和42‰對(duì)采集的57份臨床樣品進(jìn)行檢測(cè),熒光RTPC胎測(cè)陽(yáng)性檢出率為93%53/57,而BIOINDISTBITRAPIDCDV試劑盒、常規(guī)RTPCR陽(yáng)性檢出率分別為702%40/57和719%4I/57,與BZG吩7DIS嗽劑盒和蒂’規(guī)RTPCR的符合率分別為77。2%和789%,而BIO帥IST試劑盒與常規(guī)RTPCR符合率達(dá)982%結(jié)果表明,本研究建立的檢測(cè)CDV的熒光RTPCR方法具有快速、特異、敏感、可定量,并可同時(shí)檢測(cè)大量樣品等優(yōu)點(diǎn),能用于CDV感染的早期診斷和海關(guān)檢疫5貉源犬瘟熱病毒H,F(xiàn)和N基因真核表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建與鑒定將貉源CDV分離株的H、F和NN1,N2基因經(jīng)RTPCRF增后,連接到PMDL8T載體,對(duì)比測(cè)序結(jié)果表明各基因序列正確,并且符合閱讀框規(guī)則然后將各基因亞克隆到真核表達(dá)裁體PLRESLNEO礙“,經(jīng)PCR方法和限制酶酶切鑒定成功構(gòu)建了四種重組真核表達(dá)質(zhì)粒,分別命名為PIRSTN1、PIRESTN2、PIRESTH、PIRESTF用構(gòu)建的真核重組質(zhì)VⅡI
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簡(jiǎn)介:’■,L、近江牡蠣天然免疫相關(guān)蛋白的分子生物學(xué)及功能研究THESTUDIESONMOLECULARBIOLOGYANDFUNCTIONOFINNATEIMMUNERELATEDPROTEINSOFOYSTERCRASSOSTREAARIAKENSIS博士研究生楊受保指導(dǎo)老師吳信忠教授\TL,,浙江大學(xué)博士論文摘要牡蠣等無(wú)脊椎動(dòng)物的天然免疫相關(guān)蛋白及其與病原的相互作用是國(guó)際病害與分子免疫學(xué)研究的熱點(diǎn)問(wèn)題。類立克次體是一類專性細(xì)胞內(nèi)寄生的革蘭氏陰性細(xì)菌,可引起牡蠣的大規(guī)模死亡,但目前在貝類抗RL0感染機(jī)理方面所知甚少。本博士學(xué)位論文在對(duì)近江牡蠣天然免疫相關(guān)蛋白的基因STRAILTOLLOID1IKE。MAK3和P38和/或蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的分子生物學(xué)進(jìn)行研究的基礎(chǔ)上,對(duì)它們的功能進(jìn)行了研究,即一方面采用類立克次體對(duì)近江牡蠣宿主進(jìn)行誘導(dǎo)刺激,系統(tǒng)地分析了宿主與類立克次體病原的相互作用即牡蠣STRAⅡ,T01LOID。LIKE,MAK3和P38在類立克次體誘導(dǎo)的宿主免疫反應(yīng)中的功能、作用機(jī)制,以及STRAIL在免疫反應(yīng)中的信號(hào)傳導(dǎo)通路。另一方面本研究系統(tǒng)地探索研究了STRAIL對(duì)牡蠣正常血淋巴細(xì)胞和腫瘤細(xì)胞的細(xì)胞毒作用及其作用機(jī)制和信號(hào)傳導(dǎo)通路。一、關(guān)于近江牡蠣STRAIL促細(xì)胞凋亡及抗類立克次體感染免疫的研究取近江牡蠣血淋巴細(xì)胞,采用TRIZOL法提取總RNA,制備EDNA模板。根據(jù)人和不同動(dòng)物TRAIL基因序列設(shè)計(jì)引物,采用RTPCR技術(shù)首次在雙殼貝類中獲得了CASTRAIL的編碼序列。該EDNA序列含有一個(gè)501BP的讀碼框,編碼一個(gè)184KDA的蛋白,該蛋白含有一個(gè)典型的TNF結(jié)構(gòu)域。CASTRAIL與人的TRAIL基因同源性較高,兩者的EDNA序列同源性為99%,氨基酸序列的同源性為98%;與草魚的同源性則較低,為42%。各組織原位雜交和RTPCR結(jié)果表明CASTRAIL在牡蠣各正常組織中均有表達(dá),在外套膜、血淋巴和鰓中表達(dá)量較高,性腺中表達(dá)量很低,提示該基因可能與免疫調(diào)節(jié)有關(guān)。通過(guò)構(gòu)建重組表達(dá)質(zhì)粒PETCASTRAIL,在大腸桿菌中對(duì)CASTRAIL進(jìn)行了誘導(dǎo)表達(dá),并純化蛋白制備了多克隆抗體;同時(shí),利用該抗體對(duì)牡蠣TRAIL的亞細(xì)胞定位進(jìn)行了研究結(jié)果表明CASTRAIL在大腸桿菌中得到了高效表達(dá),所制備的兔多克隆抗體的效價(jià)為14000;牡蠣TRAIL蛋白主要表達(dá)于血淋巴細(xì)胞的細(xì)胞膜上,是一個(gè)跨膜蛋白。隨后利用REALTIMERTPCR、流式細(xì)胞儀、DNA電泳、WESTERNBLOTTING和抗體技術(shù)等探索研究了CASTRAIL對(duì)牡蠣正常血淋巴細(xì)胞和腫瘤細(xì)胞的細(xì)胞毒作用及其作用機(jī)制和信號(hào)傳導(dǎo)通路。結(jié)果證明CASTRAIL可通過(guò)激活死亡受體DR4和DR5途徑引起人類腫瘤細(xì)胞HL60的凋亡;對(duì)正常牡蠣血淋巴細(xì)
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簡(jiǎn)介:中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)博士學(xué)位論文黑腹果蠅亮紅眼突變型的遺傳學(xué)和分子生物學(xué)特性分析姓名楊軍申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別博士專業(yè)動(dòng)物遺傳育種與繁殖指導(dǎo)教師連林生吳常信20060601中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)博二學(xué)位論文ABSTRACTABSTRACTASANIDEALGENETICMATERIALANDMODELANIMAL,DROSOPHILAMELANOGASTERHASBEENUSEDFORGENETICRESEARCHFORABOUT100YEARSCOMPOUNDEYETRAITSSUCHASEYESHAPEANDEYECOLORAREALWAYSTHEHOTSPOTSFORGENETICRESEARCHTHENORMALREDBROWNCOMPOUNDEYECOLOROFDROSOPHILAMELANOGASTERISDUETOTHEPRESENCEOFTWOTYPESOFPIGMENTSTHEREDDROSOPTERINISSYNTHESIZEDFROMGUANINEVIAPTERIDINEINTERMEDIATESWHILETHEBROWNXANTHOMMATINISDERIVEDFROMTRYPTOPHANVIAFOURENZYMATICREACTIONSTHEPIGMENTPRECURSORTHENTRANSPORTEDINTOPIGMENTCELLSBYTRANSMEMBRANETRANSPORTERSEYECOLORMUTANTSWITHBRIGHTREDEYEWASFOUNDINF2CROSSPROGENYOFBANDPRFLIESAFTERWILDTYPEFLIESCROSSEDTOBANDPRFLIESRESPECTIVELYMUTANTBRIGHTREDEYEFLIESWEREOBTAINEDINF2PROGENYOFWILDTYPEANDBFLIESBUTNOEYECOLORMUTANTSWASFOUNDINCROSSPROGENYOFWILDTYPEANDPRFLIESEVENINF7PROGENYPUREBRIGHTREDEYEFLYLINEWASOBTAINEDBYINBREEDINGTHEMUTANTGENERESPONSIBLEFORTHEBRIGHTREDEYEWASIDENTIFIEDASANALLELEOFSCARLETGENEWHICHLOCATESONCHROMOSOME3AFTERTHEBRIGHTREDEYEFLIESWASCROSSEDWITHTYPEFLIES,UNDERWENTTWOPOINTTESTSWITHVGANDEMUTANTSANDCOMPLEMENTATIONTESTSWITHEYECOLORMUTANTSCN。,ST。ANDV。RESPECTIVELYTHEBRIGHTREDEYEMUTANTFLYLINEWASNAMEDASS亡REYEPIGMENTOFWILDTYPE,B,STB7ANDST。FLIESWASEXTRACTEDANDTHEABSORBANCEWASMEASUREDEYEPIGMENTCONTENTOFDIFFERENTFLYLINESWASANALYZEDBYSIGNIFICANCETESTTHEXANTHOMMATINCONTENTDIFFERENCEBETWEENWILDTYPEANDEYECOLORMUTANTSSTB7ANDST。ISEXTREMELYSIGNIFICANTJP005NOSIGNIFICANTDIFFERENCEOFXANTHOMMATINCONTENTWASFOUNDBETWEEN5,ANDST。FLIESP005BFLIESHAVEMUCHMOREXANTHOMMATINTHANS產(chǎn)RANDST/FLIES‘P如01BUTSIGNIFICANTLYLESSTHANWILDTYPEFLIESPOO1ITISCONCLUDEDTHATLOWLEVELOFXANTHOMMATINCONTENTINTHECOMPOUNDEYEISRESPONSIBLEFORTHEMUTANTBRIGHTREDEYEPHENOTYPESIXPAIMOFPRIMERSWEREDESIGNEDFORAMPLIFYINGSCARLETGENEA75一KB412ELEMENTINSERTIONWITHINEXON4OFSCARLETGENEWASDETECTEDINB,SPANDSTIFLIESWITHTHEFOURTHPAIRPRIMERSTHE412ELEMENTINSERTEDINTO1612‘“BP~1613MBPOFST。SCARLETGENEWITHA450BPLOSSOF5“LTRINTHESAMEDIRECTIONTOSC口MFTRANSCRIPTIONWHILETHE412ELEMENTINSERTEDINTO1722NDBP1723阿BPOFS,SCARLETGENEINTHEREVERSEDIRECTIONTOSCARLETTRANSCRIPTIONRTPCRFOREXONSAMPLIFICATIONOFDIFFERENTFLYLINESWASPERFORMEDSEVENEXONSWITHNOSEQUENCEALTERATIONWEREAMPLIFIEDINWILDTYPEANDBFLIESANDEXONS13WITHNOSEQUENCEALTERATIONWEREAMPLIFIEDINSPANDSTLFLIESTHEREWERENOCDNAPRODUCTSAMPLIFIEDWHICHISCORRESPONDENTTOTHESEQUENCEBETWEENEXON4‘“TO7MKEYWORDSDROSOPHILAMELANOGASTER,EYEPIGMENT,SCARLETGENE,412ELEMENT,INSERTIONMUTATION
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簡(jiǎn)介:東北林業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文分子生物學(xué)技術(shù)在昆蟲學(xué)研究中的應(yīng)用利用RAPD技術(shù)研究東北地區(qū)十八種小卷蛾的親緣關(guān)系及落葉松毛蟲卵寄生蜂的分子監(jiān)測(cè)姓名劉延濱申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別碩士專業(yè)森林保護(hù)指導(dǎo)教師遲德富20040601ABSTRACTTHISPAPERISABOUTTHEGENETICRELATIONSHIPOFTHE18KINDSOFOTETHREUTIDMCLTHSFROMTHENORTHEASTOFCHINABYRAPD,ANDREQUIRESTHEEVOLUTIONINFORMATIONOFTHESESPECIESCOMPARINGTHEPHYLOGENICTREEBYRAPDWITHMORPHOLOGICDESCRIPTIONTHEAUTHORDREWACONCLUSIONTHATITHASREFLECTEDTHEEVOLUTIONLAWPARTLY。THESESPECIESAREDIVIDEDTWOGROUPS,ONEISCAPUAVRGANA,ANDTHEOTHERISTHERESTTHEFEMALEEXTERNALGENITALORGANSOFTHERESTHASASIGNNM,CAPUAYULGANANOTTHESIMILARCOEFFICIENTOFCLEPSISRURINANAANDPANDEMISCINRTAMOLFLECLRTCTIS1,0301,ITISEXPLAINEDTWOKINDS’RELATIONSHIPISVERYCLOSE,ANDTHEYAREMUCHMORPHOLOGICSIMILARONTHEMALEEXTERNALGENIALORGANS,SUCHASBROADUNCBS,CIRCULARVALVAE;THEREAREHAMMERLIKEPROTUBERANCEONTHEFEMALEEXTERNALGENITALORGANSBUTTHEYAREBELONGINGTOTWOGENUSESRESPECTIVELYCLEPSISRURINANAANDCTEPSISPALLIDANAARETHESAMEGENUS,THEIRSIMILARCOEFFICIENTIS00505WHYATPRESENT,THEREISNOTTHEREASONABLEANSWER。INORDERTOSETTINGUPTHETRUEPHYLOGENICTREEAVESHOULDCOLLECTMUCHINFORNAATIONINTHISTHESISTHEAUTHORTHINKITISFEASIBLEFORTHERIBOSOMALITS2INTERNALTRANSCRIBEDSPACERS2DNASEQUENCESUSINGFORTHEIDENTIFICATIONOFTHEPARASITOIDOFDENDROLIMUSSUPERANS’SEGGSTHELENGTHOFITS2SEQUENCESOFTETENOMUSTETRATOMUS,PAC砂NELZROLQSOLITARIUM,OOENCYRTUSPINICOLUSANDDSUPERAMISDIFFERENTCOMPLETELYTOVERIFY也ERELIABILITYTHEDIFFERENTSPECIESDNAWERECOMBINEDANDPCRSWEREPERFORMEDTOAMPLI每SPECIESSPECIFICDNAFRAGMENTSRESULTSFROMSPECIFICITYTRIALSINDICATETHATT11EYCANBEDISTINGUISHEDHOWEVER,THEREMAYBEPROBLEMSONACTUALAPPLICATIONBECAUSETHREESPECIESBELONGTOTHREEFAMILIARRESPECTIVELYANDTHEREISN’TTHECOMPARISONOFTHECLOSESPECIESORTHESIBLING,THEREMAYBESOMEINFERENCETOTHERESULTSWESTILLNEEDPLENTYOFEXPERIMENTSAFTERWARDSKEYWORDSRAPDRELATIONSHIPLITS2;PARASITOID
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簡(jiǎn)介:Y68448獨(dú)創(chuàng)聲明不人聲明所呈交的學(xué)位論文是本人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行的研究工作及取得的研究成果。據(jù)我所知,除了文中特別加以標(biāo)注和致謝的地方外,論又中不包含其他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫過(guò)的研究成果,也不包含為獲得注如沒(méi)有其他需要特別聲明的,本欄可空或其他教育機(jī)構(gòu)的學(xué)位或證書使用過(guò)的材料。與我一同工作的同志對(duì)本研究所做的任何貢獻(xiàn)均已在論文中作了明確的說(shuō)明并表示謝意。學(xué)位論文作者簽名導(dǎo)師簽字運(yùn)場(chǎng)矛7未冬簽字日期2004年閃月釗日簽字日期2004年尸月74日鹽芥TTHELLUNGIELLAHALOPHILA耐鹽生理及分子生物學(xué)簽礎(chǔ)研究鹽脅迫下NAK離子在鹽芥、擬南芥中變化趨勢(shì)不同。相同鹽度下擬南芥K離子含量的降低幅度要比鹽芥大。鹽芥根中NA含量隨著鹽濃度的升高變化并不大而擬南芥根中NA含量一直隨鹽濃度的升高而升高。擬南芥比鹽芥積累更多的脯氨酸和可溶性糖,滲透勢(shì)降低幅度大于鹽芥,可能50300MMOLLNACL沒(méi)有對(duì)鹽芥造成明顯的滲透脅迫。鹽脅迫下鹽芥葉中MDA含量幾乎不變,而擬南芥MDA含量隨鹽濃度的升高明顯增加。研究結(jié)果表明鹽芥耐鹽性遠(yuǎn)高于擬南芥。3鹽芥THPSCS基因克隆及在脅迫條件下的表達(dá)分析利用EST隨機(jī)挑取克隆測(cè)序的策略從鹽芥葉片CDNA文庫(kù)分離得到編碼鹽芥0一二氫毗咯一5狡酸合成酶基因的部分。DNA序列。該CDNA片段長(zhǎng)約824BP,它編碼‘一二氫毗咯一5梭酸合成酶近C一端的154個(gè)氨基酸。BLAST同源性分析表明,該CDNA與已報(bào)道的擬南芥P5CS基因同源性最高。NORTHEM分析表明NACLABA、低溫、PEG均誘導(dǎo)P5CS基因的表達(dá),而且P5CS基因的表達(dá)具有組織特異性和發(fā)育階段特異性。4鹽芥THTRXHTHGOLS和THSOS3基因克隆及功能分析利用EST隨機(jī)挑取克隆測(cè)序的策略從鹽芥葉片CDNA文庫(kù)分別分離得到編碼鹽芥硫氧還蛋白HTHTRXH、肌醇半乳搪昔合酶THGOLS、鈣感應(yīng)蛋白THSOS3的全長(zhǎng)CDNA序列。鹽芥硫氧還蛋白HCDNA序列全長(zhǎng)663BP,編碼118個(gè)氨基酸殘基,分子量約129KDA。存在保守的活性中心序列“WCPGPC“ONORTHEM分析表明鹽芥THTRXH基因表達(dá)受NACLABAPEG誘導(dǎo),不受低溫誘導(dǎo),也沒(méi)有組織特異性。THTRXHGST融合蛋白體外表達(dá)及活性實(shí)驗(yàn)表明,鹽芥硫氧還蛋白H的確具有H型的活性,最大反應(yīng)速度VMAX為。0254A650MIRIKM值為。437PMOVL。同時(shí)THTRXH也在擬南芥中過(guò)量表達(dá),并得到轉(zhuǎn)基因株系。肌醇半乳糖昔合酶THGOLSCDNA序列全長(zhǎng)1322BP,編碼337個(gè)氨基酸殘基。與其它物種來(lái)源的肌醉半乳糖昔合酶具有較高的氨基酸序列相似性。ABANACL均誘導(dǎo)了肌醇半乳糖昔合酶基因在葉中表達(dá)在根中的表達(dá)與葉不同,明顯受ABA誘導(dǎo),而NACL的誘導(dǎo)作用非常微弱PEG、低溫既能上調(diào)葉中THGOLS的表達(dá),又能誘導(dǎo)根中THGOLS的表達(dá),說(shuō)明肌醇半乳糖昔合酶的表達(dá)存在組織差異和脅迫誘導(dǎo)的差異。肌醇半乳糖合酶基因THGOLS在擬南芥中過(guò)量表達(dá)提高了轉(zhuǎn)基因擬南芥種子在含NACL、甘露醇培養(yǎng)基上的萌發(fā)率,根的相對(duì)伸長(zhǎng)率以及對(duì)LICL的耐受能力也明顯好于野生型擬南芥。在幼苗生長(zhǎng)階段轉(zhuǎn)基因植株鮮重、干重均高于野生型,尤其是在NACL脅迫下其干物質(zhì)積累明顯較野生型增多。經(jīng)NACL處理的野生型和轉(zhuǎn)基因擬南芥其凈光合速率PN、氣孔導(dǎo)度CI和胞間C伍濃度均降低,但轉(zhuǎn)基因株系光合速率、氣孔導(dǎo)度、胞間C02濃度仍高于野生型擬南芥。野生型擬南芥的氣孔導(dǎo)度對(duì)NACI的反應(yīng)也較轉(zhuǎn)基因株系敏感。山東師范大學(xué)博士學(xué)位論文
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簡(jiǎn)介:分類號(hào)UDC密級(jí)學(xué)位論文ANODONTAUNIONIDAEANDHYRIOPSISUNIONIDAEBASED..0NMORDNOLOGVANDMOLECULARPHOLOGENYOOOOOOOOOO_____■NURN■ZIO一指導(dǎo)教師姓名匭田迦數(shù)援直昌太堂生金抖堂堂陵.,申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別亟±專業(yè)名稱麴物堂論文提交日期窒QQ魚生壘旦論文答辯日期窒QQ魚生魚旦魚目學(xué)位授予單位和日期直昌太堂壟QQ魚生旦旦答辯委員會(huì)主席評(píng)閱人2006年6月日ABSTRACTSHELLMORPHOLOGICALPARAMETERSOFANODONTAEIGHTPOPULATIONS,A.ARCAEFORMIS,A,WOODIANAWOODIANA,A.WOODIANAPISCATORUM,AWOODIANAELLIPTICA,A.MINGORUM,A.CASTANEA,A.1UCIDA,彳.SP.WHICHWASCOLLECTEDINJIANGXIANDHUBEIPROVIENCES,WEREMEASUREDANDANALYSEDBYUSINGCLUSTERANALYSIS,PRINCIPALCOMPONENTANALYSISANDDISCRIMINANTANALYSIS.MEANWHILE,NUCLEOTIDESEQUENCESOFTHEMITOCHONDRIAL16SRRNAPARTIALGENEOFSEVENPOPULATIONSANDRDNAITS1GENEOFSIXPOPULATIONSOFGENUSANODONTAUNIONIDAEWEREMEASURED.ALSO,NUCLEOTIDESEQUENCESOFRDNAITS1GENETWOPOPULATIONSOFHYRIOPSISUNIONIDAEWEREOBTAINED.ACCORDINGTOTHOSEDATA,ANEXAMINATIONOFTAXONOMICSTATUSOFANODONTAANDHYRIOPSISSPECIESWASMADE.THERESULTSAREBELOW1THEPHYLOGENETICTREESBASEDONNUCLEOTIDESEQUENCESOFTHEMITOCHONDRIAL16SRRNAPARTIALGENEANDNUCLEARITSI1GENEOFSEVENPOPULATIONSOFANODONTASUGGESTTHATTHESEPOPULATIONSSHOULDBEDIVIDEDINTODISTINCTTWOGROUPSONEGROUPINCLUDINGA.SP.MADA.ARCAEFORMIS,WHICHISAPRIMARYGROUP;ANOTHERONEINCLUDINGA.CASTANEA,A.WOODIANAPISCATORUM,A.WOODIANAWOODIANA,A.WOODIANAELLIPTICA,AMINGORUM,WHICHISTHELATESTDIVIDEDGROUP.2THESHELLMORPHOLOGICALCHARACTERSANDTHEMOLECULARPHYLOGENETICDATAREVEALTHATA.CASTANEA,A.WOODIANAPISCATORUM,A¨
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簡(jiǎn)介:中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)博士學(xué)位論文煙粉虱寄主植物、生物學(xué)特性及分子系統(tǒng)學(xué)研究姓名羅晨申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別博士專業(yè)昆蟲學(xué)指導(dǎo)教師胡敦孝張芝利200251,7的分子證據(jù)。4四、本研究設(shè)計(jì)合成了新引物2819的引物,成功應(yīng)用于PCR。利用MTDNACOL基因片段作標(biāo)記,研究了我國(guó)17個(gè)不同地理區(qū)域或寄主的煙粉虱種群。F17個(gè)煙粉虱種群只表現(xiàn)為2種單元型HAPLOTYPE,除采自福建甘薯上煙粉虱為另一單元型外CH.FJ,其余16個(gè)煙粉虱種群的基因序列在所有對(duì)應(yīng)的位點(diǎn)上是完全一樣的為B型煙粉虱。初步明確了我國(guó)B型煙粉虱的分布情況。。、五、對(duì)煙粉虱的分子系統(tǒng)學(xué)的研究結(jié)果表明在截取的這段序列中,煙粉虱不同種群間的遺傳距離從0.25%到26.65%。B型與蘇丹種群靠近,遺傳距離為5.39%,與其它種群的煙粉虱遺傳距離較大12%;中國(guó)福建本地種群CHFJ與印度種群遺傳距離較近為6.7L%;中國(guó)另一種群HCCHINA與泰國(guó)種群遺傳距離較近為0.77%;貝寧種群與其它種群的遺傳距離差異最大為19.51%到26.65%。從分子系統(tǒng)樹(shù)可看出B型煙粉虱與也門種群為同一進(jìn)化枝中國(guó)福建本地種群與印度種群為同一進(jìn)化枝,西班牙和蘇丹的煙粉虱種群為同一進(jìn)化枝北美種群為同一進(jìn)化枝;中國(guó)的另一種群與泰國(guó)、巴基斯坦種群為同一進(jìn)化枝,貝寧煙粉虱種群位于樹(shù)的根部。B型煙粉虱種群與西班牙和蘇丹的煙粉虱親緣關(guān)系較近。其次是印度、中國(guó)福建種群,與北美種群和中國(guó)的另一種群泰鼠、巴基斯坦種群親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。這為B型煙粉虱是入侵生物型提供了直接的分子證據(jù)。7。關(guān)鍵詞煙粉虱;寄主植物;生物學(xué)特性;PCR;線粒體DNACOL基因序列;生物型;系統(tǒng)發(fā)育
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簡(jiǎn)介:中國(guó)海洋大學(xué)博士學(xué)位論文文昌魚分子生物學(xué)AMPHIHMGB、AMPHIUBF80和AMPHIPRXV基因克隆、表達(dá)與進(jìn)化研究姓名劉振輝申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別博士專業(yè)海洋生物學(xué)指導(dǎo)教師張士璀200361摘要代表了脊椎動(dòng)物HMGBI、HMGB2和HM683基因分化前的一種前體基因型。通過(guò)對(duì)UBIQUITIN的系統(tǒng)進(jìn)化分析,發(fā)現(xiàn)文昌魚UBF80除了具有脊椎動(dòng)物和無(wú)脊椎動(dòng)物的特征外,還具有自己的一些獨(dú)特的特征,從分予水平上支持了文昌魚是脊索動(dòng)物進(jìn)化過(guò)程中的一側(cè)枝的觀點(diǎn)。發(fā)現(xiàn)文昌魚AMPHIPRXV基因是具有線粒體和過(guò)氧化物酶體信號(hào)特征MITOCHONDRIALANDPEROXISOMALSORTINGSIGNALS的抗氧化物酶基因通過(guò)序列比對(duì),我們把PRXV歸為1一CYS和2一CYS之外的3一CYS類,從而把PRX基因家族的兩種分類方法統(tǒng)一了起來(lái)。通過(guò)NORTHERNBLOT、DOTBLOT和原位雜交等技術(shù),研究了文昌魚月J】,口IHMGB基因的表達(dá)圖式。NORTHERNBLOT和DOTBLOT雜交顯示該基因在成體不同組織中表達(dá)差異性很大卵巢表達(dá)最強(qiáng),腸次之。而在肌肉、脊索和精巢中未檢測(cè)到雜交信號(hào);在胚胎發(fā)育的不同時(shí)期表達(dá)也存在差異卵裂期、囊胚期和原腸胚期表達(dá)較強(qiáng)。而在神經(jīng)胚期和1天幼蟲期表達(dá)減弱。原位雜交分析表明從受精卵到神經(jīng)胚,AMPHIHMGB基因廣泛表達(dá),但隨著發(fā)育的進(jìn)行,中胚層、內(nèi)胚層和神經(jīng)管的表達(dá)減弱,到L天幼蟲期,僅在表皮可檢測(cè)到表達(dá)。AMPHIHMGB轉(zhuǎn)錄子在胚胎發(fā)育早期的豐富存在表明AMPHIHMGB可能在文昌魚胚胎的有絲分裂中發(fā)揮重要的作用。關(guān)鍵詞青島文昌魚,AMPHIHMGB,AMPHIUBFSO,AMPHIPRXV基因克隆,系統(tǒng)進(jìn)化分析,表達(dá)圖式
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簡(jiǎn)介:山東大學(xué)博士學(xué)位論文乳脂乳球菌W56抗噬菌體機(jī)制的分子生物學(xué)研究姓名孔健申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別博士專業(yè)微生物學(xué)指導(dǎo)教師馬桂榮2001510山東大學(xué)博士論文乳脂乳球菌W56抗噬菌體機(jī)制的分子生物學(xué)研究和PJW566攜帶有三種不同的R/M系統(tǒng),分別定義為L(zhǎng)IABI,LLABLL和LLABILL。正是因?yàn)榫闘LACTISSUBSP.CREMORISW56三種不同的抗性機(jī)制之間的相互協(xié)同作用,逃脫一種限制的噬菌體而被另一種抗性機(jī)制所切割,所以£.1ACTISW56在乳酪生產(chǎn)中表現(xiàn)出較強(qiáng)的抗噬菌體特性。這種一個(gè)菌株內(nèi)同時(shí)含有三種不同R/M系統(tǒng)的現(xiàn)象。在乳酸菌中未見(jiàn)報(bào)道。J/本論文主要研究質(zhì)粒PJW566編碼的LLABIIIR/IVL系統(tǒng)。在含有新生霉素的梯度平板上消除MARKER質(zhì)粒PSV2,得到只含有質(zhì)粒PJW566的菌株MGL614PYW5661。經(jīng)過(guò)不同限制性內(nèi)切酶的切割和連接,繪制了質(zhì)粒PJW566內(nèi)切酶圖譜,其中質(zhì)粒PJW566上具有唯一的印PI,印HL,NSIL及SACI的酶切位點(diǎn),含有7個(gè)C口I酶切位點(diǎn)。/4用限制性內(nèi)切酶CLAI將質(zhì)粒PJW566DNA不完全消化,所得片段與來(lái)自手質(zhì)粒PVC5的氯霉素抗性基因連接,得到一個(gè)攜帶有完整LIABIIIRIM基因的質(zhì)粒PJKL,約15.25KB。在質(zhì)粒PJKL中切除約1KB的HINDLII脅一疥II片段,得到質(zhì)粒PJK7,含有PJK7的菌株同時(shí)失去了對(duì)噬菌體的限制和修飾作用,表明HINDLII.HINDLLI片段對(duì)LLABIII基因是必須的。質(zhì)粒PJW566經(jīng)NSIL和SACI雙酶切割,所得片段與來(lái)自于質(zhì)粒PSJL327的氯霉素抗性基因連接,得到質(zhì)粒PJK2,含有該質(zhì)粒的菌株MGL614PJK2】具有與MGL614PJKL相同的限制和修飾作用,但生長(zhǎng)緩慢。經(jīng)進(jìn)一步基因亞克隆分析,發(fā)現(xiàn)LLABIII基因位于約5KB的SPHIHINDIIDNA片段上。利用WALKINGPRIMER方法完成了整個(gè)L/ABIII基因的核苷酸序列測(cè)定。序列分析表明該片段包含一個(gè)4572BP的開(kāi)放閱讀框架ORF,編碼一個(gè)
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簡(jiǎn)介:上海第二醫(yī)科大學(xué)博士學(xué)位論文神經(jīng)元突觸成份轉(zhuǎn)運(yùn)的分子和細(xì)胞生物學(xué)機(jī)制研究姓名蔡倩申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別博士專業(yè)神經(jīng)生物學(xué)指導(dǎo)教師盛祖杭20050501在本論文工作巾,我們還進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)SYNTABULIN在神經(jīng)元線粒體順行軸漿運(yùn)輸過(guò)程中所發(fā)揮的另一個(gè)重要作用。SYNTABULIN屬外周膜相關(guān)蛋白,通過(guò)它的羧基末端尾部區(qū)域定位至線粒體。采用實(shí)時(shí)活細(xì)胞影像學(xué)技術(shù),可見(jiàn)神經(jīng)元中相當(dāng)數(shù)量的SYNTABULIN與線粒體肓共定位,并能夠沿神經(jīng)元突起共同移動(dòng)。弘SYNTABULIN特異性SIRNA抑制內(nèi)源性SYNTABULIN的表達(dá)或干擾SYNTABULIN與KINESINL重鏈間的相互作用可削弱線粒體在神經(jīng)元軸突中的順行運(yùn)輸,進(jìn)而降低了線粒體在其中的正常分布密度。結(jié)果提示,SYNTABUFIN作為一個(gè)連接分子還能夠?qū)⒕€粒體細(xì)胞器附著在以微管細(xì)胞骨架為基礎(chǔ)的馬達(dá)分子KINESINI上,并參與線粒體在神經(jīng)元的順行軸漿運(yùn)輸過(guò)程。已有報(bào)道,KINESINL作為一個(gè)候選馬達(dá)蛋白分子,同時(shí)參與了神經(jīng)元中SNAP25、SYNAPSINL、谷氨酸受體GLUR2、GAP43和線粒體等各種不同類型突觸成份在軸突和樹(shù)突中的運(yùn)輸過(guò)程。隨著對(duì)SYNTABULIN與KINESINI重鏈羧基末端尾部序列問(wèn)直接相互作用的闡明,為深入研究與SYNTABULIN和KINESINI相互作用有關(guān)的軸漿運(yùn)輸過(guò)程提供了一個(gè)重要線索。綜上所述,SYNTABULIN作為一個(gè)連接分子或是接合體復(fù)合物中的一個(gè)重要組成部分,參與神經(jīng)元中KINESINI所介導(dǎo)的多種物質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)通路,如SYNTAXIN和線粒體細(xì)胞器沿神經(jīng)元突起的順行軸漿運(yùn)輸過(guò)程。該研究為進(jìn)一步研究和理解與神經(jīng)元其它重要突觸成份轉(zhuǎn)運(yùn)相關(guān)的分子和細(xì)胞學(xué)機(jī)制以及某些神經(jīng)退行性疾病的發(fā)病機(jī)制提供了新思路。國(guó)際項(xiàng)尖權(quán)威雜志“自然細(xì)胞生物學(xué)2004年第10期發(fā)表的新聞專題評(píng)論認(rèn)為,此項(xiàng)研究成果是神經(jīng)生物學(xué)領(lǐng)域的一項(xiàng)重大突破。關(guān)鍵詞SYNTAXIN,線粒體,KINESINI,微管,馬達(dá)蛋白。順行軸漿運(yùn)輸,膜轉(zhuǎn)運(yùn)
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簡(jiǎn)介:廈門大學(xué)碩士學(xué)位論文杜氏藻RAPD分析及耐鹽分子生物學(xué)初探姓名林慧馨申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別碩士專業(yè)生物化學(xué)與分子生物學(xué)指導(dǎo)教師劉廣發(fā)200081前言一RAPD技術(shù)及其應(yīng)用隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNARANDOMAMPLMEDPOLYMORPHICDNARAPD技術(shù)是1990年由美國(guó)杜邦公司的科學(xué)家JGKWILLIAMS11和加利福尼亞生物研究所JWELSH領(lǐng)導(dǎo)的兩個(gè)小組幾乎同時(shí)發(fā)展起來(lái)的。其核心技術(shù)是利用隨機(jī)寡聚單引物在整個(gè)基因組中尋找結(jié)合位點(diǎn),進(jìn)行PCR擴(kuò)增。它的優(yōu)點(diǎn)可概括為1克服了PCR技術(shù)的局限性。PCR技術(shù)的雙引物必須與模板的已知某一區(qū)段的保守序列互補(bǔ),而且擴(kuò)增出的DNA多態(tài)性有時(shí)難以滿足某一物種某一水平的系統(tǒng)學(xué)分析;RAPD技術(shù)無(wú)需模板DNA的任何序列信息,商品化的系列引物可以擴(kuò)增出足夠量的DNA多態(tài)性,可滿足種及種以下分類單位的進(jìn)化分析;2速度快,成本低。RAPD無(wú)需象RFLP那樣要對(duì)DNA提取物進(jìn)行酶切因而短時(shí)間內(nèi)可分析大量樣品3多態(tài)性靈敏度高,可檢測(cè)到單個(gè)核苷酸的置換。4RAPD引物沒(méi)有嚴(yán)格的種屬界限,同一套R(shí)APD引物可以應(yīng)用于任何一種生物的研究,具有廣泛性、通用性。由于這些優(yōu)點(diǎn),RAPD在分子生物學(xué)上的應(yīng)用十分廣泛,如種屬特異性的鑒定、外源導(dǎo)入基因的追蹤、遺傳作圖、鑒定染色體上特異的DNA片段、進(jìn)行基因定位和基因分離等。目前國(guó)內(nèi)RAPD技術(shù)主要是應(yīng)用于物種系統(tǒng)學(xué)研究。大量的研究表明RAPD技術(shù)對(duì)于種內(nèi)、種間乃至屬問(wèn)物種的分類學(xué)研究都有很高的學(xué)術(shù)價(jià)值12”。二植物耐鹽生物學(xué)研究進(jìn)展幾十年來(lái),科學(xué)家們已在植物的整體植株、組織培養(yǎng)和基因工程三個(gè)層次對(duì)植物的耐鹽機(jī)理及培育耐鹽植物進(jìn)行過(guò)研究。在整體植株層次,人們的研究對(duì)象十分廣泛,如原核生物的藍(lán)藻,真核生物的小球藻、杜氏藻、硅藻、海帶、紫菜等藻類,水蕨、紅萍等蕨類,馬尾松等裸子植物以及大量的被子植物,尤其是農(nóng)作物,如水稻、小麥、大麥、玉米、高粱、馬鈴薯等糧食作物;蘋果、梨、柚、香蕉、葡萄、柑橘等果樹(shù);花生、豌豆、大豆、綠豆、蠶豆、三葉草、苜蓿等豆科植物;菠菜、黃瓜、洋蔥、番茄、萵苣、大蒜等蔬菜棉花、煙草、甘蔗、甜菜、向日葵等經(jīng)濟(jì)作物。經(jīng)粗略統(tǒng)計(jì),從整體植株層次上進(jìn)行過(guò)抗鹽機(jī)理研究的物種已超過(guò)130種。這些研究探討了鹽主要是NACD對(duì)植物直接和間接的傷害途徑與機(jī)制,植2一
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簡(jiǎn)介:浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文幾種天然抗氧化劑對(duì)DNA的保護(hù)作用及其分子放射生物學(xué)機(jī)制的研究姓名徐兵申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別碩士專業(yè)生物物理學(xué)指導(dǎo)教師趙玉芳200151廣L摘要佛為生物遺傳信息貯存的中心DNA,控制著細(xì)胞的增殖與分化,其童妻性對(duì)生物體是不言而喻的。然而多種理化因素都能造成DNA的損傷,尤以自由基所導(dǎo)致的損傷最為普遍、嚴(yán)重。因此,尋找能清除自由基從而對(duì)DNA損傷有保護(hù)作用的物質(zhì)特別是功能植物材料天然抗氧化劑,具有重要的意義。D7本文主要以茶多酚、銀杏提取物、竹葉提取物等幾種天然抗氧化劑為研究材料,通過(guò)超微弱化學(xué)發(fā)光分析和熒光光度分析等實(shí)驗(yàn)手段,對(duì)”COY輻照和CUS0曠_PHEN_VCH202DNA體系中的OH‘所致DNA損傷的保護(hù)作用作了比較系統(tǒng)的研究,獲得了一些新的結(jié)果。F結(jié)果表明\1茶多酚、銀杏提取物、竹葉提取物均具有清除OH’、02一‘自由基的作用。以茶多酚清除OH的能力最強(qiáng),其ICSO為1049MG/MH銀杏提取物次之,IC50為1433MG/MH竹葉相對(duì)最弱,IC50為1554MG/ML。清除02~’能力也以茶多酚為最強(qiáng),其IC50為3079UG/M1銀杏提取物次之,為3425UG/ML;竹葉提取物最弱,為3593UG/ML。2茶多酚、銀杏提取物和竹葉提取物濃度的增加對(duì)EBDNA體系的熒光強(qiáng)度的抑制率也升高,且有線性關(guān)系;濃度為125MG/ML的茶多酚熒光強(qiáng)度抑制率約為O902,同一濃度的銀杏提取物抑制率約為O821,竹葉提取物約為O814。熒光強(qiáng)度抑制率為50%的三種抗氧化劑的濃度較為接近,均約為05MG/ML。結(jié)果表明三種抗氧化劑與DNA相互作用關(guān)系均相類似。茶多酚、銀杏提取物、竹葉提取物的熒光抑制率隨濃度的變化有線性關(guān)系,不存在飽和性,且抑制率可達(dá)95%以上。而多糖的熒光抑制率具有飽和性,且抑制率相對(duì)很低,螺旋藻多糖、海藻多糖L、海藻多糖2對(duì)熒光強(qiáng)度的飽和抑制率分別為0166,O261,O326。表明此兩類物質(zhì)與EBDNA體系的DNA有不同的作用機(jī)制模式。
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簡(jiǎn)介:浙江大學(xué)博士學(xué)位論文番茄乙烯受體基因LEETR1和LEETR2的分子生物學(xué)研究姓名鄭鐵松申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別博士專業(yè)食品科學(xué)指導(dǎo)教師何國(guó)慶應(yīng)鐵進(jìn)200151適分化培養(yǎng)基上附加的激素分別為BA25MG/LIAAL0MG/L、BA20MG/LIAA02MG/L、BA25MG/LIAA04MG/L、BA20MG/LIAA04MG/L、BA25MG/LIAA04MG/L在最適培養(yǎng)基上它們的芽分化頻率分別為924%、885%、916%、892%和941%。5外植體尤其是下胚軸外植體的放置方式對(duì)分化頻率有明顯的影響。采用下胚軸作外植體時(shí),一定要正向放置否則苗再生的頻率會(huì)嚴(yán)重下降。6番茄品種9551,T9253、ESTRELLA、9209和BL對(duì)卡那霉素KM的敏感I性不同。9551、T9253、ESTRELLA和9209在附加25MG/LKM的培養(yǎng)基上其分化即完全受抑制,而抑制番茄B1的再生則需要附加100MG/LKIN。7以中間表達(dá)載體PPZPLLLA為基礎(chǔ)。以克隆的乙烯受體基因LEETRL和LEETR2的特異序列為目的插入DNA,構(gòu)建了反義表達(dá)載體PPZPEL和PPZPE2。通過(guò)PCR和酶切驗(yàn)證表明LEETRL和LEETR2的反義表達(dá)載體已經(jīng)構(gòu)建成功,并已轉(zhuǎn)入農(nóng)桿菌中。為下一步的番茄轉(zhuǎn)基因研究奠定了基礎(chǔ)。8以79日齡的番茄BL無(wú)菌苗子葉為外植體,根癌農(nóng)桿菌LBA4404PPZPEL、LBA4404PPZPE2、EHAL05PPZPEL和EHAL05∞PZPE2為介導(dǎo)。采用葉盤轉(zhuǎn)化法進(jìn)行了反義LEETRI和反義LEETR2的遺傳轉(zhuǎn)化研究。在篩選壓力為KM100MG/L的分化培養(yǎng)基和篩選壓力為KM50MG/L的生根培養(yǎng)基上,2種反義轉(zhuǎn)基因番茄各獲得了O82%和091%的陽(yáng)性轉(zhuǎn)化苗再生頻率通過(guò)PCR和SOUTLLEMBLOT的結(jié)果證明已經(jīng)獲得了反義LEETRL和反義LEETR2的轉(zhuǎn)基因番茄植株。親代的轉(zhuǎn)基因番茄目前在溫室中生長(zhǎng)良好。同時(shí)在進(jìn)行遺傳轉(zhuǎn)化的過(guò)程中我們也對(duì)農(nóng)桿菌的類型、農(nóng)桿菌的浸染方式、共培養(yǎng)及預(yù)培養(yǎng)時(shí)間等多種因素對(duì)轉(zhuǎn)化效率的影響進(jìn)行了研究。證明LBA4404和EHAL05都可有效地進(jìn)行番茄的遺傳轉(zhuǎn)化9對(duì)親代轉(zhuǎn)基因番茄生長(zhǎng)特性的初步研究表明,兩種轉(zhuǎn)化植株都表現(xiàn)出了一定的抗衰老特性,但初步觀察其結(jié)果率低于未轉(zhuǎn)化番茄。轉(zhuǎn)化番茄與對(duì)照相比在生長(zhǎng)特性上的這些差異。預(yù)示著乙烯受體基因LETRI和LETR2與番茄的葉片生長(zhǎng)和果實(shí)發(fā)育過(guò)程相關(guān),這一結(jié)果與我們前面對(duì)LEETRLMRNA和LEETR2MRNA表達(dá)特性的研究結(jié)果相吻合。提示與誘導(dǎo)型的乙烯受體LEETR3NR不同LEETRL和LEETR2作為組成型的乙烯受體主要傳遞乙烯對(duì)番茄基本發(fā)育過(guò)程的調(diào)節(jié)信號(hào)。獲得的反義轉(zhuǎn)化番茄植株為后續(xù)研究提供了寶貴的實(shí)驗(yàn)材料。廠。關(guān)鍵詞番茄乙烯受體LEETRLLEETR2反義基因遺傳轉(zhuǎn)化
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簡(jiǎn)介:山東師范大學(xué)碩士學(xué)位論文膠州灣細(xì)菌多樣性及抗性細(xì)菌種類及其抗性基因的分子生物學(xué)研究姓名任晶申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別碩士專業(yè)細(xì)胞生物學(xué)指導(dǎo)教師安利國(guó)宋林生20060501山東師范大學(xué)碩士學(xué)位論文摘要我們利用DAPI染色熒光顯微鏡技術(shù)和微生物培養(yǎng)的方法分析2004年9月和10月兩個(gè)月份膠州灣海水樣品中的總微生物和可培養(yǎng)細(xì)菌的數(shù)量和分布特征。DAPI染色熒光的計(jì)數(shù)結(jié)果顯示總微生物數(shù)量為106_107CELLS/ML,與世界上其它位于溫帶地區(qū)的半封閉性海灣微生物數(shù)量的研究結(jié)果相似。其中微生物密度最高10V/M1的區(qū)域分布于膠州灣東北部婁山河和李村河河口及紅島漁業(yè)養(yǎng)殖區(qū)附近。這些區(qū)域的可培養(yǎng)細(xì)菌密度在整個(gè)膠州灣中也是最高,最高的站位AS站,李村河口附近達(dá)到5.1610S/ML。因此,污染類型和程度以及地理和水文學(xué)特征是決定膠十T,I灣微生物數(shù)量和分布的重要因素。通過(guò)TRFLF分子生物學(xué)方法和聚類分析方法研究膠州灣水體的微生物群落結(jié)構(gòu)特征,可將膠州灣內(nèi)外的細(xì)菌群落分為3組,膠州灣灣口及灣外的D1,D3,D5,D6,D7站位被劃分為一組,其細(xì)菌群落更接近于受到灣外海水環(huán)境影響的細(xì)菌群落特征;位于膠州灣最內(nèi)側(cè)的站位,如A3,A5,B2,Y1被劃為一組,代表膠州灣的“土著”細(xì)菌群落;C1,C3,C4站位則代表著介于二者之間的過(guò)渡性細(xì)菌群落。而同時(shí)進(jìn)行的膠州灣光合細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的TRFLP分析未見(jiàn)其與地理分布和環(huán)境有明顯相關(guān)關(guān)系??剐约?xì)菌的分布和數(shù)量主要受到水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)中抗生素的使用,以及生活和工業(yè)污水排放狀況的影響,是自然水體環(huán)境的重要水質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)之一。對(duì)自然水體中的抗性細(xì)菌及其抗性基因的研究不僅對(duì)漁業(yè)養(yǎng)殖具有重要的意義而且還直接關(guān)系到人類的公共衛(wèi)生健康。膠州灣土霉素和氯霉素抗性細(xì)菌密度最高的區(qū)域均位于A5站,李村河口附近,說(shuō)明環(huán)境是影響和決定抗性細(xì)菌分布和數(shù)量的重要因素。通過(guò)對(duì)抗性細(xì)菌16SRDNA序列分析和系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)的構(gòu)建,膠州灣內(nèi)的大部分抗生素抗性細(xì)菌屬于Y一蛋白菌亞綱7PROTEOBACTERIA,其中氯霉素抗性細(xì)菌則表現(xiàn)出非常明顯的假單胞菌屬PSEUDOMONASSP.細(xì)菌優(yōu)勢(shì)。多重PCR方法分析膠州灣抗性細(xì)菌中土霉素抗性基因.TET基因和氯霉素抗性基因.CAT基因的分布特征。在對(duì)84株土霉素抗性基因的分析中,所有六種TET基因型.TETA,TETB,TETC,TETD,TETE和TETG撼J被檢測(cè)到,其中含量最高的是TETA30.6%,TETB245%,和把TG36.7%。在對(duì)60株氯霉素抗性基因的分析中,僅有12株氯霉素抗性細(xì)菌被檢測(cè)到攜帶有C口崖因,且只包括∞RI和CATIII型。但
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簡(jiǎn)介:⑨研究生學(xué)位論文利用分子生物學(xué)技術(shù)對(duì)偽角毛蟲屬及全列蟲屬纖毛蟲的分類學(xué)及系統(tǒng)學(xué)研究研究蝴但鎏夔㈣黜塞微波熬授申請(qǐng)學(xué)世級(jí)剮亟一專IB磣壅生生塑論_蚺阱日期鱉生魚且璺旦輔搬予日期窒Q籩笙墾且中11T海洋大學(xué)摘要鄰接NJ樹(shù)表明偽角毛蟲屬與全列蟲屬之間能很好地分開(kāi),而不同種群間表現(xiàn)了很好的同源性。3利用核糖體DNA限制性酶切片段長(zhǎng)度多態(tài)性PCRRFLP技術(shù),檢測(cè)了偽角毛蟲屬的多個(gè)形態(tài)相似種。各株系差異顯著的PCRRFLP指紋圖譜支持形態(tài)學(xué)對(duì)偽角毛蟲屬的區(qū)分和定義分析表明,PCRRFLP之多態(tài)性指紋圖譜作為纖毛蟲傳統(tǒng)形態(tài)分類學(xué)的輔助手段,可以有效地進(jìn)行種類區(qū)分。同時(shí),我們的研究表明,PCRRFLP有時(shí)可將種群區(qū)分開(kāi)。4利用單鏈構(gòu)象多態(tài)性PCRSSCP技術(shù),檢測(cè)了偽角毛蟲屬PSEUDOKERONOPSIS四個(gè)形態(tài)相似種的六個(gè)種群。實(shí)驗(yàn)證明,ITSL基因的PCRSSCP圖譜可以很好地用于偽角毛蟲屬形態(tài)相似種的種間及種群區(qū)分。5首次測(cè)定了四種五種群偽角毛蟲的ITSI58SITS2基因全序列,長(zhǎng)度均為480BP左右;同時(shí)測(cè)定了四種偽角毛蟲SSRRNA基因全序列,長(zhǎng)度約為1770BP;利用幾種序列構(gòu)建的UPGMA系統(tǒng)樹(shù)均表明肉色偽角毛蟲與黃色偽角毛蟲親緣關(guān)系較近,而青島偽角毛蟲與偽角毛蟲未定種親緣關(guān)系較近。二、系統(tǒng)學(xué)本工作首次測(cè)定了柔弱全列蟲,以及在形態(tài)上十分特殊的的青島偽角毛蟲的SSRRNA基因全序列,以PHYUP軟件中的鄰接法構(gòu)建了系統(tǒng)關(guān)系樹(shù),以PAUP軟件構(gòu)建了最大簡(jiǎn)約樹(shù),以MRBAYES軟件構(gòu)建了最大似然樹(shù)。通過(guò)比較和分析幾種系統(tǒng)關(guān)系樹(shù)中各分類階元間的進(jìn)化關(guān)系,表明全列蟲屬、偽角毛蟲屬極可能均非單系發(fā)生,同時(shí)本研究從分子生物學(xué)角度支持了二者之間較近的親緣關(guān)系三、系統(tǒng)扭F構(gòu)建以纖毛蟲動(dòng)物中的幾個(gè)屬的部分SSRRNA基因?yàn)檠芯繉?duì)象,初步探討了不同外類群、內(nèi)類群的選擇,有無(wú)外類群,同一基因不同長(zhǎng)度,不同構(gòu)樹(shù)方法及不同分析軟件對(duì)構(gòu)建基因樹(shù)的影響R,、,關(guān)鍵詞分類學(xué),系統(tǒng)發(fā)生,分子標(biāo)記,全列蟲屬,偽角毛蟲屬,纖毛蟲,●’’2
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上傳時(shí)間:2024-03-02
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